ギガDB

GigaDB（GigaScience DataBase）は、生命科学および生物医学科学研究からの膨大な多次元データセットへの長期的なアクセスを確保することを目的として2011年に開始された専門リポジトリです^{[1] 。データセットは多様で、}ゲノム、トランスクリプトミクス、画像データが含まれます。データセットは、 BGIと中国国家遺伝子銀行に雇用されているGigaDBバイオキュレーターによってキュレーションされています。

GigaDB は当初、生物学および生物医学研究の再現性と再利用性を確保することに重点を置いたGigaScience Press のデータジャーナル GigaScienceおよびGigabyteに提出された大規模な研究データのサポートアーカイブとして設計されました。GigaDB の範囲は、合成データ、ソフトウェア、ワークフローなどの計算研究オブジェクトを含むように拡大されました。 ^[2]データベースは、Genomics Standard Consortium (GSC)承認のサンプル属性と標準を使用しており、データが包括的で発見可能であることを保証するために GSC とも協力しています。^[3] GigaDB でホストされるデータセットは、特定の記事または研究をサポートするファイルとメタデータのグループとして定義されます。公開された各 GigaDB データセットには、DataCite デジタルオブジェクト識別子が割り当てられ、データはNCBI Datamed およびClarivate Analytics Data Citation Indexでインデックス化され、発見可能になります。GigaDB は、Repositive と協力して、人間のデータセットの発見可能性を高めています。 ^[4]

参考文献

^ Sneddon TP、Li P、Edmunds SC (2012 年 7 月)。「 GigaDB : GigaScience データベースの発表」。GigaScience . 1 (1): 11. doi : 10.1186/2047-217X-1-11 . PMC 3626507 . PMID 23587345。
^ Xiao SZ、Armit C、Edmunds S、Goodman L、Li P、Tuli MA、Hunter CI (2019 年 1 月)。「GigaScience データベース GigaDB のインタラクティブ性の向上と機能強化」。データベース。2019 : baz016。doi : 10.1093 / database / baz016。PMC 6376146。PMID 30753480。
^ Armit C、Tuli MA、Hunter CI (2022 年 6 月)。「GigaScience の 10 年: GigaDB とオープンデータ運動」。GigaScience . 11 . doi : 10.1093/gigascience/giac053. PMC 9197680 . PMID 35701374。
^ 「Repositive、医薬品研究者向けのプレミアム遺伝子データコラボレーションプラットフォームを開発」biopharma-reporter.com 2016年2月2日2019年7月1日閲覧。