エキノマイシン

エキノマイシン
名前
	その他の名前キノマイシンA; レボマイシン
識別子
CAS番号	512-64-1 ;
3Dモデル（JSmol）	インタラクティブ画像;
ケムスパイダー	5257063 ;
ECHA 情報カード	100.164.832
パブケム CID	6857732;
ユニ	TG824J6RQT ;
CompTox ダッシュボード ( EPA )	DTXSID5031266;
	InChI InChI=1S/C51H64N12O12S2/c1-25(2)38-49(72)74-22-36(59-42(65)34-21-53-30-17-13-15-19-32(30) 57-34) 44(67)55-28(6)46(69)63(10)40-48(71)62(9)39(26(3)4)50(73)75-23-35(58-41( 64)33-20-52-29-16-12-14-1 8-31(29)56-33)43(66)54-27(5)45(68)60(7)37(47(70)61(38)8)24-77-51(40)76- 11/h12-21,25-28,35-40,51H,22-24H2,1-11H3,(H,54,66)(H,55,67)(H,58,64)(H,59, 65)/t27-,28-,35+,36+,37-,38-,39-,40+,51?/m0/s1 キー: AUJXLBOHYWTPFV-VITLIGDRSA-N ; InChI=1/C51H64N12O12S2/c1-25(2)38-49(72)74-22-36(59-42(65)34-21-53-30-17-13-15-19-32(30) 57-34)4 4(67)55-28(6)46(69)63(10)40-48(71)62(9)39(26(3)4)50(73)75-23-35(58-41( 64)33-20-52-29-16-12-14-1 8-31(29)56-33)43(66)54-27(5)45(68)60(7)37(47(70)61(38)8)24-77-51(40)76- 11/h12-21,25-28,35-40,51H,22-24H2,1-11H3,(H,54,66)(H,55,67)(H,58,64)(H,59, 65)/t27-,28-,35+,36+,37-,38-,39-,40+,51?/m0/s1 キー: AUJXLBOHYWTPFV-VITLIGDRBO;
	笑顔 C[C@H]1C(=O)N([C@H]2CSC([C@@H](C(=O)N([C@H](C(=O)OC[C@H](C(=O)N1)NC(=O)c3cnc4ccccc4n3)C(C)C)C)N(C(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](COC(=O)[C@@H](N(C2=O)C)C(C)C)NC(=O)c5cnc6ccccc6n5)C)C)SC)C;
プロパティ
化学式	Ｃ５１Ｈ６４Ｎ１２Ｏ１２Ｓ２
モル質量	1101.26グラム/モル
	特に記載がない限り、データは標準状態（25 °C [77 °F]、100 kPa）の材料に関するものです。確認する（何ですか？）インフォボックス参照

1 から 2 への生体内変換のための提案された酵素反応メカニズム。

エキノマイシンはペプチド抗生物質です。2つのペプチドが二量体となって環状構造を形成しています。二量体化した環状ペプチドコアに結合した二環式芳香族発色団とチオアセタール架橋を含んでいます。DNAの2つの特定の部位に挿入され、低酸素誘導因子1α（HIF1α）の結合を阻害します。 ^[1]

生合成

エキノマイシンはビスインターカレーターペプチドであり、ユニークな非リボソームペプチド合成酵素（NRPS）によって生合成されます。 ^[2]^{[3]エキノマイシンは、}ストレプト マイセス・ラサリエンシスなどのさまざまな細菌から単離されます。キノキサリン系抗生物質のファミリーに属します。この化合物群は、非常に強力な抗菌、抗癌、抗ウイルス活性を有するため、大きな関心を集めています。^[4]

エキノマイシンの生合成は分子 QC から始まります。L-トリプトファンは QC の前駆体であり、その生合成はニコマイシン生合成の第一段階と並行しています。^{[引用が必要]}

QC が生合成された後、アデニル化ドメインを含む Ecm1 が脂肪酸生合成アシルキャリアタンパク質(ACP) を使用して QC を活性化し、FabC に転移します。最初のモジュールである Ecm6 は、スターターユニットとして QC-SFabC を受け入れます。Emc7 には末端チオエステラーゼドメインが含まれており、これによりペプチドが二量体化して放出されます。この環化生成物は次に酸化還元酵素である Ecm17 に進み、ジスルフィド結合を形成します。この生合成の最後のステップでは、ジスルフィド結合がチオアセタール架橋に変換されます。この変換は、 S-アデノシル-L-メチオニン(SAM) 依存性メチルトランスフェラーゼである Ecm18 内で行われます。^[4]このメカニズムは 2 つのステップで進行すると提案されています。最初に、Emc18 は SAM から活性化メチル基をジスルフィド結合の硫黄原子の 1 つに転移します。第二に、第三級スルホニウムカチオンへのαプロトンの脱プロトン化により、チオアセタール結合の形成のための転位が促進される。^[要出典]

エキノマイシンおよびその他のキノマイシン型抗生物質中の色素分子の提案された生合成。

参考文献

^ Kong D, Park EJ, Stephen A, Mellilo G (2005年10月1日). 「エキノマイシン、低酸素誘導因子1 DNA結合活性の小分子阻害剤」. Cancer Research . 65 (19): 9047–9055. doi :10.1158/0008-5472.CAN-05-1235. hdl : 2158/432131 . PMID 16204079. 2022年6月15日閲覧。
^渡辺健、小栗秀、及川秀（2009年4月）。「 化学酵素合成によるエキノマイシン分子構造の多様化と、改変したエキノマイシン生合成経路の異種発現」。Current Opinion in Chemical Biology。13 （2）：189–96。doi ：10.1016/ j.cbpa.2009.02.012。PMID 19278894 。
^ Sato M, Nakazawa T, Tsunematsu Y, Hotta K, Watanabe K (2013). 「エキノマイシン生合成」Current Opinion in Chemical Biology . 17 (4): 537–45. doi :10.1016/j.cbpa.2013.06.022. PMID 23856054.
^ ab Watanabe K, et al. (2006年8月). 「大腸菌における抗腫瘍性非リボソームペプチドの全生合成」. Nature Chemical Biology . 2 (8): 423–8. doi :10.1038/nchembio803. PMID 16799553. S2CID 40607322.

[1] Kong D, Park EJ, Stephen A, Mellilo G (2005年10月1日). 「エキノマイシン、低酸素誘導因子1 DNA結合活性の小分子阻害剤」. Cancer Research . 65 (19): 9047–9055. doi :10.1158/0008-5472.CAN-05-1235. hdl : 2158/432131 . PMID 16204079. 2022年6月15日閲覧。

[Watanabe-2] ^渡辺健、小栗秀、及川秀（2009年4月）。「 化学酵素合成によるエキノマイシン分子構造の多様化と、改変したエキノマイシン生合成経路の異種発現」。Current Opinion in Chemical Biology。13 （2）：189–96。doi ：10.1016/ j.cbpa.2009.02.012。PMID 19278894 。

[pmid23856054-3] Sato M, Nakazawa T, Tsunematsu Y, Hotta K, Watanabe K (2013). 「エキノマイシン生合成」Current Opinion in Chemical Biology . 17 (4): 537–45. doi :10.1016/j.cbpa.2013.06.022. PMID 23856054.

[Watanabe2-4] Watanabe K, et al. (2006年8月). 「大腸菌における抗腫瘍性非リボソームペプチドの全生合成」. Nature Chemical Biology . 2 (8): 423–8. doi :10.1038/nchembio803. PMID 16799553. S2CID 40607322.