| プラノコッカス | |
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| 科学的分類 | |
| ドメイン: | |
| 門: | |
| クラス: | |
| 注文: | ナデシコ目
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| 家族: | |
| 属: | プラノコッカス ・ミグラ 1894
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| 種 | |
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プラノコッカスは、ナデシコ目ナデシコ科に属するグラム陽性またはグラム可変性の球菌または短桿菌の属である。[1]この属のタイプ種はPlanococcus citreus である。[2]
Planococcus属の一部の種は、以前は Planomicrobium 属に属していた。これらの種は、Planomicrobum属の種と分岐する代わりに、保存されたゲノム配列に基づいて構築されたさまざまな系統樹でPlanococcus属の種と単系統の分岐を形成し、系統学的関連性を示した。 [1] Caryophanaceae科には、このような分岐異常が多く含まれていたが、これは分類方法として 16S rRNA 配列に依存していたことが一因であり、解像度が低く、使用するアルゴリズムによって結果が異なることが知られている。[3] 2020 年、比較ゲノム研究によりこの科が修正され、3 つの新属が設立され、Planococcus を含むいくつかの属が修正された。[1]
Planococcusという名前は、ギリシャ語の名詞planes(「放浪者」と訳される)とラテン語のcoccusに由来している。これらを合わせると、Planococcusは運動性球菌と訳される。[1]
生化学的特性と分子シグネチャー[1]
細胞はグラム陽性またはグラム可変染色を 示し、球菌または短い桿菌であり、通常は運動性があります。
ゲノム解析により、ペニシリン結合タンパク質2、仮説タンパク質、NADPH依存性7-シアノ-7-デアザグアニン還元酵素QueF、ACTドメイン含有タンパク質、メチルマロニルCoAムターゼなど、この属に特有の5つの保存されたシグネチャーインデル(CSI)が特定されました。[1]これらの分子シグネチャーは、 Planococcus属の種をCaryophanaceae科の他の属や他のすべての細菌 と区別するための信頼性の高い方法を提供します。
分類
2021年現在、Planococcus属には、有効な名前が公表されている24種が含まれています。 [2]この属は、科内の分類学的関係を調査する研究において、単系統群であり、ナデシコ科の他の種とは系統学的に無関係であると特定されました。[1]
参考文献
- ^ abcdefg Gupta, Radhey S.; Patel, Sudip (2020年1月14日). 「系統ゲノム解析と高度に特異的な分子シグネチャーに基づく、Caryophanaceae科(Planococcaceae)とそのさまざまな属(3つの新規属を含む)の厳密な区分」 。Frontiers in Microbiology。10 : 2821。doi : 10.3389 / fmicb.2019.02821。ISSN1664-302X。PMC6971209。PMID32010063 。
- ^ ab “Genus: Planococcus”. lpsn.dsmz.de . 2021年6月5日閲覧。
- ^ ルートヴィヒ、ヴォルフガング; シュライファー、カール‐ハインツ; ホイットマン、ウィリアム B. (2015 年 9 月 14 日). 「Planococcaceae」.バーギーの古細菌と細菌の系統分類マニュアル: 1. doi :10.1002/9781118960608.fbm00116. ISBN 9781118960608。
