Loading article…
| Rel相同ドメイン(RHD) | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NFKB1のRel相同ドメイン(緑とマゼンタ)がDNA(オレンジ)に結合したホモ二量体の結晶構造の上面図。 [1] | |||||||||||
| 識別子 | |||||||||||
| シンボル | 右ハンドル | ||||||||||
| パム | PF00554 | ||||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||||
| プロサイト | PDOC00924 | ||||||||||
| SCOP2 | 1svc / スコープ / SUPFAM | ||||||||||
| 医療機器 | cd07827 | ||||||||||
| |||||||||||
Rel相同ドメイン(RHD)は、真核生物の転写因子ファミリー[2]に見られるタンパク質ドメインであり、NF-κBとNFATの両方が含まれます。これらの転写因子のいくつかは、多タンパク質DNA結合複合体を形成するようです。[3] RHDのリン酸化は、これらの転写因子のいくつかの制御に役割を果たし、標的遺伝子の発現を調節する働きをしているようです。[4]
RHD は、主溝で DNA を掴む2 つの免疫グロブリン様ベータバレルサブドメインで構成されています。N末端特異性ドメインはp53転写因子のコアドメインに似ており、DNA 塩基と相互作用する認識ループが含まれています。NF -κBの場合、C 末端二量体化サブドメインがNF-κB /Rel タンパク質ファミリーの他のタンパク質との二量体化傾向を決定します。二量体化サブドメインの直後には、 IκBとの阻害相互作用の部位も含む核局在配列が続きます。[1]
参考文献
- ^ ab PDB : 1SVC ; Müller CW, Rey FA, Sodeoka M, Verdine GL , Harrison SC (1995年1月). 「DNAに結合したNF-kappa B p50ホモ二量体の構造」. Nature . 373 (6512): 311– 317. Bibcode :1995Natur.373..311M. doi :10.1038/373311a0. PMID 7830764. S2CID 4285677.
- ^ Biancalana M、Natan E、Lenardo MJ、 Fersht AR(2021年9月)。「生理学的時間スケールでのNF-κB Relサブユニット交換」。タンパク質科学。30 (9):1818– 1832。doi :10.1002 / pro.4134。PMC 8376415。PMID 34089216。
- ^ Wolberger C (1998年10月). 「コンビナトリアル転写因子」. Current Opinion in Genetics & Development . 8 (5): 552– 559. doi : 10.1016/S0959-437X(98)80010-5 . PMID 9794820.
- ^ Anrather J、Racchumi G、Iadecola C (2005 年 1 月)。「差次 的にリン酸化される核因子カッパ B のシス作用、要素特異的転写活性」。The Journal of Biological Chemistry。280 ( 1): 244– 252。doi : 10.1074/ jbc.M409344200。PMID 15516339。
