RprA RNA

RprA RNA
RprA RNA
	RprAの予測される二次構造と配列の保存
識別子
シンボル	RprA
Rfam	RF00034
その他のデータ
RNAタイプ	遺伝子; sRNA
ドメイン	細菌
それで	0000387 ...
PDB構造	PDBe

RprA RNA遺伝子は106ヌクレオチドの調節性非コードRNAをコードしている。定常期シグマ因子RpoSの翻訳調節は、rpoSメッセンジャーRNAの上流領域に二本鎖RNAステムループ構造を形成し、翻訳開始部位を閉塞することによって行われる。^[1]^[2]

rprA (RpoS 調節因子 RNA A) を持つクローンは、RpoS の翻訳を増加させました。DsrAと同様に、RprA は 3 つのステムループを形成すると予測されます。したがって、少なくとも 2 つの小さな RNA、DsrA と RprA が、RpoS 翻訳の正の調節に関与しています。RprA は、RpoS リーダーにも結合するようです。^[3] RprA は必須ではありません。^[4] Wassermanらは、この RNA がHfq タンパク質に結合することを実証しました。^[5] Hfq に結合すると、RprA の構造が変化します。^{[6] Hfq が存在する場合、RprA の安定性は細胞の}浸透圧の影響を受け、これはエンドリボヌクレアーゼ RNase Eに依存します。^[7]

RprAは、 csgDと呼ばれるタンパク質コード遺伝子を制御することが示されています。このタンパク質は、定常期誘導バイオフィルム調節因子と、csgD転写の活性化に関与するジグアニル酸シクラーゼをコードするydaMをコードしています。これら2つの標的遺伝子はRprAによって抑制され、バイオフィルム形成の制御につながります。^[8]

参考文献

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外部リンク

Rfamの RprA RNA のページ
ncRNA データベースの RprA エントリ

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