エピソーム

エピソームは特殊なタイプのプラスミドで、真核生物のゲノムに組み込まれずに一部として残る。エピソームは、ゲノムの残りの部分と一緒に複製し、その後有糸分裂中に中期染色体と結合することでこれを実現する。エピソームは標準的なプラスミドとは異なり分解せず、真核生物の細胞核内でエピジェネティックにサイレンシングされないように設計することができる。^{[1]エピソームは、}アデノ随伴ウイルスまたはエプスタイン・バーウイルスによる特定のタイプの長期感染で自然界で観察される。2004年には、非ウイルス性エピソームが遺伝子発現の長期的な変化のための遺伝子治療に使用できる可能性があることが提案された。^[2]

1999年時点では、標準的なプラスミドをエピソームに保持できるDNA （デオキシリボ核酸）配列が数多く知られていました。その一例がS/MAR配列です。^[3]

エピソーム保持の長さは遺伝子構成によってかなり異なり、エピソームの配列には、運ばれるトランスジーンの遺伝子発現の長さと安定性に影響を与える多くの既知の特徴があります。これらの特徴の中には、エピソームによって運ばれるトランスジーンのエピジェネティックサイレンシングに寄与するCpG部位の数があります。 ^[4]

エピソーム保持のメカニズム

S/MARエピソームの場合のエピソーム保持のメカニズムは、一般的にはまだ不明です。1985年時点では、潜伏性エプスタイン・バーウイルス感染の場合、エピソームは一連のウイルスタンパク質を介して宿主細胞の核タンパク質と関連しているようでした。^[5]

原核生物のエピソーム

原核生物のエピソームは、原核生物の染色体から分離したり、染色体に組み込まれたりすることができる特殊な配列である。^[6]

参考文献

^ Van Craenenbroeck, Kathleen; Vanhoenacker, Peter; Haegeman, Guy (2000 年 9 月)。「哺乳類細胞における遺伝子発現のためのエピソームベクター: 真核生物遺伝子発現のためのエピソームベクター」。European Journal of Biochemistry . 267 (18): 5665–5678. doi :10.1046/j.1432-1327.2000.01645.x. PMID 10971576。
^ Conese M、Auriche C、Ascenzioni F (2004年12 月)。「遺伝子治療の進歩と展望: エピソーム的に維持される自己複製システム」。遺伝子治療。11 (24): 1735–1741。doi :10.1038/sj.gt.3302362。PMID 15385951。S2CID 34565556。
^ Piechaczek C、Fetzer C、Baiker A、Bode J、Lipps HJ (1999 年 1 月)。「SV40 複製起点と染色体 S/MAR に基づくベクターは CHO 細胞でエピソーム的に複製する」。核酸研究。27 ( 2 ) : 426–428。doi :10.1093 / nar/27.2.426。PMC 148196。PMID 9862961。
^ Haase R, Argyros O, Wong SP, Harbottle RP, Lipps HJ, Ogris M, et al. (2010年3月). 「pEPito: 哺乳類細胞用の大幅に改良された非ウイルス性エピソーム発現ベクター」BMC Biotechnology . 10 (1): 20. doi : 10.1186/1472-6750-10-20 . PMC 2847955 . PMID 20230618.
^ Rawlins DR、Milman G 、 Hayward SD、Hayward GS（1985年10月）。「プラスミド維持領域内のクラスター部位へのエプスタイン・バーウイルス核抗原（EBNA-1）の配列特異的DNA結合」。Cell。42 （3 ）：859–868。doi ：10.1016/0092-8674（85）90282-X。PMID 2996781。S2CID 9342392 。
^ キャンベル、アラン（1974）、キング、ロバートC.（編）、"エピソーム"、細菌、バクテリオファージ、および菌類：第1巻、ボストン、マサチューセッツ州：シュプリンガーUS、pp. 295–307、doi：10.1007/978-1-4899-1710-2_18、ISBN 978-1-4899-1710-2、2022-06-25取得

[1] Van Craenenbroeck, Kathleen; Vanhoenacker, Peter; Haegeman, Guy (2000 年 9 月)。「哺乳類細胞における遺伝子発現のためのエピソームベクター: 真核生物遺伝子発現のためのエピソームベクター」。European Journal of Biochemistry . 267 (18): 5665–5678. doi :10.1046/j.1432-1327.2000.01645.x. PMID 10971576。

[2] Conese M、Auriche C、Ascenzioni F (2004年12 月)。「遺伝子治療の進歩と展望: エピソーム的に維持される自己複製システム」。遺伝子治療。11 (24): 1735–1741。doi :10.1038/sj.gt.3302362。PMID 15385951。S2CID 34565556。

[3] Piechaczek C、Fetzer C、Baiker A、Bode J、Lipps HJ (1999 年 1 月)。「SV40 複製起点と染色体 S/MAR に基づくベクターは CHO 細胞でエピソーム的に複製する」。核酸研究。27 ( 2 ) : 426–428。doi :10.1093 / nar/27.2.426。PMC 148196。PMID 9862961。

[4] Haase R, Argyros O, Wong SP, Harbottle RP, Lipps HJ, Ogris M, et al. (2010年3月). 「pEPito: 哺乳類細胞用の大幅に改良された非ウイルス性エピソーム発現ベクター」BMC Biotechnology . 10 (1): 20. doi : 10.1186/1472-6750-10-20 . PMC 2847955 . PMID 20230618.

[5] ^ Rawlins DR、Milman G 、 Hayward SD、Hayward GS（1985年10月）。「プラスミド維持領域内のクラスター部位へのエプスタイン・バーウイルス核抗原（EBNA-1）の配列特異的DNA結合」。Cell。42 （3 ）：859–868。doi ：10.1016/0092-8674（85）90282-X。PMID 2996781。S2CID 9342392 。

[6] キャンベル、アラン（1974）、キング、ロバートC.（編）、"エピソーム"、細菌、バクテリオファージ、および菌類：第1巻、ボストン、マサチューセッツ州：シュプリンガーUS、pp. 295–307、doi：10.1007/978-1-4899-1710-2_18、ISBN 978-1-4899-1710-2、2022-06-25取得