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| 膜貫通型エキソソルターゼ (Exosortase_EpsH) | |||||||||
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| 識別子 | |||||||||
| シンボル | エクソソルターゼ_EpsH | ||||||||
| パム | PF09721 | ||||||||
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エキソソルターゼはグラム陰性細菌に存在し、カルボキシル末端選別シグナルPEP-CTERMを認識して切断する膜貫通タンパク質ファミリーを指す。 [1] [2]この名称は、検出可能な配列相同性がないにもかかわらず、ソルターゼに類似した役割が予測されることと、エキソソルターゼ遺伝子が細胞外多糖類または細胞外高分子物質生合成遺伝子座と強く関連していることに由来する。多くの古細菌は、ソルターゼではなくエキソソルターゼに相同なアーキオソルターゼを有する。アーキオソルターゼAは、一部の古細菌S層タンパク質のC末端にあるシグナルPGF-CTERMを認識する。アーキオソルターゼAによる処理後、PGF-CTERM領域はなくなり、代わりにプレニル由来の脂質アンカーがC末端に存在する。
エキソソルターゼ自体は生化学的に特徴付けられていない。しかし、エキソソルターゼの古細菌相同体であるアーキオソルターゼAに対する部位特異的変異誘発研究は、Cys活性部位の概念とソルターゼファミリートランスペプチダーゼとの収斂進化を強く支持している。[3]活性汚泥廃水処理施設で見つかった細菌であるZoogloea resiniphilaに関する最近の研究では、PEP-CTERMタンパク質（および暗にエキソソルターゼも）がいくつかのシステムにおけるフロック形成に不可欠であることが示された。[4]
参考文献
- ^ Haft DH、Paulsen IT、Ward N、Selengut JD (2006 年 8 月)。「環境生物における細胞外多糖類関連タンパク質の選別: PEP-CTERM/EpsH システム。新しい系統発生プロファイリング ヒューリスティックの応用」。BMC Biology。4 : 29。doi : 10.1186 / 1741-7007-4-29。PMC 1569441。PMID 16930487 。
- ^ Haft DH、Payne SH 、 Selengut JD (2012年1月)。「アーキオソルターゼとエキソソルターゼは、膜通過と翻訳後修飾を結び付ける広く分布したシステムです」。Journal of Bacteriology。194 ( 1): 36– 48。doi :10.1128 / JB.06026-11。PMC 3256604。PMID 22037399。
- ^ Abdul Halim MF、Rodriguez R、Stoltzfus JD、Duggin IG、Pohlschroder M (2018年5月)。「保存された残基はHaloferax volcaniiアーキオソルターゼの触媒活性に不可欠：古細菌と細菌由来の非相同ソルターゼの触媒メカニズムの収束進化への影響」。分子微生物学。108 （ 3）：276-287。doi：10.1111/ mmi.13935。PMID 29465796 。
- ^ Gao N, Xia M, Dai J, Yu D, An W, Li S, Liu S, He P, Zhang L, Wu Z, Bi X, Chen S, Haft DH, Qiu D (2018年5月). 「広範囲に分布するPEP-CTERMタンパク質と細胞外多糖の両方が、Zoogloea resiniphilaとその他の活性汚泥細菌のフロック形成に必要である」.環境微生物学. 20 (5): 1677– 1692. doi :10.1111/1462-2920.14080. PMID 29473278. S2CID 4341022. 2021年1月21日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2019年12月14日閲覧。