| ブドヴィシア科 | |
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| 家族: | ブドヴィシア科 アデオル他、2016
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Budviciaceae科はグラム陰性細菌の科である。この科はPseudomonadota門、Gammaproteobacteria綱、Enterobacterales目に属する。この科のタイプ属はBudviciaである。[1]
Budviciaceaeという名前は、ラテン語のBudviciaに由来しており、この語は科のタイプ属を指し、接尾辞「-aceae」は科を表す語尾に使われる。これらを合わせると、Budviciceae は命名上のタイプがBudvicia属である科を指す。[1]
生化学的特性と分子シグネチャー
これらの細菌はカタラーゼ陽性、オキシダーゼ陰性、インドール、アルギニンジヒドロラーゼ、オルニチンデカルボキシラーゼ、リジンデカルボキシラーゼ陰性である。これらの細菌は二硫化水素を生成し、硝酸塩を還元することができるが、KCN培地では増殖できない。[1]
この科のゲノム解析により、二機能性タンパク質ジスルフィド異性化酵素/酸化還元酵素DsbC、L-メチオニン/分岐鎖アミノ酸トランスポーター、D-アラニン-D-アラニンリガーゼ、および仮説タンパク質において、 9つの保存されたシグネチャーインデル(CSI)が特定されました。 [1]これらのCSIは固有の分子シグネチャーであり、 Budviciaceae科の種をEnterobacterales目の他の科および他のすべての細菌から識別および区別するための分子的手段を提供します。
歴史的系統学と現在の分類学
Budviciceaeには、2021年現在、4つの有効に公表された属が含まれています。[2]この科のメンバーは、もともとはEnterobacteriaceae科のメンバーでした。これは、異なる生化学的特徴と異なる生態学的ニッチを持つ、系統学的に無関係な大きな種のグループです。種をEnterobacteriaceae科に最初に割り当てたのは、主に16S rRNAゲノム配列解析に基づいていましたが、これは識別力が低いことが知られており、その結果はアルゴリズムと使用される生物情報に依存します。それにもかかわらず、解析は依然として多系統分岐を示しており、科内に異なるサブグループが存在することを示しています。[3]
2016年、Adeoluらは、比較ゲノム解析と、保存されたゲノム配列、16S rRNA配列、多座配列解析から構築されたさまざまな系統樹の分岐パターンに基づいて、腸内細菌科を7つの新しい科に分類することを提案しました。この科に特有の分子マーカー、特に保存されたシグネチャーインデルも、系統樹とは独立した分類を支持する証拠として特定されました。[1]
参考文献
- ^ abcde Adeolu, M.; et al. (2016). 「『Enterobacteriales』のゲノムに基づく系統学と分類学:Enterobacterales ord. nov. を Enterobacteriaceae、Erwiniaceae fam. nov.、Pectobacteriaceae fam. nov.、Yersiniaceae fam. nov.、Hafniaceae fam. nov.、Morganellaceae fam. nov.、および Budviciaceae fam. nov の科に分割する提案」。Int . J. Syst. Evol. Microbiol . 66 (12): 5575–5599. doi : 10.1099/ijsem.0.001485 .
- ^ “Family: Budviciaceae”. lpsn.dsmz.de . 2021年6月5日閲覧。
- ^ フランチーノ、M. ピラー; サントス、スコット R.; オックマン、ハワード (2006)、「細菌の系統関係、特に内因性共生菌と腸内細菌種について」、原核生物、ニューヨーク、NY: シュプリンガー ニューヨーク、pp. 41–59、doi :10.1007/0-387-30746-x_2、ISBN 978-0-387-25496-8、2021-06-02取得
