ヒトプロテオームプロジェクト

ヒトプロテオームプロジェクト
コンテンツ
説明	全プロテオーム特性評価
; キャプチャされたデータの種類	タンパク質配列、リン酸化、アセチル化、糖化
生物	ホモサピエンス
接触
研究センター	ヒトプロテオーム組織
研究室	様々な
主な引用	22398612 の検索結果
アクセス
Webサイト	www.thehpp.org ; www.c-hpp.org
ウェブサービスURL	次Prot REST

ヒトプロテオームプロジェクト^[1]（HPP ）は、ヒトプロテオーム機構^[2]が調整する共同プロジェクトです。その目標は、ヒトゲノムから翻訳された配列によって生成されるすべてのタンパク質を実験的に観察することです。

歴史

ヒトプロテオーム機構は、血漿、^[3]、肝臓、^[4]、脳^[5]、尿^[6]など、臨床的に興味深い特定のヒト組織に関連する多くの長期にわたるプロテオミクス研究プロジェクトの調整機関としての役割を果たしてきました。また、タンパク質の大規模研究に必要な特定の技術^[7]や標準^[8]に関連するプロジェクトも担当しています。

ヒトゲノム計画に匹敵する大規模プロジェクトの構造と目標は、科学文献で議論されてきた。^[9]^[10]^[11]^[12]^[13]この議論と、2009年、2010年、2011年に開催されたヒトプロテオーム機構の世界会議での一連の会議の結果、ヒトプロテオーム計画はC-HPPとB/D-HPPという2つのサブプロジェクトで構成されると定義されることが決定された。^[14] C-HPPは、ヒト染色体ごとに1つずつ、25のグループに編成される。B/D-HPPは、タンパク質の生物学的関連性と疾患関連性によってグループに編成される。^[15]

プロジェクトとグループ

現在のワーキンググループのセットは、研究対象となる染色体の順に以下にリストされています。

計算リソース

MS/MS ベースのプロテオミクス結果のデータ削減、分析、検証は、米国シアトルのシステム生物学研究所 ( PeptideAtlas ) の Eric Deutsch が担当しています。抗体法に関連するデータ処理は、スウェーデンのストックホルムの Kalle von Feilitzen ( Human Protein Atlas ) が担当しています。全体的な統合とレポート情報学は、スイスのジュネーブにある SIB の Lydie Lane ( NeXtProt )が担当しています。HPP 貢献の一部として生成されたすべてのデータは、ProteomeXchange リポジトリの 1 つに保存されます。^[要出典]

現在の状況

ヒトプロテオームプロジェクトの最新情報は、Journal of Proteome Research（2014年）など定期的に公開されています。^[16]タンパク質の観察に関連する信頼度の指標が公開されています^[17]また、「MissingProteinPedia」も公開されています^[18]^[19]

9つの主要なアノテーションポータルの比較に基づくと、ヒトタンパク質数は21,819から18,891（2017年現在）の範囲に及んでいる。^[20] HPPの2021年の指標によると、タンパク質発現は、ヒトゲノムにコード化されている予測タンパク質の92.8％で信頼性をもって検出された。^[21]

参照

参考文献

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外部リンク

HPP プロジェクトページ (www.hupo.org)
HPP ウェブサイト (www.thehpp.org)
染色体中心の HPP ウェブサイト (www.c-hpp.org)
BD HPP ウェブサイト (www.hupo.org/B/D-HPP)

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