Loading article…
ヒト疾患ネットワークは、遺伝的起源やその他の特徴を参照したヒトの障害や疾患のネットワークです。より具体的には、主に疾患遺伝子を参照したヒト疾患の関連性のマップです。たとえば、ヒト疾患ネットワークでは、2 つの疾患が少なくとも 1 つの関連遺伝子を共有している場合、それらの疾患はリンクされています。典型的なヒト疾患ネットワークは通常、疾患と遺伝子情報の両方で構成される二部ネットワークから派生します。さらに、一部のヒト疾患ネットワークでは、症状やタンパク質などの他の特徴を使用して疾患を関連付けます。
歴史
2007年、GohらはOMIMデータベースの情報を用いて疾患-遺伝子二部グラフを構築し、ヒト疾患ネットワークと名付けた。[2] 2009年、BarrenasらはGWA（ゲノムワイド関連研究）を用いて複雑な疾患-遺伝子ネットワークを導出した。[3]同年、Hidalgoらは計算された距離に従って疾患を連結したヒト表現型疾患ネットワークを構築する新しい方法を発表した。[4] 2011年、Cusickらは細胞コンテキストにおける遺伝子型-表現型の関連性に関する研究をまとめた。[5] 2014年、Zhouらは生物医学文献データベースをマイニングして症状に基づくヒト疾患ネットワークを構築した。[6]
プロパティ
大規模なヒト疾患ネットワークはスケールフリー特性を示す。次数分布はべき乗則に従い、少数の疾患のみが多数の疾患と関連しているのに対し、ほとんどの疾患は他の疾患とほとんど関連がないことを示唆している。このようなネットワークは疾患クラスによるクラスタリング傾向も示す。[2] [7]
症状に基づく疾患ネットワークでは、疾患もそのカテゴリーごとにクラスター化されます。さらに、同じ症状を共有する疾患は、同じ遺伝子やタンパク質相互作用を共有する可能性が高くなります。[6]
参照
参考文献
- ^ 「Jupyter Notebook ビューアー」。
- ^ ab Goh, Kwang-Il, et al. 「ヒト疾患ネットワーク」 Proceedings of the National Academy of Sciences 104.21 (2007): 8685-8690.
- ^ Barrenas, Fredrik, et al. 「ゲノムワイド関連研究により特定された複雑なヒト疾患遺伝子のネットワーク特性」 PLoS ONE 4.11 (2009): e8090。
- ^ Hidalgo, César A., et al. 「ヒト表現型の研究のための動的ネットワークアプローチ」 PLoS Computational Biology 5.4 (2009): e1000353。
- ^ Vidal, Marc, Michael E. Cusick、Albert-Laszlo Barabasi。「インタラクトームネットワークとヒト疾患」Cell 144.6 (2011): 986-998。
- ^ ab Zhou, XueZhong, et al. 「ヒトの症状と疾患のネットワーク」 Nature Communications 5 (2014)。
- ^ Kannan、Venkateshan他「階層化ネットワーク構築を用いた長期医療コホートデータから抽出された条件付き疾患発症」Scientific Reports 6、26170（2016）[1]
外部リンク
- https://web.archive.org/web/20080625034729/http://hudine.neu.edu/
- http://www.barabasilab.com/pubs/CCNR-ALB_Publications/200705-14_PNAS-HumanDisease/200705-14_PNAS-HumanDisease-poster.pdf
- [2]
- https://www.nytimes.com/2008/05/06/health/research/06dise.html