ハプログループS（mtDNA）

人類遺伝学において、ハプログループ Sは、オーストラリア先住民にのみ見られるヒトミトコンドリア DNA (mtDNA) ハプログループです。これは、マクロハプログループNの子孫です。

ハプログループSのmtDNAは、64,000年前から40,000年前（51 kya）の間にオーストラリア内で進化しました。^[2]

これはオーストラリア先住民に見られる。ウィランドラ湖の人骨WLH4で発見されたハプログループS2は後期完新世（3,000～500年前）に遡る。^{[3] [4]}

次の表は関連するGenBankサンプルを示しています。

このハプログループSのサブクレードの系統樹は、マンニス・ヴァン・オーブンとマンフレッド・カイザーによる論文「ヒトミトコンドリアDNA変異の包括的系統樹の更新」^[1]とその後の発表された研究に基づいています。 2017年に出版されたナノ・ネーグルの出版物「オーストラリア先住民のミトコンドリアゲノム変異 - 人口の古代と多様性に関する理解の深化」によると、ハプログループSのTMRCAは49 KYAから51 KYAの間です。^[2]

• オーストラリアのS（64-40 kya）
  • オーストラリアのS1（53-32千年前）
    • S1a (44-29 kya) は西オーストラリア州、ノーザンテリトリー州、クイーンズランド州、ニューサウスウェールズ州で発見された。
    • S1b (37-22 kya) は NT、QLD、NSW で発見されました。
      • S1b1 (30-10 kya) は NT と QLD で発見されました
        • S1b1a (24-6 kya) は QLD で発見されました
      • S1b2 (17-3 kya) は QLD で発見されました
      • S1b3 (20-4 kya) は QLD と NSW で発見されました
  • オーストラリアのS2（44-22千年前）
    • S2a (38-18 kya) は NT、QLD、NSW、TAS で発見されました。
      • S2a1 (31-12 kya) はニューサウスウェールズ州、クイーンズランド州、タスマニア州で発見された
        • S2a1a (19-6 kya) ニューサウスウェールズ州とクイーンズランド州で発見
      • S2a2 (38-11 kya) は NT、QLD、NSW で発見されました。
    • S2b (42-18 kya) は西オーストラリア州、ノーザンテリトリー州、クイーンズランド州、ビクトリア州で発見された
      • S2b1（27-9 kya）はNT、QLD、VICで発見された
      • S2b2 (37-12 kya) は西オーストラリア州、ノーザンテリトリー州、クイーンズランド州で発見された
  • S3 (17-1 kya) はNTで発見されました
  • NTで見つかったS4
  • S5はWAで発見されました
  • S6がニューサウスウェールズ州で発見

ウィキメディア・コモンズには、ハプログループ S (mtDNA)に関連するメディアがあります。

• 系図DNA検査
• 遺伝的系譜
• ヒトミトコンドリア遺伝学
• 集団遺伝学

1. ^ ab van Oven, Mannis; Kayser, Manfred (2009年2月). 「ヒトミトコンドリアDNAの変異に関する包括的系統樹の更新」. Human Mutation . 30 (2): E386–E394. doi : 10.1002/humu.20921 . PMID  18853457. S2CID  27566749.
2. ^ ab Nagle, Nano; van Oven, Mannis; Wilcox, Stephen; van Holst Pellekaan, Sheila; Tyler-Smith, Chris; Xue, Yali; Ballantyne, Kaye N.; Wilcox, Leah; Papac, Luka; Cooke, Karen; van Oorschot, Roland AH; McAllister, Peter; Williams, Lesley; Kayser, Manfred; Mitchell, R. John (2017 年 3 月)。「オーストラリア先住民のミトコンドリアゲノム変異 - 人口の古代性と多様性に関する理解の深まり」。Scientific Reports . 7 (1): 43041. Bibcode :2017NatSR...743041N. doi :10.1038/srep43041. PMC 5347126 . PMID  28287095. 
3. ^ ランバート、デイビッド、ライト、ジョアン、ウェスタウェイ、マイケル、スブラマニアン、サンカー（2016年6月8日）。「新たなDNA研究により、古代アボリジニが最初のオーストラリア人であったことが確認された」The Conversation。
4. ^ ab Heupink, Tim H.; Subramanian, Sankar; Wright, Joanne L.; Endicott, Phillip; Westaway, Michael Carrington; Huynen, Leon; Parson, Walther; Millar, Craig D.; Willerslev, Eske; Lambert, David M. (2016年6月21日). 「先住民オーストラリア人の古代mtDNA配列の再検討」. Proceedings of the National Academy of Sciences . 113 (25): 6892–6897. doi : 10.1073/pnas.1521066113 . PMC 4922152 . PMID  27274055. 
5. ^ abcdefghijklmnopqrstu vwxyz aa ab ac ad ae af ag ah ai aj ak al am an ao ap aq ar Nagle, Nano; van Oven, Mannis; Wilcox, Stephen; van Holst Pellekaan, Sheila; Tyler-Smith, Chris; Xue, Yali; Ballantyne, Kaye N.; Wilcox, Leah; Papac, Luka; Cooke, Karen; van Oorschot, Roland AH; McAllister, Peter; Williams, Lesley; Kayser, Manfred; Mitchell, R. John (2017-03-13). 「オーストラリア先住民のミトコンドリアゲノム変異 - 人口の古代性と多様性に関する理解の深まり」. Scientific Reports . 7 (1):補足図2. doi :10.1038/srep43041 . PMC5347126 . PMID28287095  . 

• イアン・ローガンのミトコンドリア DNA サイト: ハプログループ S
• マニス・ヴァン・オーヴェンのフィロツリー