ステルキエラ・ヒストリオムスコルム

Oxytricha trifallax（別名Sterkiella histriomuscorum ）は、 Oxytricha属に属する繊毛虫の一種で、高度に断片化されたゲノムを持つことで知られており、繊毛虫の遺伝学研究のモデルとして利用されてきた。

すべての繊毛虫と同様に、O. trifallax は2 種類の核を持っています。転写と遺伝子発現の場である大核と、有性生殖の時のみ活性で、それ以外は転写的に不活性な小核です。大核は小核の分化によって形成され、通常はある程度の RNA を介した DNA 編集が伴います。O . trifallaxは、大核ゲノムに異常に高い断片化が見られる最初の種です。大核への分化中に小核ゲノムの最大 96% が除去されます。これに対し、ゾウリムシなどの他の繊毛虫では約 30% しか除去されません。大核ゲノムの半数体サイズは約 50 Mbp です。^{[ 2 ]}

大核の染色体もまた異常に短い。大核ゲノムは約18,500個の遺伝子をコードしているが、これらは16,000個の染色体に分布しており、その長さからナノ染色体と呼ばれている。[ 2 ^{] [ 3 ]ナノ染色体}は非常に短く、そのほとんどが単一の遺伝子しか含まないため、テロメアの研究や非コードRNA遺伝子のスクリーニングのモデル生物として利用されてきた。 ^{[ 4 ]}

微小核ゲノムも配列決定されており、約3,500個のスクランブル遺伝子が含まれている。スクランブル遺伝子とは、個々のセグメントが微小核ゲノムの異なる場所に位置する遺伝子であり、そのため、DNA編集ステップ中に大核ゲノムの通常の遺伝子に「アンスクランブル」する必要がある。大核ゲノムが微小核前駆体から発達する過程で、225,000個以上の個々のDNAセグメントをアンスクランブルする必要がある。^{[ 5 ]}

ミトコンドリアゲノムも配列決定されており、長さ約70kbpで、既知の繊毛虫ミトコンドリアゲノムの中で最大である。他の繊毛虫ミトコンドリアゲノムと同様に、O. trifallaxのミトコンドリアゲノムは線状分子であり、多数の分裂遺伝子を含んでいる。また、ミトコンドリアには別のプラスミドがあり、これはミトコンドリアゲノムの進化中に水平遺伝子伝達に関与した可能性がある。 ^{[ 6 ]}

O. trifallaxの分類は議論の的となっている。形態学的特徴に基づいてSterkiella histriomuscorumに再分類されたが、分子系統解析では元のOxytricha属の種としての分類が支持されている。^{[ 7 ]}