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DXZ4は可変数のタンデム反復DNA配列である。ヒトでは、高度に保存されたCTCF結合部位を含む3kbのモノマーから構成される。CTCFは転写因子タンパク質であり、脊椎動物ゲノムにおけるクロマチンドメインの分割を担う主要な絶縁体である。[1]
CpGアイランドに豊富に含まれていることに加え、[2] DXZ4は長い非コードRNA(lncRNA)や機能不明の小さなRNAを転写します。 [3] [4] DXZ4の繰り返しコピー数は、ヒト集団内で高度に多型性があります(50〜100コピーの間で変動します)。DXZ4は、マクロサテライトとして定義される多くの大きなタンデムリピート遺伝子座の1つです。[2]ヒトではいくつかのマクロサテライトが記述されており、高いGC含有量、大きなリピートモノマー、集団内での繰り返しコピー数の高い変動性など、同様の特徴を共有しています。[2] DXZ4は、2つの大きな「スーパードメイン」間のヒンジポイントとして機能することにより、女性の体細胞内の不活性X染色体(Xi)のユニークな構造コンフォメーションに重要な役割を果たしています。[5]
DXZ4はドメイン間の主要な区分として機能するだけでなく、不活性なX染色体に沿った他の多くの繰り返し領域と長距離相互作用を形成します。[6] DXZ4遺伝子座のノックアウトにより、染色体全体のサイレンシングが維持された状態で、Xi上のこの構造的コンフォメーションが失われることが明らかになりました。[7]
参考文献
- ^ Ong CT 、Corces VG(2014年4月)。「CTCF:ゲノムトポロジーと機能を橋渡しする構造タンパク質」。Nature Reviews 。遺伝学。15 (4):234–46。doi : 10.1038/nrg3663。PMC 4610363。PMID 24614316。
- ^ abc Giacalone J、 Friedes J、 Francke U (1992 年 5 月)。「Xq24 の新しい GC に富むヒトマクロサテライト VNTR は、活性 X 染色体と非活性 X 染色体で異なるメチル化を受ける」。Nature Genetics。1 ( 2 ): 137–43。doi :10.1038/ng0592-137。PMID 1302007。S2CID 20003755 。
- ^ Chadwick BP (2008 年 8 月)。「DXZ4 クロマチンは周囲の染色体とは反対の構造をとり、CTCF とアンチセンス転写産物に関わる新しい不活性 X 特異的役割を獲得する」。ゲノム研究。18 ( 8 ): 1259–69。doi : 10.1101 /gr.075713.107。PMC 2493436。PMID 18456864 。
- ^ Pohlers M、 Calabrese JM、Magnuson T (2014年8月)。「ヒトマクロサテライトDXZ4からの小RNA発現」。G3 :遺伝子、 ゲノム、遺伝学。4 (10): 1981–9。doi :10.1534/g3.114.012260。PMC 4199704。PMID 25147189。
- ^ Deng X、Ma W、Ramani V、Hill A、Yang F、Ay F、Berletch JB、Blau CA、Shendure J、Duan Z、Noble WS、Disteche CM (2015 年 8 月)。「不活性マウス X 染色体の二分構造」。ゲノム生物 学。16 ( 1): 152。doi : 10.1186 / s13059-015-0728-8。PMC 4539712。PMID 26248554。
- ^ Rao SS、Huntley MH、Durand NC、Stamenova EK、Bochkov ID、Robinson JT、Sanborn AL、Machol I、Omer AD、Lander ES、Aiden EL (2014 年 12 月)。「キロベース解像度のヒトゲノムの 3D マップにより、クロマチンループの原理が明らかに」。Cell . 159 (7): 1665–80. doi :10.1016/ j.cell.2014.11.021 . PMC 5635824 . PMID 25497547。
- ^ Darrow EM、Huntley MH、Dudchenko O、Stamenova EK、Durand NC、Sun Z、他 (2016 年 8 月)。「ヒト不活性 X 染色体上の DXZ4 の欠失は高次ゲノム構造を変化させる」。米国 科学アカデミー紀要。113 ( 31 ): E4504-12。Bibcode :2016PNAS..113E4504D。doi : 10.1073 / pnas.1609643113。PMC 4978254。PMID 27432957。
