循環ミトコンドリアDNA

循環ミトコンドリアDNAは、細胞遊離循環ミトコンドリアDNAや循環細胞遊離ミトコンドリアDNA （ccf mtDNA）とも呼ばれ、ストレスやその他の損傷や病理学的イベントを受けている細胞から放出されるミトコンドリアDNA （mtDNA）の短い部分です。循環ミトコンドリアDNAは免疫系によって認識され、炎症反応を活性化します。また、心筋梗塞、癌、一般的なストレスによる損傷の程度を検出するために使用できるバイオマーカーでもあります。特定の状況では、ホルモンとして機能します。^[1]

癌患者では、血漿または血清中のccf mtDNAレベルに顕著な違いが見られることが分かっています。これらの高レベルは、多くの種類の腫瘍の診断と予後において、信頼性の高い非侵襲性バイオマーカーであることが示されています。^[2]

腫瘍由来循環ミトコンドリアDNAの特異的分析は、血漿中のミトコンドリアゲノムの変異または変化を追跡する必要があるため、ヒトサンプルでは困難です。動物モデルでは、血漿中の腫瘍由来DNAを非腫瘍由来DNAから分離することが容易です。原理実証により、異種移植動物の血漿、脳脊髄液、尿中の腫瘍由来循環ミトコンドリアDNAの検出感度が実証されました。^[3]

• 循環腫瘍DNA
• NucPosDB: 生体内でのヌクレオソーム配置と遊離DNAのヌクレオソミクスのデータベース