ダークタクソン

菌類学において、暗色菌類（複数形：暗色菌類、または暗色菌類^[1]）は、観察可能な形態学的構造を生成せず、実験室環境で培養することが不可能と思われる分類群である。暗色菌類は主にDNA配列決定、特に環境メタバーコーディングによって検出される。^[2]

暗色菌類は側系統群を構成し、主要な菌類系統のすべてに暗色菌類が出現する。^[2]暗色菌類は現存する菌類の分類群のかなりの部分を占めていると思われる。Wang et al. (2016) によると、「現存する菌類の多様性の大部分は、目に見える、または説明できる特徴的な形態学的構造を生み出さない」^[3]、Martin Ryberg によると、暗色菌類は「菌類界で支配的な生活様式である可能性が高い」^{[1] 。}

暗色分類群の命名は、タイプ標本を直接観察する必要があるため、 ICN ^[4]ではサポートされていません。

• Boyadzhieva, Iva (2023). 「すべての菌類は重要か？新しい研究はそう主張している」. eurekalert.org . 2023年8月29日閲覧。
• Nilsson RH、Larsson KH、Taylor A、Bengtsson-Palme J、Jeppesen TS、Schigel D、Kennedy P、Picard K、Glöckner FO、Tedersoo L、Saar I、Kõljalg U、Abarenkov K (2018)、「菌類の分子同定のための UNITE データベース: 暗色分類群と並列分類群の取り扱い」(PDF)、Nucleic Acids Research、47 (D1): D259 – D264、doi :10.1093/nar/gky1022、ISSN  0305-1048、PMC  6324048、PMID  30371820
• Nilsson RH、Ryberg M、Wurzbacher C、Tedersoo L、Anslan S、Põlme S、Spirin V、Mikryukov V、Svantesson S、Hartmann M、Lennartsdotter C、Belford P、Khomich M、Retter A、Corcoll N、Gómez Martinez D、Jansson T、Ghobad-Nejhad M、Vu D、Sanchez-Garcia M、Kristiansson E、Abarenkov K (2023)、「菌類学者が DNA ベースの類型化について問うべき問題は、問うべきかどうかではなく、どのように問うべきかである」、MycoKeys、96 : 143– 157、doi : 10.3897/mycokeys.96.102669、ISSN  1314-4057、PMC  10194844、PMID  37214179 、 2023-08-29取得
• Wang Z、Nilsson RH、James TY、Dai Y、Townsend JP (2016)、「ビッグデータ時代の真菌系統学の将来展望と課題」、Li DW (編)、Biology of Microfungi、Fungal Biology、Springer International Publishing、pp.  25– 46、doi :10.1007/978-3-319-29137-6_3、ISBN 978-3-319-29135-2
• Wijayawardene NN、Bahram M、Sánchez-Castro I、Dai DQ、Ariyawansa K、Jayalal U、Suwannarach N、Tedersoo L (2021)、「子嚢菌分類群の発見における文化依存および文化独立の方法への現在の洞察」、Journal of Fungi、7 (9): 703、土肥: 10.3390/jof7090703、ISSN  2309-608X、PMC  8467358、PMID  34575741 、 2023-08-29取得