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| サブチロシン_A | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 サブチロシンAの構造 | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| シンボル | サブチロシン_A | ||||||||
| パム | PF11420 | ||||||||
| インタープロ | IPR021539 | ||||||||
| TCDB | 1.C.84 | ||||||||
| OPMスーパーファミリー | 379 | ||||||||
| OPMタンパク質 | 1ピクセル | ||||||||
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ミクロシンは、比較的少数のアミノ酸からなる非常に小さなバクテリオシンです。このため、ミクロシンは、より大きなタンパク質の同族とは異なります。典型的な例は、大腸菌のミクロシンVです。サブチロシンAは、枯草菌由来の別のバクテリオシンです。このペプチドは、環状骨格を持ち、Cys13、Cys7、Cys4の硫黄と、Phe22、Thr28、Phe31のα位の間に3つの架橋を形成します。[1]
共生 大腸菌株によって生成されるマイクロシンは、病原菌が鉄の除去に使用するシデロフォアを模倣することで、サルモネラ・エンテリカなどの腸内病原菌を標的にして排除します。 [2]マイクロシンは、共生大腸菌株が病原菌株に勝つのにも役立ちます。 [3]
BACTIBASE [4] [5]データベースは、マイクロシンを含むバクテリオシンのオープンアクセスデータベースである。
参考文献
- ^ Kawulka KE、Sprules T、Diaper CM、Whittal RM、McKay RT、Mercier P、Zuber P、Vederas JC (2004 年 3 月)。「バチルス サブチリス由来の環状抗菌ペプチドで、硫黄とアルファ炭素の架橋結合が珍しいサブチロシン A の構造: アルファチオアルファアミノ酸誘導体の形成と還元」。生化学。43 ( 12 ): 3385–95。doi :10.1021/bi0359527。PMID 15035610 。
- ^ Huang, Kai; Zeng, Jianwei; Liu, Xueli; Jiang, Tianyu; Wang, Jiawei (2021). 「孔形成バクテリオシンであるマイクロシンE492と複合体を形成したマンノースホスホトランスフェラーゼシステム（Man-PTS）の構造」。Cell Discovery . 7 (1): 20. doi :10.1038/s41421-021-00253-6. PMC 8021565 . PMID 33820910.
- ^ サッソーネ＝コルシ M、ヌッチョ SP、リュー H、ヘルナンデス D、ヴー CT、高橋 AA;他。 （2016年）。 「マイクロシンは、炎症を起こした腸内で腸内細菌科間の競争を仲介します。」自然。540 (7632): 280–283。Bibcode :2016Natur.540..280S。土井：10.1038/nature20557. PMC 5145735。PMID 27798599。
{{cite journal}}: CS1 maint: 複数の名前: 著者リスト (リンク) - ^ Hammami R、Zouhir A、Ben Hamida J、Fliss I (2007) 。 「BACTIBASE: バクテリオ シン特性評価のための新しいウェブアクセス可能なデータベース」。BMC Microbiology。7 : 89。doi : 10.1186 / 1471-2180-7-89。PMC 2211298。PMID 17941971。
- ^ Hammami R 、Zouhir A、Le Lay C、Ben Hamida J 、 Fliss I (2010)。「BACTIBASE第 2リリース：バクテリオシン特性評価のためのデータベースおよびツールプラットフォーム」。BMC Microbiology。10 ： 22。doi ：10.1186 /1471-2180-10-22。PMC 2824694。PMID 20105292。