スタイン・アーツ

スタイン・アーツ
国籍	ベルギーの
母校	ルーヴェン大学
知られている	遺伝子制御と計算生物学に関する研究
タイトル	教授

スタイン・アーツはベルギーのバイオエンジニアおよび計算生物学者です。VIBおよびKU Leuven（ルーヴェン大学）の計算生物学研究所[ ^1]を率いており、VIB AI &計算生物学センターであるVIB.AIの所長も務めています。ゲノム制御コードの仕組みに関する研究で数々の賞を受賞しています。^[2]

アーツはベルギーのフースデン＝ゾルダーで生まれ育ち、ハイリヒ＝ハート大学で中等教育を修了した。^[3]ルーヴェン大学でバイオサイエンス工学（分子生物学）の修士号を取得し、その後ヤンセンファーマシューティカでITプロジェクトリーダー補佐を務めながら、ブリュッセル大学で応用コンピュータサイエンスの高度な研究を行った。ルーヴェン大学の電気工学科ESAT-SCDで働き、工学（バイオインフォマティクス）の博士号を取得した。^[4]

アーツ氏は、ルーヴェンにあるVIBのバッセム・ハッサン研究室でショウジョウバエモデルであるキイロショウジョウバエの遺伝子調節のゲノミクスに取り組んでポスドク研修を修了しました。これには、フランスのマルセイユ・ルミニー発生生物学研究所（IBDML）でのデニス・ティエリー氏およびカール・ヘルマン氏との共同研究訪問も含まれています。

2009年、アールツ氏はルーヴェン大学の助教授に任命され、現在は同大学の教授を務めている。また、ルーヴェン・カトリック大学人類遺伝学部の計算生物学研究室を率いている。2016年からはVIBグループリーダーにも任命されている。アールツ氏はルーヴェン大学でバイオインフォマティクス入門、バイオインフォマティクス：構造比較ゲノミクス、バイオインフォマティクスとシステム生物学：配列、構造、進化、バイオインフォマティクスとシステム生物学：発現、制御、ネットワークなど、いくつかのコースを教えている。彼の研究は、単一細胞、機械学習、ハイスループット実験アプローチを組み合わせて、ゲノム制御コードを解読することに焦点を当てている。 ^[5]

アーツの研究対象は、調節ゲノミクスと遺伝子調節ネットワークであり、神経細胞の発達、神経変性、癌などの文脈で応用される幅広い実験的および計算的アプローチをカバーしています。^{[6] [7]}

博士課程の研究中、アーツはゲノムエンハンサーを予測する最初のバイオインフォマティクスアルゴリズムの1つ（ModuleSearcher）^[8]を発明し、シス調節配列の分析（TOUCAN）^{[9] [10] [11]および遺伝子の優先順位付け（Endeavour） [12]}のためのいくつかのバイオインフォマティクスツールを開発しました。その他の科学的貢献には、単一細胞遺伝子調節ネットワークの分析のための新しいバイオインフォマティクス手法、すなわちiRegulon ^[13] 、 SCENIC ^[14]およびcisTopic ^[15]、超並列エンハンサーレポーターアッセイ（CHEQ-seq）のための新しい実験技術、およびエンハンサーモデリングのためのディープラーニング実装（DeepMEL ^[16]およびDeepFlyBrain ^[17]）があります。

アーツはフライセルアトラスコンソーシアム^{[18]の共同設立者であり、老化した}ショウジョウバエの脳の単一細胞アトラスを作成しました。^[19] 2022年にコンソーシアムは成虫のショウジョウバエの単一核トランスクリプトームアトラスの完成を発表しました。 [ ^{20] [21]}彼らは、これが研究コミュニティにとって貴重なリソースとなり、単一細胞解像度での遺伝子機能の研究の参考資料となることを期待しています。^[22]

細胞および組織アトラスの作成は、ハエだけでなく、細胞タイプの解像度で全生物レベルで人間の病気をモデル化するなど、生物学的プロセスを研究するのに役立ちます。Aertsは、複雑な病気の発症と進行中の人間の細胞を追跡、理解、標的とし、単一細胞の解像度で治療に対する反応を分析することを目指した、LifeTimeと呼ばれる汎ヨーロッパ研究コンソーシアムにも参加しています。^[23]

オープンサイエンスの提唱者として、アーツ氏はチームが開発したデータと手法をオープンリポジトリに保存したり、オープンソースソフトウェアやデータベースとして無料で利用できるようにしたりしています。^[24]

MendelCraftは、Aerts研究室が開発したMineCraftのMODで、異なる品種の仮想鶏を交配したりクローン化したりすることで、子供たちにDNA、遺伝学、メンデルの法則について教えるために設計されたビデオゲームです。^[25]

• ERCアドバンスト助成金2023
• 2022年にEMBO会員に選出^[26]
• ULB 2022でフランキ議長^[27]
• ERCコンソリデータ助成金^[28]
• 2017年バイオテクノロジー基金バイオインフォマティクス・計算科学賞
• 2016年アストラゼネカ財団賞バイオインフォマティクス^[29]