シビル線記法

属性（括弧で囲まれた文字列で、追加データを含む）[key1=value1, key2...]は、SLNのコア機能です。属性は原子と結合に適用できます。公式に定義されていない属性は、ユーザーが独自の拡張機能を作成するために使用できます。

分子を検索する際には、通常の等号の代わりに、などの比較演算子を使用できます。キー/値グループの前に を付けると、比較結果が反転します。fcharge>-0.125!

分子全体や反応にも属性を持たせることができます。角括弧は2つの記号に置き換えられます。<>

大文字で始まるものはすべてSLN中の原子を表します。水素は自動的に追加されませんが、有機化合物の場合、水素との単結合は省略可能で、メタンのCH4場合は の代わりに となります。著者は、水素を明示的に指定することで、より堅牢な解析が可能になると主張しています。C(H)(H)(H)H

原子に定義されている属性には、I=同位体質量数、charge=形式電荷、fcharge部分電荷、s=立体化学、およびspin=ラジカル（s一重項d、二重項、三重項tそれぞれについて、、）が含まれます。 の形式電荷は、と略記でき、負電荷の場合はその逆です。また、は、−1 または +1 の電荷として認識されます。は、の略記です。 原子の立体化学は、ほとんどが四面体であり、/および/などが利用可能です。これは明示的（）または相対的（）にすることも、この原子での立体異性体の混合物（）を指定することもできます。SMILES のおよびに相当する、通常/反転（/ ）表記が提供されています。検索用に多くの追加属性が提供されています。charge=2+2-+*spin=dRSDLERMNI@@@

SLNは、基本原子に加えて、ワイルドカード原子Any（任意の原子に一致）、およびHev（任意の重原子に一致）の指定をサポートしています。また、組み合わせライブラリとRGROUPクエリを指定するための豊富なMarkush構文も備えています。SLNには、原子グループに一致するためのクエリ原子タイプがいくつかあります。各タイプは、グループ名に続いてオプションの正の整数を持ちます。

「0」質量数は通常の同位体を表し、^14NN[I=0]と一致N[I=14]し、他のすべての同位体と一致します。N[!I=0]

SLN は、SMILESとほぼ同じ結合表記を使用し、-単結合、二重結合、三重結合、芳香族結合には、、、、、、を使用します。は=、反応 SMILES と同様にゼロ次結合に使用されますが、異なる分子には、が推奨されます。#:.+

ほとんどの単結合は暗黙的に示されるため、エタンの場合、CH3CH3(CH ₃ CH ₃CH3-CH3 ) の代わりに(CH ₃ –CH ₃ )を使用できます。明示的な単結合は、3中心結合に役立ちます。

このs=属性は二重結合に対して定義され、E – Z ( E/ Z) またはcis – trans ( c/ t) 表記で立体化学情報を伝えるために使用されます。N/Iは使用可能で、「主鎖」を表し、互いにトランスまたはシスの関係にあります。

SLN は SMILES よりも明示的なパターンで環を記述し、ベンゼンは と指定されますC[1]H:CH:CH:CH:CH:CH:@1。原子は単一の数値属性で環上のアンカーとしてタグ付けされ、@1その後、この (この場合は「番号 1」) 原子に結合するために使用できます。

SLN ブランチは SMILES ブランチと同一で、括弧で指定されています。プロピオン酸はCH3CH2C(=O)OH(${\displaystyle {\ce {\scriptstyle CH3CH2C(=O)OH}}}$)

SLNは、反応物と生成物を関連付けることで反応をサポートします。属性を使用することで、原子マッピングが可能になります。反応中心（rc）属性は結合に、キラル変換（cc）属性は原子に追加できます。->[#num]

複数の行は、各行の末尾にバックスラッシュ（/）を付けることで、構文的に1行にまとめることができます\。これにより、長い行を複数行に分割することが可能になり、例えば、各分子をそれぞれ別の行に記述する反応式などに利用できます。