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| ミコリシバクテリウム | |
|---|---|
科学的分類 
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| ドメイン： | 細菌 |
| 門: | 放線菌類 |
| クラス： | 放線菌 |
| 注文： | 結核菌 |
| 家族： | マイコバクテリア科 |
| 属: | マイコリバクテリ ウム・グプタら。 2018年[1] |
| タイプ種 | |
| ミコリシバクテリウム・フォルトゥイタム (da Costa Cruz 1938) Gupta et al. 2018年
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| 種 | |
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本文を参照してください。 | |
ミコリシバクテリウムは、ミコバクテリア目ミコバクテリア科に属するグラム陽性 桿菌の属である。 [1]
2018年にグプタらは、保存されたゲノム配列、比較ゲノム解析、平均アミノ酸同一性値に基づいて構築されたさまざまな系統樹の証拠に基づいて、ミコリシバクテリウム属をより大規模な属であるミコバクテリウムから区別しました。 [1]この属に加えて、この研究ではミコバクテリウムを合計5つの異なる属に分割することを提案しましたが、科学界の一部から抵抗がありました。この抵抗は、ミコバクテリウムには臨床的に関連する種がいくつか含まれており、名前の変更は臨床医や他の研究者の間で混乱を引き起こす可能性があるという理由に基づいていました。[2]
2020年に山田らは、細胞径、細胞長、細胞周囲長、細胞円形度、アスペクト比など、新属の基本的な形態学的特性を分析し、5つの属の間に有意な差があることを判定し、新しい分類を支持した。[3]
Mycolicibacteriumという名前は、ラテン語のacidum mycolicum（ミコール酸）とラテン語の名詞bacterium （ギリシャ語の名詞「bacteria」（小さな棒状））に由来しています。この名前は、棒状の細菌を含むミコール酸の属を指します。 [1]
生化学的特性と分子シグネチャー[1]
Mycolicibacteriumは急速に増殖する細菌の属で、コロニーを形成するのに 7 日もかかりません。また、メンバーは非色素産生性 (色素を生成しない) で、3 日間のアリルスルファターゼ活性試験、硝酸還元酵素、鉄吸収が陽性です。ほとんどの種は腐生性で、腐敗した有機物を栄養素として処理することができます。この属のメンバーは病原性ではないと考えられていますが、いくつかの種は感染症や病気を引き起こすことが報告されています。Mycolicibacterium のゲノム サイズは3.95～8.0 Mbp で、G+C 含有量は 65.4 ～ 70.3 mol%です。
ゲノム解析により、この属に特有に存在する4つの保存されたシグネチャーインデル（CSI）が以下のタンパク質で特定されました：LacIファミリー転写調節因子シクラーゼ、CDP-ジアシルグリセロール-グリセロール-3-リン酸3-ホスファチジルトランスフェラーゼ、およびCDP-ジアシルグリセロール-セリンO-ホスファチジルトランスフェラーゼ。[1]これらのCSIは、このMycolicibacteriumのメンバーをMycobacteriaceae科の他の属および他のすべての細菌と区別するための信頼性の高い分子的手段として機能します。さらに、この属には10の固有の保存されたシグネチャータンパク質（CSP）が特定されました。
種
ミコリシバクテリウムは以下の種から構成される: [4]
- 「M. acapulense」Gupta et al. 2018年
- Ｍ．アグリ （Ｔｓｕｋａｍｕｒａ １９８１）Ｇｕｐｔａ ｅｔ ａｌ． 2018年
- M. aichiense (Tsukamura 1981) Gupta et al. 2018年
- M. alvei (Ausina et al. 1992) Gupta et al. 1992 2018年
- M. anangense (Kim et al. 2015) Gupta et al. 2018年
- M. アラビアンス (Zhang et al. 2013) Gupta et al. 2018年
- M. arcueilense (Konjek et al. 2016) Gupta et al. 2018年
- M. アロマティシボランス (Hennessee et al. 2009) Gupta et al. 2018年
- M. aubagnense (Adékambi et al. 2006) Gupta et al. 2018年
- M. オーラム (Tsukamura 1966) Gupta et al. 2018年
- M. austroafricanum (塚村ら、1983) Gupta ら。 2018年
- M. bacteremicum (Brown-Elliott et al. 2012) Gupta et al. 2018
- M.baixiangningiae Chengら。 2021年
- M. boenickei (Schinsky et al. 2004) Gupta et al. 2004 2018年
- M. brisbanense (Schinsky et al. 2004) Gupta et al. 2018
- M. brumae (Luquin et al. 1993) Gupta et al. 1993 2018年
- M. カナリアセンス (Jiménez et al. 2004) Gupta et al. 2018年
- M. celeriflavum (Shahraki et al. 2015) Gupta et al. 2018年
- M. chitae (Tsukamura 1967) Gupta et al. 2018年
- M.クロロフェノール （アパジャラティら 1986）グプタら 2018
- M. chubuense (塚村 1981) Gupta et al. 2018年
- M.conceptionense (Adékambi et al. 2006) Gupta et al. 2018年
- M. confluentis (Kirschner et al. 1992) Gupta et al. 1992 2018年
- M. コスメティック (Cooksey et al. 2004) Gupta et al. 2018
- M. crocinum (Hennessee et al. 2009) Gupta et al. 2018年
- M. diernhoferi (塚村ら、1983) Gupta ら。 2018年
- M. dricum (Tortoli et al. 2001) Gupta et al. 2001 2018年
- M. duvalii (Stanford and Gunthorpe 1971) Gupta et al. 2018年
- M. elephantis (Shojaei et al. 2000) Gupta et al. 2000 2018年
- M. fallax (Lévy-Frébault et al. 1983) Gupta et al. 2018年
- M. ファルシノゲネス (Chamoiseau 1973) Gupta et al. 2018年
- M. flavescens (Bojalil et al. 1962) Gupta et al. 2018年
- M. フルオランテニボランス (Hormisch et al. 2006) Gupta et al. 2018年
- M. fortuitum (da Costa Cruz 1938) Gupta et al. 2018年
- M. frederiksbergense (Willumsen et al. 2001) Gupta et al. 2018年
- M. ガディウム (Casal および Calero 1974) Gupta et al. 2018年
- M. gilvum (スタンフォードとガンソープ 1971) グプタら 2018
- 「M. goodii」（ブラウンら 1999）グプタら 2018
- 「M. gossypii」Huang et al. 2021年
- M. hassiacum (Schröder et al. 1997) Gupta et al. 1997 2018年
- M. helvum (トランとダール 2016) グプタら 2018
- M. 海馬 (Balcázar et al. 2014) Gupta et al. 2018年
- M. ホドレリ (Kleespies et al. 1996) Gupta et al. 1996 2018年
- M. holsaticum (Richter et al. 2002) Gupta et al. 2018年
- M. houstonense (Schinsky et al. 2004) Gupta et al. 2018
- M. insubricum (Tortoli et al. 2009) Gupta et al. 2018年
- M.iranicum (Shojaei et al. 2013) Gupta et al. 2018年
- 「M. komanii」(Gcebe et al. 2018) Gupta et al. 2018年
- M. komossense (Kazda および Müller 1979) Gupta et al. 2018年
- M. litorale (Zhang et al. 2012) Gupta et al. 2018年
- M. llatzerense (Gomila et al. 2008) Gupta et al. 2018年
- M. lutetiense (Konjek et al. 2016) Gupta et al. 2018年
- M. マダガスカリエンセ (Kazda et al. 1992) Gupta et al. 2018年
- M. マゲリテンセ (Domenech et al. 1997) Gupta et al. 2018年
- M. malmesburyense (Gcebe et al. 2017) Gupta et al. 2018
- M. mengxianglii Cheng et al. 2021年
- M. モナセンス (Reischl et al. 2006) Gupta et al. 2018年
- 「M. montmartrense」(Konjek et al. 2016) Gupta et al. 2018年
- M. moriokaense (塚村ら、1986) Gupta ら。 2018年
- M. ムコゲニカム (Springer et al. 1995) Gupta et al. 2018年
- M. ムラレ (Vuorio et al. 1999) Gupta et al. 1999 2018年
- M. neoaurum (Tsukamura 1972) Gupta et al. 2018年
- M. neworleansense (Schinsky et al. 2004) Gupta et al. 2018年
- M. nivoides ダールら 2021
- M. novocastrense (Shojaei et al. 1997) Gupta et al. 2018年
- M. obuense (塚村および水野 1981) Gupta et al. 2018年
- M. オリゼ (Ramaprasad et al. 2016) Gupta et al. 2018年
- M. パレンス (Hennessee et al. 2009) Gupta et al. 2018年
- M. parafortuitum (Tsukamura 1966) Gupta et al. 2018年
- M. ペレグリナム (Kusunoki and Ezaki 1992) Gupta et al. 2018年
- M. phlei (Lehmann and Neumann 1899) Gupta et al. 2018
- M. phocaicum (Adékambi et al. 2006) Gupta et al. 2018年
- M. porcinum (Tsukamura et al. 1983) Gupta et al. 1983 2018年
- M. ポリフェラエ (Padgitt および Moshier 1987) Gupta et al. 2018年
- M. サイクロトレランス (Trujillo et al. 2004) Gupta et al. 2018年
- M. pulveris (Tsukamura et al. 1983) Gupta et al. 1983 2018年
- M. ピレニボランス (Derz et al. 2004) Gupta et al. 2018年
- M. rhodesiae (Tsukamura 1981) Gupta et al. 2018年
- M. ルファム (Hennessee et al. 2009) Gupta et al. 2018年
- M. ルチルム (Hennessee et al. 2009) Gupta et al. 2018年
- M. サラセニアエ (Tran and Dahl 2016) Gupta et al. 2018年
- M.セディミニス (Zhang et al. 2013) Gupta et al. 2018年
- M. senegalense (Chamoiseau 1973) Gupta et al. 2018年
- M.セプチクム (Schinsky et al. 2000) Gupta et al. 2018年
- M. setense (Lamy et al. 2008) Gupta et al. 2008 2018年
- M. スメグマティス (Trevisan 1889) Gupta et al. 2018年
- M. sphagni (Kazda 1980) Gupta et al. 2018年
- M. stellerae Nouioui et al. 2019年
- M. サーモレジスティビル (Tsukamura 1966) Gupta et al. 2018年
- M. tokaiense (Tsukamura 1981) Gupta et al. 2018年
- M. tusciae (Tortoli et al. 1999) Gupta et al. 1999 2018年
- M. vaccae (Bönicke および Juhasz 1964) Gupta et al. 2018年
- 「M.ビニルクロリディカム」コルテス・アルバヤイら 2021
- M. vulneris (van Ingen et al. 2009) Gupta et al. 2018年
- M. wolinskyi (Brown et al. 1999) Gupta et al. 1999 2018年
参考文献
- ^ abcdefg Gupta, Radhey S.; Lo, Brian; Son, Jeen (2018-02-13). 「系統ゲノム学と比較ゲノム研究は、Mycobacterium 属を修正された Mycobacterium 属と 4 つの新規属に分割することを強力に支持する」. Frontiers in Microbiology . 9:67 . doi : 10.3389/fmicb.2018.00067 . ISSN 1664-302X. PMC 5819568. PMID 29497402 .
- ^ トルトリ、エンリコ;ブラウン・エリオット、バーバラ・A.チャーマーズ、ジェームス D.シリロ、ダニエラ M.デイリー、チャールズ L.エムラー、ステファン。フロート、R. アンドレス。ガルシア、マリア J.ホーフスルート、ワウター。コ・ウォンジョン。ランゲ、クリストフ (2019-07-01)。 「同じ肉、異なるグレービーソース: マイコバクテリアの新しい名前は無視してください。」ヨーロッパ呼吸器ジャーナル。54 (1)。土井: 10.1183/13993003.00795-2019。ISSN 0903-1936。PMID 31296783。S2CID 195893005 。
- ^ 山田裕之;近松絹代。青野 明夫;村田和義；宮崎直之；香山洋子バット、アプールヴァ。藤原長俊；前田真治；御手洗 聡 (2020) 「新規 5 属の種の基本的な細胞形態をクライオ TEM で調べたところ、マイコバクテリア科の新しい分類と強い相関がある。」微生物学のフロンティア。11 : 562395.土井: 10.3389/fmicb.2020.562395。ISSN 1664-302X。PMC 7701246。PMID 33304323。
- ^ Euzéby JP, Parte AC. 「Mycolicibacterium」。命名法で定められた原核生物名のリスト（LPSN） 。 2022年6月25日閲覧。