制限ランドマークゲノムスキャン

制限ランドマークゲノムスキャン（RLGS）は、何千ものランドマーク、つまり制限部位を迅速に同時に視覚化するゲノム解析法です。DNA修飾に特有のものも含む複数の制限酵素を組み合わせて使用するこの技術は、特定の生物のゲノム全体にわたるメチル化レベルの差異を視覚化するために使用できます。 ^[1] RLGSは、最初に特定の一連の制限酵素で切断されたDNAを直接標識し、次に放射性同位元素（通常はリン32）で標識します。次に2次元電気泳動プロセスを使用して、高解像度の結果を得ます。次に、放射性の2次元目ゲルを使用して、大きなフィルムシートを露光します。放射性標識によって生成された放射線により、電気泳動中に制限断片が移動した場所がフィルムに露光されます。次にフィルムを現像すると、オートラジオグラフの形で結果の視覚的表現が得られます。同じ制限酵素の組み合わせでは、同じ生物のサンプルから同じ「スポット」パターンが生成されますが、生物の種類によってパターンは異なります。たとえば、ヒトとマウスの DNA を同じ酵素の組み合わせで処理すると、明らかに異なるパターンが生成されます。完成したオートラジオグラフィーは互いに比較して調べることができ、フィルムの視覚的な違いにつながる遺伝子発現の変化を明らかにすることができます。各オートラジオグラフィーには何千ものスポットが含まれており、それぞれがラベル付けされた DNA 制限ランドマークに対応しています。

RLGS は全ゲノムスキャンを行う際に役立ち、数千回のポリメラーゼ連鎖反応を一度に効果的に実行できます。正常から逸脱した変化を容易に検出できるため、腫瘍の過剰/低メチル化、遺伝子の欠失または増幅、または生物の発達全体にわたる遺伝子発現の変化を特定するのに非常に効果的です。

出典

林崎芳秀；広常、真司；岡崎泰出穂市畑田。柴田秀夫河合淳；廣瀬健二渡辺幸彦；伏木伸二和田誠治杉本俊角；小早川清。川原勉香月、元谷；渋谷徹；向井常弘（1993年4月）「制限ランドマークゲノムスキャン法とその多様な応用」電気泳動。14 (4): 251-8。土井：10.1002/elps.1150140145。PMID 8388788。S2CID 22161587 。
http://www.informatics.jax.org/searches/accession_report.cgi?id=MGI:71287
ロズウェルパーク総合がんセンターのオートラッドの写真

参考文献

^ Costello, JF; Joseph F. Costello; Christoph Plass; Webster K. Cavenee (2002-03-01). 「制限ランドマークゲノムスキャン」。DNAメチル化プロトコル。分子生物学の方法。第200巻。pp. 53–70。doi : 10.1385/1-59259-182-5: 053。ISBN 1-59259-182-5. PMID 11951655。

[1] Costello, JF; Joseph F. Costello; Christoph Plass; Webster K. Cavenee (2002-03-01). 「制限ランドマークゲノムスキャン」。DNAメチル化プロトコル。分子生物学の方法。第200巻。pp. 53–70。doi : 10.1385/1-59259-182-5: 053。ISBN 1-59259-182-5. PMID 11951655。