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遺伝学における構成ドメインは、グアニン(G) とシトシン(C) の GC と CG の含有量 (総称してGC 含有量)が異なるDNA領域です。[1]構成ドメインの均質性は、それらが存在する染色体の均質性と比較されます。そのため、構成ドメインは均質ドメインまたは非均質ドメインになります。十分に長い (= 300 kb) 構成的に均質なドメインは、アイソコアまたはアイソコリックドメインと呼ばれます。
構成ドメインモデルは、等容積モデルの代替として提案されました。等容積モデルは、ゲノム内のゲノム断片の観察された不均一性を説明するためにベルナルディと同僚によって提案されました。[2]しかし、最近の完全なゲノムデータの配列決定により、等容積モデルは反証されました。その主な予測は次のとおりです。
- タンパク質コード遺伝子の3番目のコドン位置(GC3)のGC含量は、対応する遺伝子を埋め込むアイソコアのGC含量と相関している。[3]この予測は誤りであることが判明した。GC3では近くの配列のGC含量を予測できなかった。[4] [5]
- 温血脊椎動物のゲノム構成は等分線のモザイクである。[6]この予測は、完全なヒトゲノムデータを使用した多くの研究によって否定された。[1] [7] [8] [9]
- 冷血脊椎動物のゲノム構成は、GC含有量が低く、組成の異質性が低いという特徴がある。[10] [11] [12]この予測は、魚類ゲノム中にGC含有量の高い領域と低い領域が見つかったことで反証された。[13]
構成ドメインモデルは、ゲノムを短いドメインと長いドメインの均質および非均質ドメインのモザイクとして説明します。ドメインの構成と構成は、ドメインを融合または分解するさまざまな進化プロセスによって形成されました。このゲノム構成モデルは、牛、[14]、ミツバチ、 [15]、ウニ、[16]、コロモジラミ、[17 ]、 ナゾニア、[18]、甲虫、[19]、アリのゲノムの多くの新しいゲノム研究で確認されました。[20] [21] [22]ヒトゲノムは、多数の短い構成的に均質なドメインと比較的少数の長いドメインを含む、構成的に非均質なドメインの混合物で構成されていると説明されました。[1]
参考文献
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外部リンク
- IsoPlotter — 特定のゲノム内の等分線を計算して視覚化する無料のオープンソース プログラム
