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マックス・プランク脳研究所は、ドイツのフランクフルトに位置しています。 1914年にベルリンでカイザー・ヴィルヘルム脳研究所として設立され、1962年にフランクフルト・ニーダーラートに移転、そして近年はフランクフルト・リートベルクの新館に移転しました。マックス・プランク協会（Max Planck Gesellschaft）に加盟する83の研究所の一つです。
マックス・プランク脳研究所の研究は、脳内のニューロンネットワークの働きに焦点を当てています。研究所には、3つの科学部門（ヘルムシュテッター部門のモーリッツ・ヘルムシュテッター、ローラン部門のジル・ローラン、シューマン部門のエリン・シューマンがそれぞれ部門長を務める）、シンガー名誉研究グループ、2つのマックス・プランク研究グループ（ヨハネス・レツクスの新皮質回路グループとタチアナ・チュマチェンコの神経ダイナミクス理論グループ）、そしてその他いくつかの研究ユニットがあります。研究所の共通の研究目標は、ニューロンとシナプス、それらが形成する構造的および機能的な回路、それらの働きを記述する計算規則、そして最終的には知覚と行動を駆動する役割について、メカニズムに基づいた理解を得ることです。実験は、この理解を達成するために必要なあらゆるスケール、すなわち樹状突起内の分子ネットワークから相互作用する脳領域のネットワークまでを対象としています。これには、分子レベル、細胞レベル、多細胞レベル、ネットワークレベル、行動レベルにおける学際的な分析が含まれ、多くの場合、理論的なアプローチと組み合わされる。
「カイザー・ヴィルヘルム脳研究所」（KWI）は1914年にベルリンに設立され、1911年に設立された「カイザー・ヴィルヘルム科学振興協会」の中でも最も古い研究所の一つとなった。この研究所は、オスカー・フォークトが1898年に設立し、妻で同じく優れた脳研究者であったセシル・フォークト＝ミュニエと共に運営していた私立研究所「神経学センター」を基盤としていた。
1901年から1910年にかけて、この研究所でフォークトの同僚だったのはコルビニアン・ブロードマンで、彼は1909年に現在でも使用されている皮質領域の細胞構築学的分類を確立した（例えば、彼の17野は一次視覚野である）。オスカー・フォークト自身の科学的業績もまた、皮質細胞構築学および髄質構築学の分野に及んだ。
1920年代、オスカー・フォークトは精神能力の形態学的相関関係の可能性、ひいては「エリート脳」の神経解剖学的研究に興味を持つようになった。 1924年にレーニンが脳出血で亡くなった際、彼の脳はホルマリン漬けにされ、2年間そこに保管された。1926年、フォークトはソビエト政府に招かれ、レーニンの脳の組織学的調査を通して彼の天才性を確立する手助けをすることになった。彼はモスクワにこの研究を行うためのスペースを与えられ、2年後にはアメリカ企業から没収された広々とした立派なレンガ造りの建物を与えられた。そこで彼はモスクワ脳研究所の設立に尽力し、後に所長を務めた。1926年から1930年にかけて、フォークトはベルリンのフォークト脳研究所で訓練を受けたロシア人協力者によるレーニンの脳の研究を監督するために、何度かモスクワを訪れた。
1927年、フォークトはモスクワで自身の研究結果に関する予備報告を発表し、組織学的観察からレーニンは連想思考の達人（「連想アスリート」）であったに違いないと結論づけた。この結論は、神経学者仲間や反対者の一部からは突飛なものと見なされた。レーニンの脳は一時期、レーニン廟に展示され、現在はモスクワ脳研究所に保管されている。
第一次世界大戦により、KWI（ベルリン・ブーフ研究所）の新館建設計画は延期された。KWI初の本格的な建物がベルリン・ブーフに完成したのは、オスカー・フォークト所長の下、1931年のことだった。当時、この研究所は世界最大かつ最も近代的な脳研究所であり、神経生理学部門（テンニースとコルンミュラー）、神経化学部門（マルテ・フォークトとファイト）、遺伝学部門（ティモフェーフ＝レッソフスキー）、研究クリニック（ゾーケン、ツヴィルナー）、そしてオスカーと妻セシル・フォークトが主宰する神経解剖学部門などが併設されていた。フォークトが国家社会主義について批判的な発言をしたこと、研究所のユダヤ人同僚に対する保護的な態度、そして（モスクワのコネクションによって煽られた）彼が共産主義者であるという噂に基づき、フォークトは1937年までに早期退職を余儀なくされた。フォークト一家は黒い森のノイシュタットに移り住み、鉄鋼王クルップ家（すでにフォークトの最初のベルリンの私立研究所に資金を提供していた）とフォークト自身の資金によって、別の私立脳研究所を設立した。1937年、フランツ・ニッスルの弟子であるナチス医師のフーゴ・シュパッツが、フォークトの後任としてKWI脳研究所の所長および神経解剖学部門の責任者となった。彼の在任中に、神経病理学部門（ハラーフォルデン）と腫瘍研究部門（テンニス）が追加された。スパッツとユリウス・ハレルフォルデンの組織学的研究の焦点の一つは、錐体外路系／運動系の病理であった。彼らは以前の共同研究で、当初ハレルフォルデン・スパッツ症候群と名付けられた錐体外路疾患について記述していた。
1940年から1945年にかけて、ハレルフォルデンとスパッツは安楽死の犠牲者の脳を研究することで、ナチス政権の残虐行為に関与した。長年にわたり、これらの研究で得られた脳切片は、当時フランクフルト・アム・マインのマックス・プランク脳研究所となっていた研究所に、他の時期の研究資料とともに保管されていた。この事実が認識されると、1933年から1945年までの期間に作成されたすべての切片は、1990年にマックス・プランク協会によってミュンヘンの墓地に埋葬された。これらの残虐行為の犠牲者を追悼する記念碑が建てられた。ハレルフォルデンとスパッツがナチ党に関与していたことから、ハレルフォルデン＝スパッツ症候群という名称の使用は強く推奨されず、より記述的な用語であるパントテン酸キナーゼ関連神経変性症に置き換えられた。
1945年以降、KWI脳研究所の各部門はディレンブルク、ギーセン、ケルン、マールブルク、ゲッティンゲンに移転した。1948年にカイザー・ヴィルヘルム協会の後継としてマックス・プランク協会が設立され、研究所はマックス・プランク脳研究所となった。ハラーフォルデンは1955年に、シュパッツは1959年に所長を退任した。1962年、フランクフルト＝ニーダーラートに新棟が建設され、神経生物学部門（ハスラー、所長1959-1982）と神経病理学部門（クリュッケ、所長1956-1979）、および研究グループ「霊長類の脳の進化」（シュテファン）と「神経化学」（ヴェルナー）が収容された。オスカー・フォークトの弟子であり、フライブルクの著名な神経学者リヒャルト・ユングの同僚であったロルフ・ハスラーは、皮質下脳領域、視床皮質系、基底核、辺縁系を研究した。ハラーフォルデンの弟子であったヴィルヘルム・クリュッケは、末梢神経障害の著名な専門家であった。彼はフランクフルト大学医学部の神経病理学部門である「エディンガー研究所」の所長も兼任していたため、研究所がフランクフルトに移転するきっかけとなった。1982年、ケルンに移転していたKWI脳研究所の一般神経学部門は、マックス・プランク脳研究所から独立し、同市のマックス・プランク神経研究所となった。KWIの他の移転部門は、所長の退任に伴い閉鎖された。
1981年、マックス・プランク神経研究所（MPIH）は、神経解剖学部門（Wässle、1981～2008年所長）と神経生理学部門（Singer、1982～2011年所長）の設立、それに続く神経化学部門（Betz、1991～2009年所長）の設立を通じて、非臨床的な基礎神経科学へと再編されました。ハインツ・ヴェッスルは哺乳類の網膜の機能的および構造的研究を行い、ハインリッヒ・ベッツはシナプスの分子構成要素を分析し、ヴォルフ・シンガーは視覚系に焦点を当てた高次認知機能の研究を行いました。
新千年紀最初の10年間、マックス・プランク神経科学研究所（MPG）は、神経ネットワークの解析を研究所の中心的な研究テーマとして位置づけました。2008年には、エリン・シューマンとジル・ローランがそれぞれ「シナプス可塑性」部門と「神経系」部門の責任者に任命されました。これらの新部門は2009年夏に活動を開始し、当初はフランクフルト大学のリートベルク科学キャンパス内の仮設施設に拠点を置いていました。このキャンパス内に建設中の新棟は、マックス・プランク生物物理学研究所の隣に最近完成しました。新研究所ビルには現在、研究所の3つの部門（エリン・シューマン、ジル・ローラン、モーリッツ・ヘルムシュテッターの各部門）、研究所内の複数の研究グループ（タチアナ・チュマチェンコとヨハネス・レツクスは2013年にマックス・プランク・グループリーダーとして加わった）、複数のコア施設、そしてピーター・モンバーツのマックス・プランク神経遺伝学研究ユニットが入居している。
国際マックス・プランク神経回路研究大学院（IMPRS）は、博士号取得のための大学院プログラムです。この大学院は、マックス・プランク生物物理学研究所、フランクフルト・アム・マインのヨハン・ヴォルフガング・ゲーテ大学、フランクフルト高等研究所、エルンスト・シュトルングマン研究所との協力のもと運営されています。
北緯50度5分35秒、東経8度39分5秒/北緯50.09306度、東経8.65139度/北緯50度5分35秒、東経8度39分5秒