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 Windows 7 上の PSF ラボ | |
| 開発者 | マイケル・J・ナッセ、ヨルグ・C・ヴェルル |
|---|---|
| 安定版リリース | 3.0 / 2010年9月24日 |
| オペレーティング·システム | Windows、macOS |
| タイプ | コンピュータシミュレーションソフトウェア |
| ライセンス | 学術的および非商用目的のフリーウェア |
| Webサイト | onemolecule.chem.uwm.edu/ソフトウェア |
PSF Labは、さまざまな撮影条件下で共焦点顕微鏡の照明点像分布関数（PSF）を計算できるソフトウェアプログラムです。電界ベクトルの計算は、近焦点領域での偏光効果と高開口数顕微鏡対物レンズを考慮した厳密なベクトルモデルに基づいています。[1]
入力ビーム（平行かつ単色であると想定）の偏光は自由に選択できます（線形、円形、または楕円形）。さらに、一定またはガウス形状の入力ビーム強度プロファイルを想定できます。対物レンズから焦点に向かう途中で、照明光は最大 3 つの層状の光学層を通過します。これにより、ガラスカバースリップ（層 2）を通して光をサンプル媒体（層 3）に焦点を合わせる浸油/空気（層 1）対物レンズのシミュレーションが可能になります。各層は、（一定の）屈折率と厚さによって特徴付けられます。PSF Lab は、特定の屈折率とカバースリップの厚さ（設計パラメータ）に合わせて補正された顕微鏡対物レンズをシミュレートすることもできます。したがって、対物レンズが設計された理想的なイメージング条件からの逸脱は適切に考慮されます。
以下の光学パラメータを選択できます: [2]
- 入力ビーム
- 波長
- ガウスプロファイル充填パラメータ（0 = 定数プロファイル）
- 偏光（直線、円形、楕円形）
- 出力
- 個々のフィールドコンポーネント
- 二乗フィールド成分
- 強度
- 顕微鏡対物レンズ
- 開口数
- 光学メディア
- 屈折率（設計値と実測値）
- 厚さ（設計値と実測値）
- 深さ（媒体3内の焦点位置）
このプログラムは PSF の 2D セクションのみを計算しますが、複数の計算を積み重ねて (サードパーティ プログラムを使用)、完全な 3D PSF を取得できます。計算は「セット」にまとめられ、それぞれに独自のパラメータ セットがあります。ループを設定して PSF Lab が 1 つまたは複数のセットを計算し、新しい反復ごとに計算された画像の解像度を上げることができます。結果の画像は、ユーザーが選択できるカラー マップとともに PSF Lab に線形または対数カラー スケールで表示され、強度、個々のフィールド コンポーネント、または二乗フィールド コンポーネント分布は、さまざまな形式 (データ形式: .mat、.h5 (HDF5)、.txt (ASCII)、画像形式: .fig、.ai、.bmp、.emf、.eps、.jpg、.pcx、.pdf、.png、.tif) にエクスポートできます。
参照
参考文献
外部リンク
- 公式サイト
- 分子表現、PSF を使用したデコンボリューションの紹介。