クロストリジウム科

クロストリジウム科
クリスタルバイオレットで染色したボツリヌス菌の顕微鏡写真
科学的分類
ドメイン：	細菌
門:	バシロタ
クラス：	クロストリジウム
注文：	真正細菌目
家族：	クロストリジウム科 プリブラム [de] 1933 [1]
属
本文を参照してください。
同義語
「ボツリヌス菌」プリブラム 1929 「ボツリヌス菌」プリブラム 1929 「Clostridioideae」訂正。Fischer 1897 「プレクトリディア科」プレヴォ 1938 「Plectridioideae」コリッグ。フィッシャー 1897 「Putrificeae」プリブラム 1929 「Putrificoideae」ヘラー 1921 「サルシナ科」スクヤ 1956 「サルキネア」トレヴィサン 1889 「サルシニダエ」エンデルライン 1917 「サルシナエ」コリッグ。トレヴィザン 1879 「ウェルチアイ」プリブラム 1929

クロストリジウム科は細菌綱クロストリジウム属に属する科であり、クロストリジウム属が含まれます。

『Bergey's Manual of Systematic Bacteriology』の分類学的概要で定義されている Clostridiaceae 科 (学名)には、Clostridium属(狭義)を中核として、 Acetivibrio、Acidaminobacter、Alkaliphilus、Anaerobacter、Caloramator、Caloranaerobacter、Coprobacillus、Dorea、Natronincola、Oxobacter、Sarcina、Sporobacter、Thermobrachium、Thermohalobacter、Tindalliaが含まれます。これらの追加の属 (右図参照) が以前 Clostridiaceae 科に含められたのは、主に、これらの属のタイプ種がClostridium属の誤分類された種と系統発生的に関連している場合が多いためです。しかし、アナエロバクター、カロラマトール、オキソバクター、サルシナ、およびサーモブラキウムを除いて、これらの属は真のクロストリジウム科と考えられる範囲外にあり、現在では低G + C、グラム陽性門内の他の科に属すると考えられています。

この誤分類は、従来のクロストリジウム属の現在の分類構造のよく知られた問題の結果である。コリンズ（1994）の系統解析は、クロストリジウム属の種と関連分類群の16S rRNA遺伝子配列の初めての大規模な比較であった。クロストリジウム属の種が単系統群を形成しなかったという事実は、1981年まで遡ってクロストリジウム種の小グループを比較した多くの研究で示されている。コリンズ（1994）とその後の研究の比較研究から、現在この属に割り当てられている種の半分以上は、実際にはタイプ種であるC. butyricumと近縁ではなく、系統学的観点からは新しく定義されたクロストリジウム属に含めるべきではないという結論に達することができる。^[2]

クロストリジウム属のこの広範な遺伝的多様性は、1975 年にジョンソンとフランシスによって 23S rRNA:DNA ハイブリダイゼーション研究を使用して示されていましたが、16S rRNA 遺伝子配列アプローチによって、この属の種と他の属の種との間の実際の系統関係が明らかになりました。

クロストリジウム属は現在、命名法上有効に記載されている種が152種あります。^{[3]しかし、16S rRNA遺伝子配列解析に基づくと、}クロストリジウム属のタイプ種の放射内に収まるのはそのうち73種のみです。

多系統のクロストリジウム科は以下のものから構成されます。

• 細菌属の一覧
• 細菌目一覧