メタウイルスは、メタウイルス科に属するウイルスの属である。 [ 1 ]これらはレトロトランスポゾンであり、真核生物の宿主ゲノムに侵入し、ウイルスが宿主に感染した後にのみ複製する可能性がある。 [ 2 ]メタウイルスは伝播に複数の異なる宿主を利用する可能性があり、一部の植物の胚珠や花粉を介して伝染することがわかっている。 [ 3 ]
メタウイルスには、1つまたは2つのオープンリーディングフレーム（gag3および/またはpol3）を持つTy3/Gypsy要素の5つのファミリーが含まれています。これらのファミリーは、mdg1、mdg3、blastopia、412、およびmicropiaです。[ 4 ] [ 5 ]宿主ゲノムの要素におけるアミノ酸欠乏が、 Ty3要素へのフレームシフトを頻繁に引き起こしたことを裏付ける証拠があります。[ 6 ]メタウイルスはOgre/Tat遺伝子系統に対応しています。 [ 7 ]
形態学
メタウイルスは一本鎖RNAレトロトランスポゾンである。正二十面体で直線状の構造を持ち、エンベロープには包まれていない。[ 8 ]直径は約50nmで 、長さは通常42～52nmである 。[ 8 ]
進化
レトロエレメントは突然変異率と組換え率が高く、水平遺伝子伝達を行う能力があるため、その進化の歴史をたどることは困難である可能性がある（Benachenhou et al., 2013）。[ 11 ]
メタウイルスの複数の分類群は、メタウイルス科の他の属と相同なゲノム配列を持ち、共通の祖先や共進化を示唆している。[ 12 ]科学者は、メタウイルスの進化の証拠としてカプシドタンパク質を調べることが多い。[ 13 ]
研究
Mascagni et al. (2017) は、ヒマワリ種で相同体を見つけて鎖を特定するための研究を行った。実験では、さまざまなHelianthus種から DNA を抽出し、 BLASTX解析を使用してレトロトランスポゾンのゲノムを特定した。系統樹は、近隣結合クラスタリング法を使用して構築され、ゲノム解析を可能にするバイオインフォマティクス パイプラインが構築された。SUREとHelicopia の2 つの要素が特定され、それぞれGypsyおよびCopiaスーパーファミリーに分類された。[ 14 ]したがって、SURE要素は、 Metavirus属のOgre/Tat系統のGypsyグループに属する。[ 14 ]さらに解析を行った結果、Mascagni et al. (2017) は変異を特定し、Metavirus系統がSirevirus より前に進化していたと結論付けた。（2017）は、SURE要素とHelicopia要素が交雑し、新しい系統の可能性を秘めているという証拠も発見した。
ネフェドバとキム（2009）は、メタウイルスの系統をさらに特定するために、ショウジョウバエに関する研究を行った。レトロトランスポゾンとショウジョウバエから以前に抽出されたDNAから相同体が特定され、系統樹が構築された。[ 15 ]メタウイルスは、感染性を可能にするenv遺伝子を持っているが、ネフェドバとキム（2009）は、これはバキュロウイルスからの水平遺伝子伝達によって得られたと結論付けた。[ 15 ]メタウイルスはrooエレメントを含んでいるが、これはエランティウイルスからの遺伝子伝達によって得られたと考えられている、あるいはより可能性が高いのは、2つの属が共通の祖先を共有しているということである。[ 15 ]
参考文献
- ↑ 「ICTVレポート メタウイルス科」。
- ↑シーベルト、C (2006)。「非インテリジェントデザイン」(PDF)。Discover 。
- ↑ Singh, R; Finnie, R (1973年9月)「Scopolia sinensisの胚珠を介したジャガイモ紡錘形塊茎メタウイルスの種子伝染」Canadian Plant Disease Journal . 53 : 153–154 .
- ↑ Nefedova, Lidia; Kim, Alexander. "LTRレトロエレメント転移のメカニズム：ショウジョウバエからの教訓". Viruses . 9 : 1– 10.
- ↑ Levy, Camille; et al. (2013). "ウイルス様粒子ワクチンはマウスにおけるヒトメタニューモウイルス感染に対する交差防御を誘導する". Vaccine . 31 (25): 2778– 2785. doi : 10.1016/j.vaccine.2013.03.051 . PMID 23583815 .
- ↑ Turkel, Sezai (2016年6月). "アミノ酸飢餓は、サッカロミセス・セレビシエのメタウイルスTy3におけるプログラムされたリボソームフレームシフトを増強する" . Advances in Biology . 2016 : 1– 6. doi : 10.1155/2016/1840782 .
- ↑ Neumann, P; Pozarkova, D; Macas, J (2003). "高頻度で存在するエンドウのLTRレトロトランスポゾンOgreは構成的に転写され、部分的にスプライシングされる". Plant Molecular Biology . 53 (3): 399–410 . doi : 10.1023/B:PLAN.0000006945.77043.ce . PMID 14750527. S2CID 13412101 .
- 1 2 Menees, Thomas (2018). The Springer Index of Viruses . Springer Nature. pp. 843–849 .
- ↑ 「ウイルス分類：2024年版」。国際ウイルス分類委員会。2025年3月22日取得。
- ↑ 「種リスト：メタウイルス科」。国際ウイルス分類委員会。 2025年3月22日取得。
- ↑ Benachenhou, Farid; Sperber, Göran O.; Bongcam-Rudloff, Erik; Andersson, Göran; Boeke, Jef D.; Blomberg, Jonas (2013). "長末端反復配列 (LTR) の保存構造と推定される進化史" . Mobile DNA . 4 (1): 5. doi : 10.1186/1759-8753-4-5 . PMC 3601003 . PMID 23369192 .
- ↑ Koonin, M; Dolja, V; Krupovic, M (2015). "真核生物ウイルスの起源と進化：究極のモジュール性" . Virology . 479– 480: 2– 25. doi : 10.1016/j.virol.2015.02.039 . PMC 5898234 . PMID 25771806 .
- ↑ Gong, Z; Han, G (2018). "昆虫レトロエレメントはB型肝炎ウイルスの起源に関する新たな知見を提供する" . Molecular Biology and Evolution . 35 (9): 2254– 2259. doi : 10.1093/molbev/msy129 . PMID 29924338 .
- 1 2 Mascagni, Farid (2017). "ヒマワリ種における2つの高度に可変なLTRレトロトランスポゾンの異なる歴史" (PDF) . Gene . 634 : 5– 14. doi : 10.1016/j.gene.2017.08.014 . hdl : 11568/885451 . PMID 28867564 .
- 1 2 3 Nefedove, L (2009). "ショウジョウバエのレトロトランスポゾンとレトロウイルスの分子系統学と分類". Molecular Biology . 43 (5): 747– 756. doi : 10.1134/S0026893309050069 . S2CID 6078688 .
外部リンク
- ICTVレポート：メタウイルス科
- 「メタウイルス科」。NCBI分類ブラウザ。186665。
- 植物ウイルスの説明（2019年11月20日アーカイブ、 Wayback Machine）
