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| コンテンツ | |
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| 説明 | neXtProt : ヒトタンパク質の宇宙を探る |
キャプチャされたデータの種類 | タンパク質の注釈 |
| 生物 | 人間 |
| 接触 | |
| 研究センター | スイスバイオインフォマティクス研究所 |
| 研究室 | カリフォ |
| 主な引用 | ガウデットら（2016）[1] |
| アクセス | |
| Webサイト | 詳しくはこちら |
| ツール | |
| ウェブ | 検索、BLAST、SNORQL |
| その他 | |
| ライセンス | クリエイティブ・コモンズ表示 4.0 |
| バージョン管理 | はい |
| データ公開 頻度 | データ: 年3回 |
| キュレーションポリシー | はい - 手動および自動 |
| ブックマーク可能な エンティティ | はい - 個々のタンパク質エントリの表示と検索 |
neXtProtは、ヒトタンパク質に関するオンライン知識プラットフォームです。機能、細胞内局在、発現、相互作用、疾患での役割など、ヒトタンパク質に関するさまざまなタイプの情報を提供する包括的なリソースを目指しています。neXtProt [2]の情報の大部分はUniProt Swiss-Protデータベース から取得されますが、プロテオミクスに重点を置いたハイスループット研究から得られたデータによって補完されています。neXtProtは、 SPARQLテクノロジーに基づく高度な検索機能と、リソースに保存されているデータをプログラムで抽出できるAPIも提供します。これは、スイスバイオインフォマティクス研究所（SIB）のAmos BairochとLydie Laneが率いるCALIPHOグループ[3]によって開発されました。
参考文献
- ^ ゴーデ、P;ペンシルベニア州ミシェル。ザーン・ザバル、M;ブリタン、A;カズン、私。ドマガルスキー、M;デュエックPD。ガトー、A;グレイズ、A;ヒナード、V;デ・ラヴァル、VR;リン、J;ニキチン、F;シェーファー、M;テイシェイラ、D;レーン、L;バイロック、A (2016 年 11 月 29 日) 「ヒトタンパク質に関する neXtProt ナレッジベース: 2017 年の更新」。核酸研究。45 (D1): D177–D182。土井：10.1093/nar/gkw1062。PMC 5210547。PMID 27899619。
- ^ Lane Lydie (2012). 「neXtProt: ヒトタンパク質の知識プラットフォーム」. Nucleic Acids Research . 40 (データベース号): D76–D83. doi :10.1093/nar/gkr1179. PMC 3245017. PMID 22139911 .
- ^ CALIPHO グループ、SIB のウェブサイト
外部リンク
- neXtProt - ヒトタンパク質の宇宙を探る
- UniProt - ユニバーサルタンパク質リソース
- SIB - スイスバイオインフォマティクス研究所
- neXtProt コードの GitHub ディレクトリ