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ゲイリー・ストーモ | |
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 ISMB/ECCB 2013で講演するゲイリー・ストーモ氏。 | |
| 生まれる | ゲイリー・ディーン・ストーモ 1950年（73～74歳） サウスダコタ州、アメリカ合衆国[1] |
| 母校 | カリフォルニア工科大学 コロラド大学ボルダー校 |
| 科学者としてのキャリア | |
| フィールド | バイオインフォマティクス 遺伝学 分子生物学 |
| 機関 | コロラド大学ボルダー校 セントルイス・ワシントン大学 |
| 論文 | 大腸菌の翻訳開始部位のコンピュータ支援による特性評価 (1981) |
ゲイリー・ストーモ（1950年生まれ）はアメリカの遺伝学者で、現在はセントルイスのワシントン大学医学部の遺伝学部およびゲノム科学・システム生物学センターのジョセフ・アーランジャー教授を務めている。[2]彼はバイオインフォマティクスとゲノミクスの先駆者の一人とみなされている。[3] [4] [5]彼の研究は、 DNAとRNAの調節配列と、遺伝子発現を制御する調節ネットワークへのそれらの寄与を特定して予測するために、実験的アプローチと計算的アプローチを組み合わせている。[2]
教育
ストーモはカリフォルニア工科大学で学部生として物理学を専攻していたが、3年生の時に生物学に転向した。[1]彼は1981年にコロラド大学ボルダー校で分子生物学の博士号を取得した。[2]
研究
ストーモは博士号取得後、コロラド大学の分子細胞発生生物学科の教員として勤務し、教授に昇進した後、1999年にセントルイスのワシントン大学に移った。 [2] [3]
ストーモ氏の研究では、遺伝子発現の調節を理解するために実験的アプローチと計算的アプローチを組み合わせています。彼の実験的研究は、タンパク質と DNA の相互作用と遺伝子調節におけるその役割に焦点を当てています。彼の計算的研究には、これらの相互作用の分析と、DNA と RNA の調節部位を発見するためのパターン認識アルゴリズムの開発が含まれます。
1982年、ストーモと彼の同僚は、現在では生物学的配列におけるモチーフ（パターン）の表現として一般的に使用されている位置重み行列（PWM）を発表しました。 [6]生物学的配列のパターンを表現するためにコンセンサス配列が以前に使用されていましたが、これらのパターンの新たな発生を予測することは困難でした。[7] PWMが最初に使用されたのは、翻訳開始部位として機能するRNA部位の発見でした。コンセンサス配列に対するPWMの利点により、PWMは生物学的配列のパターンを表現するための一般的な方法となり、モチーフ発見のための現代のアルゴリズムに不可欠な要素となっています。[8] [9]
彼は150以上の科学論文を発表している。[3]
役割と栄誉
ストーモは2000年から2004年まで国際計算生物学会（ISCB）の理事を務め、2010年にISCBフェローに選出された。 [10] [11]彼は2001年にアメリカ医療情報学会のフェローに選出された。[12]
ストーモ氏は1994年から1999年までバイオインフォマティクス誌の編集長を務めた。 [12] 2014年、バイオインフォマティクス誌の初代名誉編集者の一人に任命された。[13]ストーモ氏はまた、 PLOS Computational Biology誌の副編集長も務めた。[14]現在、 Current Protocols in Bioinformatics誌の共同編集者である。[15]
参考文献
- ^ ab Jones, Neil C.; Pevzner, Pavel A. (2004).バイオインフォマティクスアルゴリズム入門. ケンブリッジ、マサチューセッツ州: MIT プレス. p. 116. ISBN 978-0-262-10106-6。
- ^ abcd 「ゲイリー・ストーモ」. ISMB/ECCB 2013。ISCB 。2014 年1 月 16 日に取得。
- ^ abc 「遺伝子制御モデリングへの計算的および実験的アプローチ @ uncCharlotte」。UNC Charlotte バイオインフォマティクスおよびゲノミクス学部。2014年1 月 16 日閲覧。
- ^ 「Gary Stormo、Gene Network Sciences Inc、システム生物学科学諮問委員会メンバー」 。 2014年1月16日閲覧。
- ^ 「LGRC - Lung Genomics Research Consortium - Mick Correll」。www.lung-genomics.org。2015年4月5日時点のオリジナルよりアーカイブ。2014年1月16日閲覧。
- ^ Stormo, Gary D.; Schneider, Thomas D.; Gold, Larry; Ehrenfeucht, Andrzej (1982). 「大腸菌の翻訳開始部位を区別するための「パーセプトロン」アルゴリズムの使用」。Nucleic Acids Research . 10 (9): 2997–3011. doi :10.1093/nar/10.9.2997. PMC 320670 . PMID 7048259.
- ^ Stormo, GD (2000年1月1日). 「DNA結合部位：表現と発見」.バイオインフォマティクス. 16 (1): 16–23. doi :10.1093/bioinformatics/16.1.16. PMID 10812473.
- ^ Sinha, S. (2006年7月27日). 「シーケンス内の位置重みマトリックス一致のカウントと、識別モチーフ検索への応用」.バイオインフォマティクス. 22 (14): e454–e463. doi : 10.1093/bioinformatics/btl227 . PMID 16873507.
- ^ Xia, Xuhua (2012). 「Position Weight Matrix、Gibbs Sampler、およびモチーフの特性評価と予測における関連する有意性検定」Scientifica . 2012 : 1–15. doi : 10.6064/2012/917540 . PMC 3820676 . PMID 24278755.
- ^ 「過去の役員および取締役会」www.iscb.org . ISCB . 2014年1月17日閲覧。
- ^ “ISCB Fellows”. www.iscb.org . ISCB. 2015年3月28日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2014年1月16日閲覧。
- ^ ab "Gary D. Stormo, PhD, FACMI - AMIA". www.amia.org . AMIA . 2014年1月17日閲覧。
- ^ 「バイオインフォマティクスの15年」「バイオインフォマティクス. 30 (6): 747. 2014. doi :10.1093/bioinformatics/btu076. PMID 24642573.
- ^ Sansom, Clare; Morrison McKay, BJ; Bourne, Philip E. (2008年7月18日). 「ISCB Honors David Haussler and Aviv Regev」. PLOS Computational Biology . 4 (7): e1000101. Bibcode :2008PLSCB...4E0101S. doi : 10.1371/journal.pcbi.1000101 . PMC 2536508. PMID 18795145 .
- ^ Bateman, Alex; Pearson, William R; Stein, Lincoln D; Stormo, Gary D; Yates, John R, 編 (2002). Current Protocols in Bioinformatics - Wiley Online Library . Wiley. CiteSeerX 10.1.1.419.8061 . doi :10.1002/0471250953. ISBN 9780471250951。