Loading article…
| Urm1 (ユビキチン関連修飾子) | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 ユビキチン関連修飾子 1 (2qjl)。タンパク質の中央に β-grasp フォールドが位置しています。また、ジグリシン モチーフ内のカルボキシ末端グリシンは青でマークされ、Mg イオンは黒い球で表されます。 | |||||||||||
| 識別子 | |||||||||||
| シンボル | UR1 1.0 | ||||||||||
| パム | PF09138 | ||||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||||
| SCOP2 | d.15.3.3 / スコープ / SUPFAM | ||||||||||
| |||||||||||
ユビキチン関連修飾子1（URM1）は、酵母のユビキチン様ウルミル化経路でタンパク質を修飾するユビキチン様タンパク質である。 [1]ユビキチンスーパーファミリーの構造比較と系統解析により、Urm1はスーパーファミリー全体の共通祖先の中で最も保存された構造と配列の特徴を持っていることが示された。[2] [3]
Urm1は、コアβ-グラスプフォールドと、ジグリシンモチーフ内の必須カルボキシ末端グリシンを特徴とする。Urm1は、リジン残基を介してE1様タンパク質Uba4が関与するメカニズムにより、ペルオキシレドキシンAhp1、ATPBD3、 CTU2 、およびヒトMOCS3と共役することが知られている。 [4]ユビキチン化と同様に、ウルミル化にはチオエステル中間体が必要であり、Urm1とその基質の間にイソペプチド結合を形成する。さらに、ウルミル化プロセスは酸化ストレスによって大幅に促進される可能性がある。[5]栄養素の感知と酸化ストレス応答において役割を果たすタンパク質タグとして機能する。
最近、Urm1 は、チオカルボキシル化された Urm1 の形成を必要とするメカニズムを介して、真核生物のtRNAのチオレーションにおいて硫黄キャリアとして作用できることが実証されました。 [6] URM1 は細胞質 tRNA のチオレーションに関与し、E1 様酵素 Uba4 から硫黄を受け取り、それを tRNA に転移します。配列および構造相同性研究によると、Urm1 は、真核生物の UBl の原核生物対応物と考えられる原核生物の硫黄転移タンパク質である ThiS および MoaD とより密接に関連している可能性があります。[7]
参照
参考文献
- ^ Goehring AS、Rivers DM、Sprague GF (2003 年 11 月)。「Urmylation: 酵母の侵入成長と出芽中に機能するユビキチン様経路」。Molecular Biology of the Cell . 14 (11): 4329–41. doi :10.1091/mbc.E03-02-0079. PMC 266754 . PMID 14551258。
- ^ Xu J、Zhang J、Wang L、Zhou J、Huang H、Wu J、Zhong Y、Shi Y (2006 年 8 月)。「Urm1 の溶液構造とタンパク質修飾因子の起源に対するその影響」。米国科学アカデミー紀要。103 (31): 11625–30。Bibcode : 2006PNAS..10311625X。doi : 10.1073 / pnas.0604876103。PMC 1518799。PMID 16864801。
- ^ Goehring AS、Rivers DM、Sprague GF (2003 年 11 月)。「Urmylation: 酵母の侵入成長と出芽中に機能するユビキチン様経路」。Molecular Biology of the Cell . 14 (11): 4329–41. doi :10.1091/mbc.E03-02-0079. PMC 266754 . PMID 14551258。
- ^ Van der Veen AG、Schorpp K、Schlieker C、Buti L、Damon JR、Spooner E、Ploegh HL、Jentsch S (2011 年 2 月)。「非標準的なリジン指向性タンパク質修飾因子としてのユビキチン様タンパク質 Urm1 の役割」。米国 科学アカデミー紀要。108 ( 5): 1763–70。doi : 10.1073 / pnas.1014402108。PMC 3033243。PMID 21209336。
- ^ Wang F, Liu M, Qiu R, Ji C (2011年8月). 「タンパク質修飾因子および硫黄キャリアとしてのユビキチン様タンパク質Urm1の二重の役割」. Protein & Cell . 2 (8): 612–9. doi :10.1007/s13238-011-1074-6. PMC 4875326. PMID 21904977 .
- ^ Petroski MD、Salvesen GS 、 Wolf DA (2011 年 2 月)。「Urm1 は酸化ストレスにおいて硫黄転移をユビキチン様タンパク質機能に結び付ける」。米国 科学アカデミー紀要。108 (5): 1749–50。Bibcode :2011PNAS..108.1749P。doi : 10.1073 / pnas.1019043108。PMC 3033263。PMID 21245332。
- ^ Pedrioli PG、Leidel S 、 Hofmann K (2008 年 12 月)。「Urm1 は修飾の岐路に立つ。『タンパク質修飾: いつもの容疑者を超えて』レビューシリーズ」。EMBOレポート 。9 ( 12 ): 1196–202。doi : 10.1038 /embor.2008.209。PMC 2603462。PMID 19047990。