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| 略語 | CSIR-IGIB |
|---|---|
| 設立 | 1977 |
| タイプ | 政府機関 |
| 目的 | 基礎生物学研究で開発された概念を医療用の商業的に実現可能な技術に変換する |
| 位置 |
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監督 | アヌラグ・アグラワル |
親組織 | 科学産業研究評議会 |
| Webサイト | インド |
CSIRゲノム・統合生物学研究所（CSIR-IGIB）は、主に生物学研究を専門とする科学研究機関です。インドの科学産業研究評議会（CSIR）の一部です。[1]
この研究所は、生化学研究を主な目的とする 生化学技術センターとして 1977 年に設立されましたが、その後、研究の重点を統合生物学に移しました。
位置
この研究所はデリーに 2 つのキャンパスを持っています。北キャンパスは 2 つのキャンパスのうち古い方で、デリー大学のキャンパス内、モール ロードのジュビリー ホールの向かいにあります。新しいキャンパスは南デリーのマトゥラ ロード沿い、スクデフ ヴィハールにあります。
歴史
IGIIB は 1977 年に生化学技術センター(CBT)として設立されました。機能ゲノムユニットは 1998 年に設立され、重点は化学研究からゲノム研究に移りました。研究所は 2002 年に「ゲノムおよび統合生物学研究所」に改名されました。
実績
2009年、同研究所の研究チームは野生型ゼブラフィッシュのゲノムを解読し、約17億塩基対を解析した。これにより、ヒマラヤ地域原産のこの魚はインドで全ゲノムが解読された初の脊椎動物となった。それまでインドの科学者は細菌と植物のゲノムしか解読していなかった。[2] [3]
2009年12月、IGIBの科学者らはインドで初めてヒトゲノムの再配列解析を行った。[4] [5] [6]同研究所はスリランカ[7] [8]とマレーシアのゲノムの初解読にも協力した。[9]同研究所はオープンパーソナルゲノミクスコンソーシアムのメンバーでもある。[10]
COVID-19 パンデミック
この研究所は、インド[11] [12]および世界中でSARS-CoV-2の新しい変異体の理解において主導的な役割を果たしています。 [13]研究所はまた、SARS-CoV-2の新たな変異体の識別と特徴付けの鍵となる多くの情報科学リソースを維持しています。[14] [15]
同研究所の研究者らは、SARS-CoV-2の検出と遺伝疫学のための初のハイスループット[16]次世代シークエンシングに基づくアプローチを報告した。[17]このアプローチは、ケララ州におけるSARS-CoV-2の遺伝疫学を理解するために広く使用されており、[18]同州の流行拡大抑制のための政策と準備[19] 、および証拠に基づく政策の実施に大きな影響を与えている。 [20]
この研究所は、COVID-19の検査とゲノム監視のためのメガラボのコンセプトの創出に貢献しており[21] 、ケララ州[22]、アーンドラプラデーシュ州[23] 、マハラシュトラ州[24]などの州の遺伝疫学情報も提供している。
同研究所の研究者らは、インドでSARS-CoV-2の新たな系統であるI/A3iを特定したほか、インド国内で初めてCOVID-19の再感染例も報告した[25] 。 [26]同研究所の研究者らはまた、免疫逃避に関連するスパイクタンパク質のN440K変異を伴う新たな系統を発見した。[27] [28] SARS-CoV-2のゲノムと遺伝疫学を理解するための包括的な計算リソーススイートが維持されている。[15] COVID-19ワクチンの画期的感染の遺伝学的に特徴付けられた最初の症例の1つが同研究所によって報告された。[29]
この研究所の研究者は、 COVID-19の診断のための逆転写ポリメラーゼ連鎖反応に基づくキットであるCOVIDSure [30]の開発に尽力しており、現在インドで広く使用されており、トリビトロンヘルスケアによって販売されています。[31]
CSIR-IGIBの研究者らは、 CRISPR遺伝子編集に基づくFELUDAと呼ばれる検査も開発しました。これは国の検査能力に対抗できるほど効率的で迅速な検査であり、インド医薬品管理局の承認を受けています。この検査はタタ・グループに商業生産のライセンスが供与されています。 [32]
同研究所は、国家COVID-19ゲノミクスコンソーシアム[33]でも主導的な役割を果たしており、情報リソースとダッシュボードを維持している。[14]
希少遺伝性疾患のゲノミクス
この研究所は、最先端のゲノム技術を使用してインドの希少遺伝性疾患を理解し、診療所における精密医療へのゲノム応用の先駆者となる独自のプログラムを開始しました。この分野で開始されたプログラムの1つは、希少疾患を理解するためのゲノム、インドアライアンスネットワーク（GUaRDIAN）です。[34] GUaRDIANは、インド全土の臨床医が臨床診療でゲノムを利用しようとしている大規模な共同ネットワークであり、インドの希少遺伝性疾患の遺伝子構造を理解することに重点が置かれています。[35]
このコンソーシアムは、最先端のゲノム技術を利用して、疾患の遺伝的変異を特定し、臨床医が希少遺伝性疾患の正確な診断を下せるようにすることを目指しています。臨床医と緊密に協力するほか、インドにおけるゲノムデータ生成と解釈の最高水準を確立し、普及させることに加え、教育、認識、臨床現場でのゲノム技術の普及を促進することを目指しています。[36]
ここ数年、ネットワーク内の臨床医と緊密に協力し、ゲノム科学を精密医療に応用するための原理の証明を提供することができました。[37] [38] [39]患者紹介のための包括的なプログラムも機能しています。[40]
公衆衛生のための IndiGen プログラム
公衆衛生ゲノミクスに関するインディジェンプログラム[41]は、インドの多様な民族を代表する1000人のインド人の全ゲノム配列解析を行うことを目指しています。インディジェンの一環として生成されたデータは、遺伝疫学のための遺伝子変異の対立遺伝子頻度のベースラインを提供し、政策決定に役立ちます。臨床的に関連する遺伝子変異の頻度は、一般的な遺伝性疾患の診断アプローチを可能にし、また薬理ゲノミクスによる治療の最適化にも役立つテンプレートとなります。データへの検索可能なアクセスを提供する包括的なリソースも利用できます。[42]
エクステンションセンター（支部）
IGIB のメイン キャンパスは、デリー大学北キャンパスの近く、ニューデリーのモール ロードにあります。IGIB はバイオテクノロジー/製薬業界との提携により成長を遂げ、南デリー (オクラの TCGA にある IGIB Annex) と西デリーのナライナに 2 つの拡張センターを設立しました。
国際会議
IGIBは2008年にハイデラバード国際会議センターで開催されたヒトゲノム機構（HUGO）の第13回会議の共催者であった。[43]
参照
- 国立ゲノム医療研究所
- 国立植物ゲノム研究所 2011年2月16日アーカイブWayback Machine
参考文献
- ^ インド科学産業研究評議会のウェブサイトは2015年9月27日にWayback Machineにアーカイブされています。
- ^ ゼブラフィッシュゲノムウェブページ 2018年7月19日アーカイブWayback Machine「ゲノム統合生物学研究所」（IGIB）
- ^ ゲノムの謎を解読Indian Express、2009年7月5日。
- ^ インドの科学者がヒトゲノムを解読Indian Express、2009年12月10日[リンク切れ ]
- ^ * Patowary A、Purkanti R 、Singh M、Chauhan RK、Bhartiya D、Dwivedi OP 、他 (2012 年 7 月)。「インド人個人のゲノムにおける変異の体系的分析と機能的注釈」。Human Mutation。33 ( 7 ) : 1133–40。doi : 10.1002/humu.22091。PMID 22461382。S2CID 11466942 。[1]
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外部リンク
- IGIB 公式ウェブサイト