放射性ゲノミクス

放射線ゲノミクスという用語は、放射線への反応に関連する遺伝子変異の研究を指す場合（放射線ゲノミクス）と、がんの画像特徴と遺伝子発現の相関関係を指す場合（画像ゲノミクス）の 2 つの文脈で使用されます。

放射線ゲノミクス

放射線ゲノミクスにおいて、放射線ゲノミクスは放射線治療への反応に関連する遺伝子変異の研究を指すために使用されます。一塩基多型などの遺伝子変異は、放射線治療後に癌患者が毒性を発症するリスクとの関連で研究されます。^[1]^[2]^[3]また、放射線治療に対する腫瘍の反応のゲノミクスを研究する文脈でも使用されます。^[4]^[5]

ラジオゲノミクスという用語は、薬物反応に関連する遺伝的変異を研究する薬理ゲノミクスの類推として、2002年にアンドレアセンら（2002）^{[6]によって造られました。ウェストら（2005）}^[7] およびベンツェン（2006）^[8]も参照してください。

ラジオゲノミクスコンソーシアム

2009年に^[9]^[10]放射線ゲノミクスコンソーシアム（RGC）が設立され、遺伝子変異と放射線治療への反応を関連付ける研究者の多施設共同研究を促進し推進しています。ラジオゲノミクスコンソーシアム（http://epi.grants.cancer.gov/radiogenomics/）は、国立衛生研究所の国立がん研究所の疫学および遺伝学研究プログラムによってサポートされているがん疫学コンソーシアムです。^[11] RGCの研究者は、前立腺がん、乳がん、肺がん、頭頸部がん、その他のがんの患者における放射線毒性に関連する遺伝子変異を特定する多数の臨床研究を完了しています。

過去の会議

2009年 - イギリス、マンチェスター。コンソーシアムが提案されました。
2010年 - アメリカ合衆国ニューヨーク。
2011年 - イギリス、ロンドン。
2012年 - 米国ボストン。
2013年 - ケンブリッジ（REQUITEも開始）、英国。
2014年 - ドイツ、ハイデルベルク。
2015年 - フランス、モンペリエ。
2016 - オランダ、マーストリヒト。
2017年 - スペイン、バルセロナ。
2018年 - イギリス、マンチェスター。
2019年 - 米国ロチェスター。
2020年 - オンライン。
2021年 - オンライン。
2022年 - オランダ、フローニンゲン。
2023年 - イギリス、マンチェスター。
2024年 - デンマーク、オーフス。

イメージングゲノミクス^[12]

放射線画像は大規模な病気の診断に使用されます。組織画像は組織病理と相関しています。DNAマイクロアレイ、miRNA、RNA-Seqなどのゲノムデータの追加により、細胞ゲノミクスと組織規模の画像化の間に新たな相関関係を確立することができます。

参照

参考文献

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^ 「国立がん研究所 - 疫学およびゲノム研究プログラム」。
^ ラジオミクス

さらに読む

https://epi.grants.cancer.gov/radiogenomics/
カーンズ、サラ・L.ドーリング、レイラ。ファシャル、ローラ。ベンツェン、ソーレン。ファラオ、ポールDP。バーンズ、ダニエル R.ゴメス＝カーマーニョ、アントニオ。カルバロ、アナ M.ダーナリー、デイビッド P.ペレテイロ、ポーラ。サラ・L・ガリフォード。ホール、エマ。ミハイリドゥ、キリアキ。カラセド、アンヘル。シーア、マイケル。ストック、リチャード。ストーン、ネルソン N.サイデス、マシュー R.タイラー、ジョナサン P.アーメド、シャハナ。議会、マシュー。オストラー、ハリー。ローゼンスタイン、バリー S.ベガ、アナ。バーネット、ニール G.ダニング、アリソン M.バーネット、ジリアン C.ウェスト、キャサリンML;ラジオゲノミクス、コンソーシアム。 (2016年8月) 。「ゲノムワイド関連研究のメタ分析により、前立腺がんの放射線治療後の晩期毒性の遺伝子マーカーが特定される」。eBioMedicine。10 : 150–163。doi : 10.1016 / j.ebiom.2016.07.022。PMC5036513。PMID 27515689。
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[2] Barnett GC、Coles CE、Elliott RM、Baynes C、Luccarini C、Conroy D、Wilkinson JS、Tyrer J、Misra V、Platte R、Gulliford SL、Sydes MR、Hall E、Bentzen SM、Dearnaley DP、Burnet NG、Pharoah PD、Dunning AM、West CM (2012)。「放射線毒性との関連が報告されている遺伝子および多型の独立検証：前向き分析研究」。Lancet Oncol . 13 (1): 65–77. doi : 10.1016/S1470-2045(11)70302-3 . PMID 22169268。

[3] Talbot CJ、Tanteles GA、Barnett GC、Burnet NG、Chang-Claude J、Coles CE、Davidson S、Dunning AM、Mills J、Murray RJ、Popanda O、Seibold P、West CM、Yarnold JR、Symonds RP (2012)。「TNFα付近の多型と放射線療法に対する有害反応のリスクとの間の再現された関連性」。Br J Cancer。107 ( 4 ) : 748–53。doi :10.1038/ bjc.2012.290。PMC 3419947。PMID 22767148。

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[6] Andreassen, CN; Alsner J; Overgaard J (2002). 「放射線治療後の正常組織反応の変動性は遺伝的根拠に基づくのか - どこでどのように調べるか?」Radiother Oncol . 64 (2): 131–40. doi :10.1016/s0167-8140(02)00154-8. PMID 12242122.

[7] West CM、McKay MJ、Hölscher T、Baumann M、Stratford IJ、Bristow RG、Iwakawa M、Imai T、Zingde SM、Anscher MS、Bourhis J、Begg AC、Haustermans K、Bentzen SM、Hendry JH (2005)。「放射線治療への反応を予測する分子マーカー：国際原子力機関技術会議の報告と勧告」。Int J Radiat Oncol Biol Phys . 62 (5): 1264–73. doi :10.1016/j.ijrobp.2005.05.001. PMID 16029781。

[8] Bentzen, SM (2006). 「放射線療法の晩期副作用の予防または軽減: 放射線生物学と分子病理学の出会い」Nat Rev Cancer . 6 (9): 702–13. doi :10.1038/nrc1950. PMID 16929324. S2CID 1190053.

[9] ウェスト C、ローゼンスタイン BS、アルスナー J、アズリア D、バーネット G、ベッグ A、ベンゼン S、バーネット N、チャン=クロード J、チュアン E、コールズ C、デルイク K、デロイシャー D、ダニング A、エリオット R、 Fachal L、Hall J、Haustermans K、Herskind C、Hoelscher T、今井 T、岩川 M、Jones D、Kulich C、イコールエストロ、ランゲンダイク JH、オニールズ P、オザヒン M、パーラメント M、ポランスキー A、ローゼンスタイン B、セミナーラ D、シモンズ P、タルボット C、ティエレンス H、ベガ A、ウェスト C、ヤーノルド J (2010)。「ラジオゲノミクスコンソーシアムの設立」。放射線腫瘍学、生物学、物理学の国際ジャーナル。76 (5): 1295–1296. doi :10.1016/j.ijrobp.2009.12.017. PMID 20338472.

[10] West, C; Rosenstein BS (2010). 「ラジオゲノミクスコンソーシアムの設立」Radiother Oncol . 94 (1): 117–8. doi :10.1016/j.radonc.2009.12.007. PMID 20074824.

[11] 「国立がん研究所 - 疫学およびゲノム研究プログラム」。

[12] ラジオミクス