バプテスト派のほとんどのグループは会衆制を採用しているが、中には異なる教会組織を持ち、監督制の統治体制を採用しているグループもある。そのような教会では、地元の信徒の自治権は少なく、監督が牧師の任命や資金の分配などを行い、教会全体を統括する。
ジョージア福音バプテスト連合は司教制を採用しており、大司教が首座司教を務めている。トビリシの平和大聖堂の司祭であるマルハズ・ソングラシュヴィリ大司教は、カリスマ的な人物であり、社会活動家でもある。
ラトビアのバプテスト教会は、ドイツとラトビアのルター派信徒の間で起こった復興運動から生まれ、1861年に最初の教会を設立した。この教会連合は司教によって率いられている。
Église Épiscopale Baptiste は、コンゴ民主共和国のバプテスト派です。福音派の宣教師たちがバプテストの教義を受け入れ、司教制を維持したままこの宗派を組織したことから始まりました。教会は 1956 年に自治権を獲得しました。[ 1 ]
2007年当時、司教は10名、洗礼を受けた信徒は10万5000名で、管轄する教区は110箇所に及んでいた。信徒のほとんどはコンゴ民主共和国の9つの州におり、一部はアンゴラとザンビアにいた。牧師は司教の監督下にあり、司教から教会が割り当てられる。
EPBは世界教会協議会およびコンゴ・キリスト教会の加盟団体です。
アフリカ系アメリカ人のバプテスト教会の中には、教会の政治体制を変えることなく、主任牧師を司教と称したり、司教と呼んだりするようになったところもある。全米バプテスト連盟(USA)の信仰告白では、司教と牧師は同義であると教えている。 [ 2 ]フルゴスペルバプテスト教会フェローシップでは、司教と牧師は別々の役職である。
北インド合同教会は、その憲章においてバプテスト派を受け入れており、2006年にはバプテスト派のサムソン・ダスをカタックの司教に叙任した。
私たちは、聖書は、キリストの目に見える教会は、福音の信仰と交わりにおいて契約によって結びついた洗礼を受けた信者の集まりであり、キリストの儀式を守り、キリストの律法によって統治され、キリストの言葉によって与えられた賜物、権利、特権を行使するものであると教えていると信じています。また、聖書に基づく唯一の役員は、テモテへの手紙とテトスへの手紙で資格、権利、義務が定義されている監督または牧師と執事であるとも信じています。