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軍医総監（複数形：軍医総監）は、いくつかの英連邦諸国およびほとんどのNATO加盟国で使用されている称号で、上級軍医、または政府から任命され公衆衛生上の責任を担う上級制服医師を指す。この称号は、軍部隊が独自の医師を擁するようになった17世紀に由来する。
英国では、軍医総監は軍医療部門の最高責任者であり、少将、中将、または空軍中将の階級を持つ。以前は、この役職は各軍の3人の医療部長のうち最上位の者が務め、中将、中将、または空軍中将の階級を持っていた。
アメリカ合衆国では、公衆衛生の最高責任者は米国公衆衛生局長官であり、少数の州には州公衆衛生局長官がいる。さらに、米軍の3つの軍種、すなわち米国陸軍公衆衛生局長官、米国海軍公衆衛生局長官、および米国空軍公衆衛生局長官がそれぞれ独自の公衆衛生局長官を置いている。