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Information Hyperlinked over Proteins (またはiHOP ) は、 PubMed抄録にアクセスするための遺伝子誘導ネットワークを提供するオンラインテキストマイニングサービスです。このサービスは、 2004 年にRobert Hoffmann とAlfonso Valenciaによって設立されました。[ 1 ] [ 2 ]
iHOPの根底にある概念は、遺伝子とタンパク質を文と抄録間のハイパーリンクとして使用することで、PubMedの情報をナビゲーション可能な単一のリソースに変換できるというものです。従来のキーワード検索ではなく、このネットワーク内の相互に関連する文をナビゲートすることで、段階的かつ制御された情報取得が可能になります。さらに、この文献ネットワークは実験的相互作用データに重ね合わせることで、新規知識と既存知識の同時分析を容易にすることができます。2014年9月現在、iHOPで提示されているネットワークには、モデル生物であるヒト、マウス、ショウジョウバエ、線虫、ゼブラフィッシュ、シロイヌナズナ、サッカロミセス・セレビシエ、大腸菌を含む2,700種以上の生物から得られた2,840万の文と11万の遺伝子が含まれています。
iHOPシステムは、遺伝子から遺伝子へとナビゲートすることで、遠く離れた医学的および生物学的概念が少数の遺伝子によってのみ結び付けられる可能性があることを示しました。2つの遺伝子間の最短経路には、平均して4つの中間遺伝子が関与することが示されています。[ 1 ]
iHOPシステムのアーキテクチャは、「iHOPファクトリー」とWebアプリケーションの2つの独立した部分で構成されています。iHOPファクトリーは、PubMedソースデータ（テキストデータと遺伝子データ）を管理し、PostgreSQLリレーショナルデータベース内に整理します。iHOPファクトリーはまた、Webアプリケーションで表示するための関連するXML出力を生成します。 [ 2 ]
iHOPは無料で利用でき、クリエイティブ・コモンズBY-NDライセンスの下でライセンスされています。[ 3 ]