ロバート・F・マーフィー（計算生物学者）

ボブ・マーフィー
母校	コロンビア大学（生化学学士） カリフォルニア工科大学（生化学博士）
科学者としてのキャリア
フィールド	計算生物学 機械学習
機関	カーネギーメロン大学 アルベルト・ルートヴィヒ大学フライブルク
博士課程の指導教員	ジェームズ・F・ボナー
Webサイト	www.andrew.cmu.edu/user/murphy/

ロバート・F・マーフィーは、カーネギーメロン大学のレイ＆ステファニー・レーン計算生物学名誉教授であり、同大学の自動化科学修士課程のディレクターです。2021年5月に退職する前は、レイ＆ステファニー・レーン計算生物学教授であり、生物科学、生体医工学、機械学習の教授でもありました。また、ジェレナ・コバチェビッチ^[1]とともにカーネギーメロン大学のバイオイメージ情報科学センターの初代ディレクターを務め、イベット・バハールとともにCMU-ピッツバーグ合同計算生物学博士課程を設立しました。さらに、カーネギーメロン大学の計算生物学部（当初はレーン計算生物学センター）を設立し、2009年から2020年まで部長を務めました。

カーネギーメロン大学に着任する前、マーフィーは1979年から1983年までコロンビア大学でチャールズ・R・カンター博士のもとでデイモン・ラニヨン癌研究財団のポスドク研究員を務めました。マーフィーは1974年にコロンビア大学で生化学の学士号を取得し、 1980年にはカリフォルニア工科大学で生化学の博士号を取得しました。1983年にカーネギーメロン大学の教授に加わって間もなく、国立科学財団から大統領若手研究者賞^{[2]を受賞しました。2005年には、NIHにより新設されたバイオデータ管理および分析研究セクションの初代常任議長に選出されました。 [3]} 2006年には、米国医学生物工学協会のフェローに任命されました。^[4] 2019年には、生物画像の機械学習アルゴリズムへの貢献によりIEEEのフェローに選出されました。 ^[5]マーフィーは、国立衛生研究所、国立科学財団、アメリカ癌協会、アメリカ心臓協会、関節炎財団、ロックフェラー兄弟基金から研究助成金を受けています。彼は「細胞と分子イメージング」に関する2冊の本と2つの特別雑誌号を共同編集し、200を超える研究論文を発表しました。^[6]彼は国際細胞測定学会の会長を務め、^[7]ドイツのフライブルク高等研究所生命科学学部の初代外部上級研究員に任命され、フライブルク大学の名誉教授に任命されました。彼は国立一般医学諮問評議会と国立衛生研究所評議会の委員でした。^[8]

マーフィーのキャリアは、蛍光ベースの細胞測定法と定量的および計算的方法を組み合わせることに集中してきました。彼と彼の共同研究者は、1980年代初頭からフローサイトメトリーを応用したエンドサイトーシス膜輸送の分析に関する広範な研究を行い^{[9] [10] [11]} 、 1990年代半ばには細胞内位置パターンを示す高解像度の蛍光顕微鏡画像への機械学習法の応用を開拓しました。 ^{[12] [13]}この研究は、2Dおよび3D画像内のすべての主要な細胞小器官パターンを自動的に認識する最初のシステムの開発につながりました。 ^{[14] [15] [16]}彼は、顕微鏡画像から直接細胞組織の生成モデルを学習するCellOrganizerプロジェクトを設立しました。彼はまた、能動的な機械学習を利用して生物医学的発見を推進する広範な研究を行っており、^{[17] [18] [19]}、世界初の自動科学の修士課程を設立しました。彼の研究論文は13,000回以上引用されており、h指数は57です^[20]。

マーフィーのリーダーシップ経験には、1987年に計算生物学における最初の正式な学部プログラムを開発し、 1999年にカーネギーメロン大学でメルク計算生物学および化学プログラムを設立したことが含まれます。これらのプログラムは、2005年にピッツバーグ大学と提携して計算生物学の博士課程を設立する重要な先駆けとなりました。マーフィーは、研究グループの仕事に基づいてQuantitative Medicine、LLCを共同設立しました。^[要出典]同社は2020年にPredictive Oncology、Inc. ^[21]に売却されました。