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| セナケウム | |
|---|---|
科学的分類 
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| ドメイン： | 古細菌 |
| 王国： | プロテオアーキオータ |
| 上門: | TACKグループ |
| 門: | サーモプロテオタ |
| クラス： | 不確かな |
| 注文： | クサビクイムシ目 |
| 家族： | セナキア科 |
| 属: | センアルキウム プレストン、ウー、モリンスキー、デ ロング、1996 [1] |
| 種： | C. シンビオサム
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| 二名法名 | |
| セナーケウム・シンビオサム プレストン、ウー、モリンスキー、デ ロング、1996 [1]
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セナーケウムは、セナーケア科に属する単型の古細菌の属である。 [2]海洋古細菌あるセナーケウム・シンビオサムは好冷性で、海綿動物に生息している。 [3]セナーケウム・シンビオサムは当初、海綿動物であるアキシネラ・メキシカナの内部に生息する（内部共生する）主要な共生微生物として発見された。 [3]世界中の海洋で普遍的に少量ながら検出されているが、海綿動物のいくつかの属では最も豊富な微生物叢のメンバーの1つである。そのゲノム配列と多様性は詳細に調査されており、ユニークな代謝産物とアンモニア酸化活性における役割が見出されている。
ゲノム
C. symbiosumのゲノムは202万bpの長さと推定されており、遺伝子の数は2011個と予測されています。[4]
エコロジー
Cenarchaeum symbiosumは、通常 7 ～ 19 ℃ の低温で生存および増殖できる好冷性生物です。C . symbiosumは、通常カリフォルニア付近の 10 ～ 20 メートルの深さに生息する特定の種類の海綿動物と共生関係にあります。
参考文献
- ^ ab 「Cenarchaeum Preston、Wu、Molinski、De Long、1996」。地球規模生物多様性情報機構。 2024年4月28日閲覧。
- ^ Cenarchaeum に関する NCBIウェブページを参照してください。データは「NCBI 分類リソース」から抽出されました。国立生物工学情報センター。2007年 3 月 19 日閲覧。
- ^ ab Preston CM, Wu KY, Molinski TF, De Long EF (1996). 「好冷性クレンアーキオンが海綿動物に生息: Cenarchaeum symbiosum gen. nov., sp. nov」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (13): 6241–6246. Bibcode :1996PNAS...93.6241P. doi : 10.1073/pnas.93.13.6241 . PMC 39006 . PMID 8692799.
- ^ 「Cenarchaeum symbiosum (Cenarchaeum symbiosum) Genome Browser Gateway」。Genome Browser Gateway 。 2011年5月25日閲覧。
さらに読む
- Amin, Shady A; Moffett, James W; Martens-Habbena, Willm; Jaquot, Jeremy E; Han, Yang; Devol, Allan; Ingalls, Anitra E; Stahl, David A; Armbrust, E Virginia (2013 年 11 月)。「アンモニア酸化古細菌 Nitrosopumilus maritimus SCM1 の銅要求量と海洋環境における硝化への影響」。Limnology and Oceanography。58 ( 6): 2037–2045。Bibcode :2013LimOc..58.2037A。doi : 10.4319 /lo.2013.58.6.2037。S2CID 86826960 。
- García-Bonilla, E.、Brandão, PFB、Pérez, T.、Junca, H. (2018)、「地中海海綿動物 Haliclona fulva (Demospongiae: Haplosclerida) のマイクロバイオームにおける安定かつ濃縮された Cenarchaeum symbiosum と未培養のベータプロテオバクテリア HF1」、Microbial Ecology、77、Springer Science and Business Media LLC: 25–36、doi :10.1007/s00248-018-1201-5、PMID 29766224
- Hallam, Steven J; Konstantinidis, Konstantinos T; Putnam, Nik; Schleper, Christa; Watanabe, Yoh-ichi; Sugahara, Junichi; Preston, Christina; de la Torre, Jose; Richardson, Paul M; DeLong, Edward (2006 年 11 月 28 日)。「未培養海洋クレンアーキオテ Cenarchaeum symbiosum のゲノム解析」。米国科学 アカデミー紀要。103 ( 48): 18296–18301。Bibcode :2006PNAS..10318296H。doi : 10.1073 / pnas.0608549103。PMC 1643844。PMID 17114289。
- 秦 W.、鄭 Y.、趙 F.、王 Y.、浦川 博、Martens-Habbena, W.、劉 宏、黄 X.、張 X.、中川 哲.、Mende、DR、Bollmann、A.、Wang、B.、Zhang、Y.、Amin、SA、Nielsen、JL、Mori、K.、高橋、R.、バージニアアームブラスト、E.、ウィンクラー、M.-KH、デロング、EF、リー、M.、リー、P.-H.、周、J.、張、C.、張、T.、スタール、DA、インガルス、 AE (2020)、「海洋アンモニア酸化古細菌の生物地理学への栄養獲得とエネルギー節約の代替戦略マップ」、ISME ジャーナル、14 (10)、オックスフォード大学出版局(OUP): 2595–2609、書誌コード:2020ISMEJ..14.2595Q、doi :10.1038/s41396-020-0710-7、PMID 32636492
- Schleper, Christa; Swanson, Ronald V.; Mathur, Eric J.; Delong, Edward F. (1997 年 12 月)。「培養されていない好冷性古細菌 Cenarchaeum symbiosum 由来の DNA ポリメラーゼの特性」。Journal of Bacteriology。179 ( 24 ): 7803–7811。doi : 10.1128 / jb.179.24.7803-7811.1997。PMC 179745。PMID 9401041。
- Swan, Brandon K.; Martinez-Garcia, Manuel; Chaffin, Mark D.; Morrison, Hilary G.; Field, Erin K.; Poulton, Nicole J.; Masland, E. Dashiell P.; Harris, Christopher C.; Sczyrba, Alexander; Chain, Patrick SG; Koren, Sergey; Woyke, Tanja; Stepanauskas, Ramunas; et al. (2014年4月17日). 「2つの亜熱帯環流の中深海域における海洋グループI Thaumarchaeotaのゲノムおよび代謝の多様性」. PLOS ONE . 9 (4): e95380. Bibcode :2014PLoSO...995380S. doi : 10.1371/journal.pone.0095380 . PMC 3990693。PMID 24743558。
- Alves, RJE, Minh, BQ, Urich, T., Haeseler, A. von, Schleper, C. (2018)、「amoA 遺伝子に基づくアンモニア酸化古細菌のグローバル系統発生と環境分布の統一」、Nature Communications、9、Springer Science and Business Media LLC: 1517、Bibcode :2018NatCo...9.1517A、doi :10.1038/s41467-018-03861-1、PMC 5904100、PMID 29666365