フィッシュベース

フィッシュベース
コンテンツ
説明	魚に関する大規模かつ広範囲にアクセスされる生物学データベース
; キャプチャされたデータの種類	分類、生体測定、行動、分布、生息地、写真を含む包括的な種のデータ
生物	成魚種（魚類）
接触
研究センター	GEOMAR ヘルムホルツ海洋研究センターキール、FishBase コンソーシアムコーディネーター
著者	ダニエル・パウリー、ライナー・フローゼ
アクセス
Webサイト	フィッシュベース
ツール
スタンドアロン	歴史的なバージョンはCDで入手可能
その他
ライセンス	データについてはCC-BY-NC、メディアファイル（画像、音声など）については、ケースバイケースでさまざまなレベルのライセンスを確認する必要があります。
バージョン管理	毎年偶数月
データ公開; 頻度	継続的に更新
バージョン	最新バージョン: 2024年2月
キュレーションポリシー	フィッシュベースコンソーシアム
ブックマーク可能な; エンティティ	はい

FishBaseは、魚類（特に魚類）の世界的な種データベースです。^[1]これは、ウェブ上で最大かつ最も広くアクセスされている成魚類のオンラインデータベースです。^[2]時間の経過とともに、「動的で多用途な生態学的ツールに進化」し、学術出版物で広く引用されています。^[3]^[4]^[5]

FishBaseは、分類、地理的分布、生体測定学と形態、行動と生息地、生態学と個体群動態、生殖、代謝、遺伝データに関する情報を含む包括的な種のデータを提供します。栄養ピラミッド、識別キー、生物地理学的モデリング、漁業統計などのツールにアクセスでき、 LarvalBase、GenBank、IUCNレッドリスト、魚類カタログなどの他のデータベースの情報への種レベルの直接リンクがあります。^[6]

2024年2月現在、FishBaseには35,600種の魚と亜種^{[アップデート]}の説明、329,500種の一般名、64,000枚の写真、61,700件の科学文献への参照が含まれています。このサイトには毎月約70万人が訪れます。^[7]

歴史

FishBase の起源は 1970 年代に遡ります。当時、水産学者のDaniel Pauly氏は、魚の成長能力がえらのサイズによってどのように影響を受けるかという仮説を検証するのに苦労していました。^[8]このような仮説は、大量の経験的データが利用可能であった場合にのみ検証できます。^[9]当時の水産管理では、魚の成長と死亡率の推定を必要とする分析モデルが使用されていました。^[10]水産学者や管理者が関心のある種について必要な情報を入手するのは難しい場合があります。関連する事実が多数のジャーナル記事、レポート、ニュースレター、その他の情報源に散在して埋もれている可能性があるためです。そのような情報を必要とする開発途上国の人々にとっては特に困難です。Pauly 氏は、水産管理者が必要な量のデータにアクセスできる唯一の実際的な方法は、出版された文献で入手可能なすべてのデータを、中央の簡単にアクセスできるリポジトリに集めて統合することであると信じていました。^[9]^[11]^[9]これは、科学者や管理者が新しい仮説をテストする必要があるときに、利用可能なデータがすでに検証されアクセス可能な形式で存在しており、新しいデータセットを作成して検証する必要がないことを意味します。^[12]

Pauly はRainer Froeseを採用し、この方向でソフトウェアデータベースの基礎が 1988 年に構築されました。当初は熱帯魚に限定されていたこのデータベースは、FishBase の原型となりました。その後、FishBase はすべての魚類を網羅するように拡張され、 1996 年 8 月にWeb上で公開されました。現在では、世界最大かつ最もアクセス数の多い魚類のオンラインデータベースとなっています。^[9] 1995 年に最初のCD-ROMが「FishBase 100」としてリリースされました。その後、毎年 CD がリリースされています。このソフトウェアは、Microsoft Windowsでのみ動作するMicrosoft Access上で動作します。

FishBase は成魚の魚類をカバーしているが、魚類の初期段階や幼魚段階の詳細は扱っていない。1999 年に、Bernd Ueberschär の監督の下、補完的なデータベースであるLarvalBaseがオンラインになった。このデータベースは魚類プランクトンと幼魚段階をカバーしており、魚の卵と幼生に関する詳細なデータ、魚の識別、養殖における幼魚の飼育に関連するデータが含まれている。 FishBase の成功を受けて、魚類以外の水生生物を網羅するデータベースの需要が高まり、その結果、2006 年にSeaLifeBaseが誕生した。^[9] SeaLifeBase の長期目標は、FishBase をモデルにした情報システムを開発することだが、FishBase が専門とする魚類以外の、海水と淡水の両方の水生生物をすべてカバーすることである。このカテゴリには、合計で約 30 万種の既知の種がある。^[13]

組織

FishBaseの認知度が魚類専門家の間で高まるにつれ、2,480人以上の貢献者と協力者が集まりました。2000年以来、FishBaseは9つの国際機関のコンソーシアムによって監督されてきました。FishBaseコンソーシアムは12のメンバーに成長しました。ドイツのキール海洋研究センター（GEOMAR）のGEOMAR – Helmholtz海洋研究センターが調整機関として機能し^[14]^[15]、2017年2月からQuantitative Aquatics, Inc.が管理機関として機能しています。^[16]

参照

参考文献

^ Froese R および Pauly D (編) (2000) FishBase 2000: 概念、設計、およびデータソース。ICLARM。フィリピン。
^海洋フェロー：ライナー・フローゼ、 Wayback Machineに 2013 年 12 月 21 日にアーカイブPew Environment Group。
^ Stergiou KI および Tsikliras AC (2006) FishBase の科学的影響: 引用分析 Archived 8 October 2011 at the Wayback Machine In: Palomares MLD, Stergiou KI and Pauly D (eds.), Fishes in Databases and Ecosystems . UBC Fisheries Centre , Research reports 14 (4): 2–6.
^ 参考文献 FishBase を引用 FishBase. 最終更新日 2010 年 7 月 5 日。2011 年 7 月 20 日に取得。
^ ハンフリーズ、オースティン; ディマルコプロウ、ドナ; ステルギウ、コンスタンティノス; ツィクリラス、アタナシオス; パロマレス、デング; バイリー、ニコラス; ナウエン、コーネリア; ルナ、スーザン; バナシハン、ライラ; フローズ、ライナー; パウリー、ダニエル (2023). 「30年後のFishBaseの科学的影響の測定」(PDF) .サイビウム. 47 (3): 213–224. doi :10.26028/cybium/2023-002.
^ Gert B および Snoeks J (2004)「FishBase: 百科事典および研究ツール」48 ページ、VLIZ Special Publication 17、ブルージュ、ベルギー。
^ FishBaseのウェブページによると、2023年11月にアクセス。
^ Bakun A (2011)「酸素制約」11～23ページ。Villy ChristensenおよびJay Maclean（編）『漁業への生態系アプローチ：グローバルな視点』、ケンブリッジ大学出版局。ISBN 978-0-521-13022-6。
^ abcde Palomares MLDとBailly N (2011)「海洋生物多様性情報の整理と普及：FishbaseとSeaLifeBaseの物語」24～46ページ。Villy ChristensenとJay Maclean（編）『漁業への生態系アプローチ：世界的な視点』、ケンブリッジ大学出版局。ISBN 978-0-521-13022-6。
^ Monro JL (2011)「熱帯魚の搾取された資源の評価：概要」171～188ページ。Villy ChristensenとJay Maclean（編）『漁業への生態系アプローチ：世界的な視点』、ケンブリッジ大学出版局。ISBN 978-0-521-13022-6。
^ LarvalBase: 魚類幼生に関する世界的情報システム Archived 28 March 2012 at the Wayback Machine American Fisheries Society、Early Life History Section Newsletter、2002年5月、23 (2): 7–9。
^ Froese R (2011)「FishBaseの科学」47～54ページ。Villy ChristensenとJay Maclean（編）『漁業への生態系アプローチ：グローバルな視点』、ケンブリッジ大学出版局。ISBN 978-0-521-13022-6。
^ SeaLifeBase – ホームページ 2011年8月14日アーカイブ、Wayback Machine。2011年7月21日閲覧。
^ FishBaseホームページ。2018年11月28日閲覧。
^ 「生態学、個体群動態、漁業：FishBase」IFM-GEOMAR、キール。2012年3月24日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2014年1月27日閲覧。
^ 「About Us – Quantitative Aquatics, Inc」2023年9月22日閲覧。
^ ライプニッツ海洋科学研究所、Wayback Machine (IFM-GEOMAR) で 2011 年 7 月 7 日にアーカイブ。メイン Web サイト。
^ Fishbase と Aristotle University Archived 27 March 2012 at the Wayback Machine Aristotle University of Thessaloniki、2006 年 8 月 5 日。

さらに読む

Bailly N (2010) 魚類カタログと FishBase バージョン 2 の学名の評価に矛盾が生じる理由、2010 年 5 月 6 日。
Bailly N、Reyes Jr R、Atanacio R、Froese R (2010) 「FishBase の簡易識別ツール」出典: Nimis PL および Vignes Lebbe R. (編)生物多様性を識別するためのツール: 進歩と問題、31 ～ 36 ページ。ISBN 978-88-8303-295-0。
クリステンセン V、CJ ウォルターズ、R アーレンス、J アルダー、J ブゾウスキー、LB クリステンセン、WWL チャン、J ダン、R フローゼ、V カルプージ、K カシュナー、K カーニー、S ライ、V ラム、MLD パロマレス、A ピーターズメイソン、 C ピロッディア、JL サルミエント、J スティーンビーク、R スマイラ、R ワトソン、D ゼラーおよび D Pauly (2009) 世界の大規模海洋生態系のデータベース駆動モデル生態学的モデリング、220 (17): 1984–1996。
Froese R (2011)「フィッシュベースの科学」Villy Christensenおよび Jay Maclean (編) 『漁業への生態系アプローチ: グローバルな視点』、ケンブリッジ大学出版局、47～54 ページ。ISBN 978-0-521-13022-6。
Froese R および Pauly D (編) (2000) FishBase 2000: 概念、設計、およびデータソース ICLARM、フィリピン。
Froese RとPauly D（1994）「カレイ類の生活史パターンを比較するためのツールとしてのFishbase」Netherlands Journal of Sea Research、32（3/4）：235–239。
Nauen CE (2004) 持続可能な漁業を支援する世界の魚類に関する公開電子アーカイブ CTA/連邦事務局セミナー、ACP-EU 漁業関係に関する専門家会議、ブリュッセル。
Palomares, MLD, N. Bailly および D. Pauly (2009) FishBase、SeaLifeBase およびデータベース駆動型生態系モデリング p. 156–158。In: MLD Palomares、L. Morissette、A. Cisnero-Montemayor、D. Varkey、M. Coll および C. Piroddi (編) Ecopath 25 Years Conference Proceedings: Extended Abstracts。UBC Fisheries Centre Research Reports 17 (3)。
Pauly D (1997)「FishBaseの科学」EC漁業協力紀要、 10 (2):4–6。
Robertson R (2008)「海洋魚類に関する地球規模の生物地理学的データベース：買主の責任」多様性と分布、 14 (6): 891–892。
Ueberschär B および Teltow M (1999)「FishBase が釣りに出かける」^{[永久リンク切れ‍ ]} Bulletin、12 (2–3): 38–39。

外部リンク

FishBaseオンライン
台湾の魚類データベース
アフリカのフィッシュベース
FishBase FishBlog (FishBase に関する情報)
FishBase がキールサイエンスニュースラインで 20 周年を祝う ( 2010 年 9 月 3 日)。
FishBase Blue Zooの Rainer Froese さん。
中央アフリカ王立博物館 (RMCA Tervuren) のFishBase における魚の形態と識別、2007 年の FishBase および魚類分類トレーニングセッションでのプレゼンテーション。
第 6 回 FishBase コンソーシアム会議および第 3 回ミニ FishBase シンポジウムFishBytes、2005 年。
2008年9月2日、中国水産科学アカデミーで開催された2008年FishBaseシンポジウム。
Fish on line Daniel Pauly、Rainer Froese、Maria Lourdes Palomares。FishBase 情報システムを使用した魚類学の学習と指導に関するドラフトガイド。2005 年 1 月 17 日更新。

[1] Froese R および Pauly D (編) (2000) FishBase 2000: 概念、設計、およびデータソース。ICLARM。フィリピン。

[Pew-2] ^海洋フェロー：ライナー・フローゼ、 Wayback Machineに 2013 年 12 月 21 日にアーカイブPew Environment Group。

[3] Stergiou KI および Tsikliras AC (2006) FishBase の科学的影響: 引用分析 Archived 8 October 2011 at the Wayback Machine In: Palomares MLD, Stergiou KI and Pauly D (eds.), Fishes in Databases and Ecosystems . UBC Fisheries Centre , Research reports 14 (4): 2–6.

[4] 参考文献 FishBase を引用 FishBase. 最終更新日 2010 年 7 月 5 日。2011 年 7 月 20 日に取得。

[5] ハンフリーズ、オースティン; ディマルコプロウ、ドナ; ステルギウ、コンスタンティノス; ツィクリラス、アタナシオス; パロマレス、デング; バイリー、ニコラス; ナウエン、コーネリア; ルナ、スーザン; バナシハン、ライラ; フローズ、ライナー; パウリー、ダニエル (2023). 「30年後のFishBaseの科学的影響の測定」(PDF) .サイビウム. 47 (3): 213–224. doi :10.26028/cybium/2023-002.

[6] Gert B および Snoeks J (2004)「FishBase: 百科事典および研究ツール」48 ページ、VLIZ Special Publication 17、ブルージュ、ベルギー。

[7] FishBaseのウェブページによると、2023年11月にアクセス。

[Bakun-8] Bakun A (2011)「酸素制約」11～23ページ。Villy ChristensenおよびJay Maclean（編）『漁業への生態系アプローチ：グローバルな視点』、ケンブリッジ大学出版局。ISBN 978-0-521-13022-6。

[Palomares_and_Bailly-9] Palomares MLDとBailly N (2011)「海洋生物多様性情報の整理と普及：FishbaseとSeaLifeBaseの物語」24～46ページ。Villy ChristensenとJay Maclean（編）『漁業への生態系アプローチ：世界的な視点』、ケンブリッジ大学出版局。ISBN 978-0-521-13022-6。

[10] Monro JL (2011)「熱帯魚の搾取された資源の評価：概要」171～188ページ。Villy ChristensenとJay Maclean（編）『漁業への生態系アプローチ：世界的な視点』、ケンブリッジ大学出版局。ISBN 978-0-521-13022-6。

[AFS-11] LarvalBase: 魚類幼生に関する世界的情報システム Archived 28 March 2012 at the Wayback Machine American Fisheries Society、Early Life History Section Newsletter、2002年5月、23 (2): 7–9。

[12] Froese R (2011)「FishBaseの科学」47～54ページ。Villy ChristensenとJay Maclean（編）『漁業への生態系アプローチ：グローバルな視点』、ケンブリッジ大学出版局。ISBN 978-0-521-13022-6。

[home-13] SeaLifeBase – ホームページ 2011年8月14日アーカイブ、Wayback Machine。2011年7月21日閲覧。

[14] FishBaseホームページ。2018年11月28日閲覧。

[15] 「生態学、個体群動態、漁業：FishBase」IFM-GEOMAR、キール。2012年3月24日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2014年1月27日閲覧。

[16] 「About Us – Quantitative Aquatics, Inc」2023年9月22日閲覧。

[17] ライプニッツ海洋科学研究所、Wayback Machine (IFM-GEOMAR) で 2011 年 7 月 7 日にアーカイブ。メイン Web サイト。

[18] Fishbase と Aristotle University Archived 27 March 2012 at the Wayback Machine Aristotle University of Thessaloniki、2006 年 8 月 5 日。