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2006年のFAIカップは、アイルランドサッカー協会チャレンジカップ（FAIカップ）の第86回大会でした。今シーズンの大会は、カールスバーグがスポンサーを務めた最後の大会となりました。大会は4月下旬に正式に開幕し、ジュニアリーグとインターミディエイトリーグの20クラブが、2回戦でアイルランドリーグのチームと対戦する権利をかけて戦いました。これらの対戦の勝者10チームに、2回戦からアイルランドリーグの22クラブが加わりました。大会は12月上旬まで続き、決勝は12月3日（日）に行われました。
2006年4月23日（土）の週末に行われた試合。[ 1 ]
2006年5月28日（日）の週末に行われた試合。[ 2 ]
2006年8月27日（日）の週末に行われた試合。
10月1日（日）を含む週末に行われた試合。
決勝戦は、旧ランズダウン・ロードで行われた最後の決勝戦となった。