ARBプロジェクト

ARBプロジェクトは、rRNAや DNA およびタンパク質配列を含むその他の生物学的配列の系統解析のための無料ソフトウェアパッケージです。自動アライナーを使用することで、あらゆる生物からの遺伝子配列のインポートとアセンブリが簡素化されます。この編集プロセスは、「一次構造エディター」と「二次構造エディター」の 2 つのサブカテゴリに分けられます。これにより、系統樹を作成するために必要な構成が提供されます。このソフトウェアは、さまざまな生物の系統データを比較するときによく使用される生物学的配列の視覚化を提供します。^[1]

著者らの記述によれば、^[2]

ARB (ラテン語のarborの略) プログラム パッケージは、共通のグラフィカル ユーザー インターフェイスによって制御される、シーケンス データベースの保守と分析のためのさまざまな直接相互作用するソフトウェア ツールで構成されています。当初はリボソーム RNAデータ用に設計されましたが、核酸やアミノ酸のシーケンス データにも使用できます。中央データベースには、処理済み (アラインメント済み)の一次構造データが含まれています。追加の記述データは、個々のシーケンスに割り当てられたデータベース フィールドに保存することも、ローカルまたはワールドワイド ネットワーク経由でリンクすることもできます。メイン ウィンドウに表示される系統樹は、データ アクセスと視覚化に使用できます。パッケージには、データのインポートとエクスポート、シーケンス アラインメント、一次構造と二次構造の編集、プロファイルとフィルターの計算、系統解析、特定のハイブリダイゼーション プローブの設計と評価、およびデータ分析用のその他のコンポーネントのための追加ツールが含まれています。

ソフトウェアの最新バージョンは2021年にリリースされました。^[3]新しいバージョンはmacOSで実行できます。

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