ハルマヘラ海(インドネシア語: Laut Halmahera、インドネシア語の発音: [ ˌlaʊt̪̚ halmaˈhera ])は、オーストラリア地中海の中央東部に位置する地域海です。南緯約1度、東経約129度を中心とし、北は太平洋、西はハルマヘラ島、東はワイゲオ島とパプア南西部、南はセラム海に囲まれています。面積は約95,000 km²(約37,000平方マイル)で、地形は複数の独立した盆地と海嶺から成り、その中でも主要なものは水深2,039メートルに達するハルマヘラ海盆です。
ハルマヘラ海の西側には、ハルマヘラ島の海岸線に深く入り込んだ3つの大きな湾があり、島の東海岸は4つの巨大な半島に分かれています。これらの3つの入り江は、南(南半島と南東半島の間)のウェディ湾(テルク・ウェシ)、中央(南東半島と北東半島の間)のブリ湾(テルク・ブリ)、北(北東半島と北半島の間)のカオ湾(テルク・カオ)です。さらに北には、北ハルマヘラ県の海岸に突き出たガレラ湾(テルク・ガレラ)という注目すべき4つ目の入り江があります。

国際水路機関(IHO)は、ハルマヘラ海を東インド諸島の海域の一つと定義しています。IHOは、その境界を次のように定義しています。[ 1 ]
北側では、ワジャボエラ(モロタイ島)からハルマヘラ島の最北端であるジョジェファ島までの線が通っています。
東側。モロタイ島の北東端のTg. Gorangoから、Sajang島とKawé島を経由して、Waigeo島とBatanta島の西端まで、Samawati島の北西端まで、海岸沿いに南西端のTg. Menonketまで、そしてそこからニューギニアのTg. Sele ( 1°26′S 130°56′E / 1.433°S 130.933°E / -1.433; 130.933 ) に至る線。
南側。オビ・メジャーとニューギニアの間にあるセラム海の北限[オビ・メジャーから東端のタンジョン・セランマロレオを経て、トバライ、ケケク、ピサン、コフィアウ諸島を通ってニューギニアの西端タンジョン・セレ(南緯1度26分、東経130度55分/南緯1.433度、東経130.917度/ -1.433; 130.917 )]。
西側。ハルマヘラ島とオビ・マヨール島の間のモルッカ海 の南端[原文ママ] [ハルマヘラ島の南端からビサ(セティレ)島の北端、そこからオビ・マヨール島の北端までの線]。