グラシリバクテリア

グラシリバクテリアは、かつてGN02、BD1-5、またはSN-2として知られていた細菌の候補門である。これは候補門の放射進化とパテシバクテリア群の一部である。

Gracilibacteria 門の最初の代表種は、深海堆積物サンプルから回収された後、1999 年に報告されました。代表 16S rRNA 配列は「BD1-5」（サンプル BD1、配列 5）と呼ばれ、既知の 16S rRNA 遺伝子との配列相同性が低いことが指摘されましたが、この時点では新しい門として提案されませんでした。^{[ 1 ]} 2006 年に、Gracilibacteria の代表種がメキシコ、バハ カリフォルニア スル州、ゲレーロ ネグロの高塩分微生物マットから回収され、新しい門「GN02」として提案されました。^{[ 2 ]} 2013 年に、この門のゲノム表現が大幅に拡大されたことに基づいて、BD1-5/GN02 系統に「Gracilibacteria」という名前が提案されました。 ^{[ 3 ] [ 4 ]}

2012年に、培養に依存しないゲノム解像度のメタゲノム技術を用いて、酢酸添加帯水層（米国コロラド州ライフル）から最初のグラシリバクテリアゲノムが回収された。^{[ 5 ]}ゲノム解析によると、グラシリバクテリア門のメンバーは代謝が限られており、共生生物または内部共生生物である可能性が高い。^{[ 3 ]}グラシリバクテリアのメンバーは、UGAが終止コドンの代わりにグリシンアミノ酸をコードする代替遺伝暗号を使用している。 ^{[ 6 ]}

現在受け入れられている分類体系は、命名法上の地位を有する原核生物名のリスト（LPSN）^{[ 10 ]}と国立生物工学情報センター（NCBI） ^{[ 11 ]}に基づいています。

クレード「Gracilibacteria」クラスター

• クラス「バンピロコッカス」パレン、ロドリゲス-R、アリカン 2022 (SR1; JAEDAM01)
  • 「Absconditibacterales」を注文するYakimov et al. 2022コルグ。コストフスキー、オーレン、ゴーカー 2025
    • 科「Absconditicoccaceae」Yakimov et al. 2022
      • ?属「Candidatus Strigamonas」Bouderka et al. 2024年
        • 種「Ca. S. methylophilicida」Bouderka et al. 2024
      • 「Candidatus Absconditicoccus」属Yakimov et al. 2022年
        • 種「Ca.A. praedator」Yakimov et al. 2022年
      • 「Candidatus Vampirococcus」属Guerrero et al. 1986 ノンキジナ 2017
        • 種「Ca. V. lugosii」Moreira et al. 2021
  • BD1-5を注文する
    • ファミリーUBA6164
      • 属「Candidatus' Altimarinus」Rinke et al. 2013年
        • 種「Ca.」 A. pacificus」Rinke et al. 2013年
• クラス「Gracilibacteriia」Yakimov et al. 2022
  • 「ペリバクテラル目」を注文するAnantharaman et al. 2016年
    • 家族「ペリバクテラ科」Anantharaman et al. 2016年
      • 「Candidatus Peribacter」属Anantharaman et al. 2016年
        • 種「Ca.P.riflensis」Anantharaman et al. 2016年