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ヨハン・ベネディクト・カルプツォフ2世(1639年4月24日 - 1699年3月23日)は、ドイツのキリスト教神学者でありヘブライ語学者であった。彼は学識豊かなカルプツォフ家の一員であった。

彼はバーゼルでヨハネス・ブクストルフ2世のもとでヘブライ語を学んだ。1668年にライプツィヒ大学の東洋語教授に任命され、1679年から1699年まで聖トマス教会の牧師、1684年から1699年まで神学教授を務めた。
彼は 1674 年にヴィルヘルム・シッカードの『Jus Regium Hebræorum』を編集し、その後、ヨハン・タルノウ(タルノヴィウス)の『預言者の小注釈』 、ジョン・ライトフットの『ホラエ・ヘブ』を編集しました。およびタルムディカ、フリードリッヒ・ランクキッシュの『ゲルマニコ・ヘブライコ・グラエカ学書典』、そして 1687 年のライムンドゥス・マルティの『マウロスとイウダエオス』。彼は最後の名前の著作に、彼自身の「神学者ユダヤカムの序論」という接頭辞を付けました。
カルプツォフの論文の一部は、彼の弟サミュエル・ベネディクト・カルプツォフによって(1699年に)出版され、1703年には彼の著書『Collegium Rabbinico-Biblicum in Libellum Ruth』が出版された。