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ハプロタイプの収束とは、収束進化 または偶然のどちら かによって、別々の集団に 無関係な同一の ハプロタイプが出現することです。
説明
ハプロタイプの収束はまれです。なぜなら、2 人の血縁関係のない個人が独立して、関心のある部位でまったく同じ遺伝子配列を進化させる可能性が非常に低いからです。したがって、ハプロタイプは主に非常に近縁の個人間で共有されます。これは、2 人の血縁関係のある個人の遺伝情報が、血縁関係のない個人間よりもはるかに類似しているためです。[1]置換バイアスにより、同じ部位で突然変異が発生する可能性が高くなるため、ハプロタイプの収束の可能性がさらに高まります。[2]配列は、元の同じ配列から分岐し、その後元に戻り、このように収束することもあります。[3] 2 つの血縁関係のないグループでの収束進化による収束は、派生形質が劇的に異なる経路で発生する可能性があるため、はるかにまれです。[4] [5]
ハプロタイプの収束により2人の個人が同一であると誤って判断されることは、より多くの遺伝子マーカーを検査すればするほど、非常にまれな偶然の一致をより多く必要とするため、はるかに起こりにくくなります。[6]現代のハイスループットシーケンシング手法では、マーカーの大きなセット、あるいはゲノム全体をシーケンシングすることがはるかに実現可能になり、これらの問題を大幅に最小限に抑えることができます。[7]
例
一部の地域では、Y-STR遺伝子（姓の起源を研究するためによく使用される）の多様性が低いため、ハプロタイプの収束により分析が混乱し、無関係な個人が非常に近縁であると結論付けられることがあります。[8]
同様に、新世界のミトコンドリアDNAハプログループの研究では、ネイティブアメリカンとアジア人の間のハプロタイプの類似性は、共通の祖先ではなく、ミトコンドリアDNAのHVSI領域の超変異性の結果であることが観察されました。[2]
より遠縁のグループにおける収斂進化によるハプロタイプ収斂の例として、古代のクロメダカ や クロダイ に似た黒水環境に 生息するイトヨは、独立してSWS2遺伝子において同じハプロタイプを進化させ、その条件で視力の向上を促進した。[9]
参考文献
- ^ Brenner, Charles H. (2014-01-01). 「Yハプロタイプ一致確率の理解」. Forensic Science International: Genetics . 8 (1): 233–243. doi :10.1016/j.fsigen.2013.10.007. PMID 24315614.
- ^ ab Malhi, Ripan S.; Eshleman, Jason A.; Greenberg, Jonathan A.; Weiss, Deborah A.; Shook, Beth A. Schultz; Kaestle, Frederika A.; Lorenz, Joseph G.; Kemp, Brian M.; Johnson, John R. (2002-04-01). 「新世界ミトコンドリア DNA ハプログループ内の多様性の構造: 北米先史時代への影響」.アメリカ人類遺伝学ジャーナル. 70 (4): 905–919. doi :10.1086/339690. PMC 379119. PMID 11845406 .
- ^ Cairns, J.; Foster, PL (1991年8月). 「大腸菌におけるフレームシフト変異の適応的復帰」.遺伝学. 128 (4): 695–701. doi :10.1093/genetics/128.4.695. ISSN 0016-6731. PMC 1204544. PMID 1916241 .
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- ^ スターン、デイビッド・L. (2013). 「収斂進化の遺伝的原因」.ネイチャーレビュー遺伝学. 14 (11): 751–764. doi :10.1038/nrg3483. ISSN 1471-0064. PMID 24105273. S2CID 15282549.
- ^ 「一般的なハプロタイプ」ancestry.com、2006年12月14日。 2012年3月28日閲覧。[より良い情報源が必要]
- ^ Blair, C.; Murphy, RW (2011-01-01). 「分子系統解析の最近の動向: 今後は?」Journal of Heredity . 102 (1): 130–138. doi :10.1093/jhered/esq092. ISSN 0022-1503. PMID 20696667.
- ^ ソレ＝モラタ、ノイス;ビジャエスクーサ、パトリシア。ガルシア・フェルナンデス、カルラ。フォント・ポルテリアス、ノイス;イレスカス、マリア・ホセ。バルベルデ、ラウラ。タッシ、フランチェスカ。ギロット、シルビア。フェレク、クロード (2017-08-04)。 「R1b-DF27 ハプログループの分析は、イベリアの Y 染色体系統の大部分が最近 in situ で発生したことを示しています。」科学的報告書。7 (1): 7341。ビブコード:2017NatSR...7.7341S。土井：10.1038/s41598-017-07710-x。ISSN 2045-2322。PMC 5544771。PMID 28779148。
- ^ Marques, David A.; Taylor, John S.; Jones, Felicity C.; Palma, Federica Di; Kingsley, David M.; Reimchen, Thomas E. (2017-04-11). 「SWS2オプシンの収束進化により、イトヨの異なる光環境への適応放散が促進される」. PLOS Biology . 15 (4): e2001627. doi : 10.1371/journal.pbio.2001627 . ISSN 1545-7885. PMC 5388470. PMID 28399148 .