tRNA(シトシン-5-)-メチルトランスフェラーゼは、ヒトではTRDMT1遺伝子(以前はDNMT2と表記されていた)によってコードされる酵素である。[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]
CpGメチル化は、胚発生、インプリンティング、およびX染色体不活性化に重要なエピジェネティック修飾です。マウスを用いた研究では、DNAメチル化が哺乳類の発生に必要であることが示されています。この遺伝子はDNAメチルトランスフェラーゼに類似したタンパク質をコードしていますが、このタンパク質はメチルトランスフェラーゼ活性を示しません。このタンパク質はDNAに強く結合するため、ゲノム内の特定の配列をマークしている可能性があります。選択的スプライシングにより、異なるアイソフォームをコードする複数の転写バリアントが生じます。[ 8 ]
ヒトDNMT2はDNAをメチル化せず、代わりにアスパラギン酸トランスファーRNA( tRNA(Asp) )のアンチコドンループのシトシン38をメチル化することが示されている。[ 9 ]
参考文献
- 1 2 3 GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000107614 – Ensembl、2017年5月
- 1 2 3 GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000026723 – Ensembl、2017年5月
- ↑ 「ヒトPubMed参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ↑ 「マウス PubMed 参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ↑ Yoder JA、Bestor TH (1998年3月)。「分裂酵母のpmt1pに関連する哺乳類DNAメチルトランスフェラーゼ候補」。Hum Mol Genet。7 ( 2): 279–84。doi : 10.1093/ hmg / 7.2.279。PMID 9425235。
- ↑ Vilain A、Apiou F、Dutrillaux B、Malfoy B (1998年11月)。「in situハイブリダイゼーションによる候補DNAメチルトランスフェラーゼ遺伝子(DNMT2)のヒト染色体バンド10p15.1への割り当て」。Cytogenet Cell Genet . 82 ( 1–2 ):120. doi : 10.1159 /000015083 . PMID 9763678. S2CID 46803768 .
- ↑ Goll MG、Kirpekar F、Maggert KA、Yoder JA、Hsieh CL、Zhang X、Golic KG、Jacobsen SE、Bestor TH (2006 年 1 月)。「DNA メチルトランスフェラーゼ ホモログ Dnmt2 による tRNAAsp のメチル化」。Science。311 ( 5759 ) : 395–8。Bibcode : 2006Sci ... 311..395G。doi : 10.1126 / science.11 20976。PMID 16424344。S2CID 39089541。
- 1 2 "Entrez Gene: TRDMT1 tRNA アスパラギン酸メチルトランスフェラーゼ 1"。
- ↑ Goll MG、Kirpekar F、Maggert KA、et al . (2006)。「DNAメチルトランスフェラーゼホモログDnmt2によるtRNAAspのメチル化」。Science。311 ( 5759 ) : 395–8。Bibcode : 2006Sci ... 311..395G。doi : 10.1126 / science.11 20976。PMID 16424344。S2CID 39089541。
さらに読む
- Okano M, Xie S, Li E (1998). "Dnmt2は胚性幹細胞におけるウイルスDNAの新規メチル化および維持メチル化には必要ない" . Nucleic Acids Res . 26 (11): 2536–40 . doi : 10.1093/nar/26.11.2536 . PMC 147598. PMID 9592134 .
- Van den Wyngaert I、Sprengel J、Kass SU、Luyten WH (1998) 「新規ヒト推定DNAメチルトランスフェラーゼのクローニングと解析」 FEBS Lett . 426 (2): 283–9 . doi : 10.1016/S0014-5793(98) 00362-7 . PMID 9599025. S2CID 7887099 .
- Dong A、Yoder JA、Zhang X、et al. (2001) 「変性剤耐性DNA結合を示す謎めいたDNAメチルトランスフェラーゼ相同体であるヒトDNMT2の構造」 . Nucleic Acids Res . 29 (2): 439–48 . doi : 10.1093/nar/ 29.2.439 . PMC 29660. PMID 11139614 .
- Franchina M、Hooper J、Kay PH (2001)「ヒト末梢血白血球におけるDNA(シトシン-5)メチルトランスフェラーゼ2の5つの新規選択的スプライシング転写産物」Int. J. Biochem. Cell Biol . 33 (11): 1104–15 . doi : 10.1016/S1357-2725(01)00074-7 . PMID 11551826 .
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、et al. (2003) 「15,000を超える全長ヒトおよびマウスcDNA配列の生成と初期解析」 . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Hermann A、Schmitt S、Jeltsch A (2003) 「ヒトDnmt2は残存DNA-(シトシン-C5)メチルトランスフェラーゼ活性を有する」 J. Biol. Chem . 278 (34): 31717–21 . doi : 10.1074/jbc.M305448200 . PMID 12794065 .
- Deloukas P、Earthrowl ME、Grafham DV 他 (2004) 「ヒト染色体10のDNA配列と比較解析」 Nature 429 ( 6990): 375–81 . Bibcode : 2004Natur.429..375D . doi : 10.1038 / nature02462 . PMID 15164054 .
- Xiong Y、Dowdy SC、Xue Aら (2005)。「子宮内膜類内膜癌と漿液性子宮内膜癌におけるDNAメチルトランスフェラーゼ遺伝子発現の相反する変化」。Gynecol . Oncol . 96 ( 3):601–9。doi :10.1016 / j.ygyno.2004.11.047。PMID 15721400。
- Stelzl U、Worm U、Lalowski M、et al . ( 2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワーク:プロテオームの注釈付けのためのリソース」。Cell。122 ( 6 ) : 957–68。doi : 10.1016 / j.cell.2005.08.029。hdl : 11858 / 00-001M - 0000-0010-8592-0。PMID 16169070。S2CID 8235923。
- Pang ST、Weng WH、Flores-Morales A、et al. (2006)「アンドロゲン抵抗性前立腺癌への形質 転換に関連する細胞遺伝学的および発現プロファイル」Prostate . 66 (2): 157–72 . doi : 10.1002/pros.20328 . PMID 16173030. S2CID 26023143 .