欧州ゲノムフェノムアーカイブ

欧州ゲノムフェノムアーカイブ
プロデューサー	欧州分子生物学研究所-欧州バイオインフォマティクス研究所、ゲノム制御センター（イギリスおよびスペイン）
言語	英語
アクセス
料金	無料
カバレッジ
分野	生物医学
フォーマット範囲	データセット
リンク
Webサイト	EGA公式ポータル

欧州ゲノム・フェノムアーカイブ（EGA ）は、英国とスペインにあるヒトの生体分子および表現型データのリポジトリです^[1]。^[2]^{[3]生物医学研究プログラムによって生成された、識別可能なすべての}遺伝データ、表現型および臨床データを安全に保管します。^[4]

2022年3月現在、世界中の1,000以上の機関から4,500件以上の研究調査に関するデータを保存・収集しています。^[2]

歴史

EGAは、安全な保管と、研究対象者が署名した同意書を尊重する方法で、許可された研究者のみへの配布を必要とするヒトゲノムデータの自主的なアーカイブ化と配布をサポートするために、欧州分子生物学研究所の欧州バイオインフォマティクス研究所（EMBL-EBI）によって2008年に設立されました。その後、EGAはバルセロナのゲノム規制センター（CRG）との協力範囲を拡大しました。^[5]

制御されたアクセス

アクセスを規制し、患者の機密性を保護し、アクセス制御されたデータを閲覧する権限を持つ研究者や臨床医にアクセスを提供するために必要なセキュリティを提供します。ただし、データアクセスに関する決定はEGAではなく、適切なデータアクセス許可組織（DAO）によって行われます。^[6]

外部リンク

ega-archive.org

参考文献

^ Fernández-Orth D、Lloret-Villas A、De Argila JR (2019 年 6 月)。「欧州ゲノムフェノムアーカイブ (EGA) - 今後 10 年間の詳細なソリューション」。2019 IEEE 第 32 回コンピュータベース医療システム国際シンポジウム ( CBMS )。pp. 4–6。doi :10.1109/ CBMS.2019.00011。ISBN 978-1-7281-2286-1. S2CID 199490012。
^ ab Morello F (2022年3月15日). 「機密性の高い研究データの公開と再利用のための連合型欧州ゲノムフェノムアーカイブの設立に向けた協力」CSC 。 2022年9月21日閲覧。
^ Lappalainen I、Almeida-King J、Kumanduri V、Senf A、Spalding JD、Ur-Rehman S、他 (2015 年 7 月)。「生物医学研究のために同意されたヒトデータの欧州ゲノムフェノムアーカイブ」。Nature Genetics . 47 (7): 692–695. doi :10.1038/ng.3312. PMC 5426533 . PMID 26111507。
^ Freeberg MA, Fromont LA, D'Altri T, Romero AF, Ciges JI, Jene A, et al. (2022年1月). 「2021年の欧州ゲノムフェノムアーカイブ」. Nucleic Acids Research . 50 (D1): D980–D987. doi :10.1093/nar/gkab1059. PMC 8728218 . PMID 34791407.
^ Lappalainen I、Almeida-King J、Kumanduri V、Senf A、Spalding JD、Ur-Rehman S、他 (2015 年 7 月)。「生物医学研究のために同意されたヒトデータの欧州ゲノムフェノムアーカイブ」。Nature Genetics . 47 (7): 692–695. doi :10.1038/ng.3312. PMC 5426533 . PMID 26111507。
^ 「The European Genome-phenome Archive」www.re3data.org . 2022年9月21日閲覧。

[1] Fernández-Orth D、Lloret-Villas A、De Argila JR (2019 年 6 月)。「欧州ゲノムフェノムアーカイブ (EGA) - 今後 10 年間の詳細なソリューション」。2019 IEEE 第 32 回コンピュータベース医療システム国際シンポジウム ( CBMS )。pp. 4–6。doi :10.1109/ CBMS.2019.00011。ISBN 978-1-7281-2286-1. S2CID 199490012。

[:0-2] Morello F (2022年3月15日). 「機密性の高い研究データの公開と再利用のための連合型欧州ゲノムフェノムアーカイブの設立に向けた協力」CSC 。 2022年9月21日閲覧。

[3] Lappalainen I、Almeida-King J、Kumanduri V、Senf A、Spalding JD、Ur-Rehman S、他 (2015 年 7 月)。「生物医学研究のために同意されたヒトデータの欧州ゲノムフェノムアーカイブ」。Nature Genetics . 47 (7): 692–695. doi :10.1038/ng.3312. PMC 5426533 . PMID 26111507。

[4] Freeberg MA, Fromont LA, D'Altri T, Romero AF, Ciges JI, Jene A, et al. (2022年1月). 「2021年の欧州ゲノムフェノムアーカイブ」. Nucleic Acids Research . 50 (D1): D980–D987. doi :10.1093/nar/gkab1059. PMC 8728218 . PMID 34791407.

[5] Lappalainen I、Almeida-King J、Kumanduri V、Senf A、Spalding JD、Ur-Rehman S、他 (2015 年 7 月)。「生物医学研究のために同意されたヒトデータの欧州ゲノムフェノムアーカイブ」。Nature Genetics . 47 (7): 692–695. doi :10.1038/ng.3312. PMC 5426533 . PMID 26111507。

[6] 「The European Genome-phenome Archive」www.re3data.org . 2022年9月21日閲覧。