Loading article…
| りむYN02 | |
|---|---|
ウイルスの分類 
| |
| (ランク外): | ウイルス |
| 領域: | リボビリア |
| 王国： | オルタナウイルス科 |
| 門: | ピスビリコタ |
| クラス： | ピソニビリセテス |
| 注文： | ニドウイルス目 |
| 家族： | コロナウイルス科 |
| 属: | ベータコロナウイルス |
| 亜属： | サルベコウイルス |
| 種： | |
| 歪み： | りむYN02
|
RmYN02は、コウモリ由来の重症急性呼吸器症候群関連コロナウイルス株です。2019年5月から10月の間に中国雲南省孟臘県の現場で採取されたコウモリの糞から発見されました。COVID -19を引き起こすウイルス株であるSARS-CoV-2の2番目に近い既知の近縁種であり、完全なウイルスゲノムの規模で93.3％のヌクレオチド同一性を共有しています。RmYN02は、SARS-CoV-2と同様に、スパイクタンパク質のS1/S2切断部位に挿入が含まれており、このような挿入イベントが自然に発生する可能性があることを示唆しています。[1]
遺伝学
SARS-CoV-2とゲノムの93.3%を共有しています。RmYN02は1abにおいてSARS-CoV-2と97.2%同一でした。RmYN02はS遺伝子においてSARS-CoV-2とヌクレオチドで71.8%、アミノ酸で97.4%同一であり、RaTG13とSARS-CoV-2のアミノ酸同一性は97.4%でした。すべての遺伝子データはWeifeng Shiと彼のチームによって発見されました。[1]
発見
RmYN02は、2019年5月から7月にかけて雲南省シーサンパンナ熱帯植物園のアリス・C・ヒューズ教授によって採取され、山東医科大学のウェイフェン・シーによって、シーサンパンナ熱帯植物園から近い中国雲南省孟臥県で採取された227匹のコウモリから採取された302個の糞便サンプルの分析に基づいて配列決定されました。[1]ゲノム自体は11個のサンプルのプールから組み立てられました。
SARS-CoV-2および関連コロナウイルスの全ゲノム配列に基づく系統樹は以下のとおりである: [2] [3]
参照
参考文献
- ^ abc Zhou, Hong; Chen, Xing; Hu, Tao; Li, Juan; Song, Hao; Liu, Yanran; Wang, Peihan; Liu, Di; Yang, Jing; Holmes, Edward C.; Hughes, Alice C. (2020年6月8日). 「SARS-CoV-2に密接に関連する新規コウモリコロナウイルスには、スパイクタンパク質のS1/S2切断部位に天然挿入物が含まれている」. Current Biology . 30 (11): 2196–2203.e3. Bibcode :2020CBio...30E2196Z. doi :10.1016/j.cub.2020.05.023. ISSN 1879-0445. PMC 7211627 . PMID 32416074.
- ^ ab Zhou H, Ji J, Chen X, Bi Y, Li J, Wang Q, et al. (2021年8月). 「新型コウモリコロナウイルスの同定により、SARS-CoV-2および関連ウイルスの進化の起源が明らかになる」. Cell . 184 (17): 4380–4391.e14. doi :10.1016/j.cell.2021.06.008. PMC 8188299. PMID 34147139 .
- ^ ab Wacharpluesadee S、Tan CW、Maneeorn P、Duengkae P、Zhu F、Joyjinda Y、他。 （2021年2月）。 「東南アジアのコウモリやセンザンコウで循環しているSARS-CoV-2関連コロナウイルスの証拠」。ネイチャーコミュニケーションズ。12 (1): 972. Bibcode :2021NatCo..12..972W。土井: 10.1038/s41467-021-21240-1。PMC 7873279。PMID 33563978。
- ^ 村上 聡、北村 剛、鈴木 淳、佐藤 亮、青井 剛、藤井 正之、他 (2020年12月)。「SARS-CoV-2と系統学的に関連するコウモリサルベコウイルスの検出と特徴付け、日本」。新興 感染症。26 ( 12 ): 3025– 3029。doi : 10.3201/eid2612.203386。PMC 7706965。PMID 33219796。
- ^ ab Zhou H, Chen X, Hu T, Li J, Song H, Liu Y, et al. (2020年6月). 「SARS-CoV-2に密接に関連する新規コウモリコロナウイルスには、スパイクタンパク質のS1/S2切断部位に天然挿入物が含まれている」。Current Biology . 30 (11): 2196–2203.e3. doi :10.1016/j.cub.2020.05.023. PMC 7211627. PMID 32416074 .
- ^ ラム・TT、ジア・N、チャン・YW、シャム・MH、ジャン・JF、朱・HC、他。 （2020年7月）。 「マラヤセンザンコウにおけるSARS-CoV-2関連コロナウイルスの同定」。自然。583 (7815): 282–285。ビブコード:2020Natur.583..282L。土井：10.1038/s41586-020-2169-0。PMID 32218527。S2CID 214683303 。
- ^ Xiao K、Zhai J、Feng Y、Zhou N、Zhang X、Zou JJ、他。 （2020年7月）。 「マラヤセンザンコウからのSARS-CoV-2関連コロナウイルスの分離」。自然。583 (7815): 286–289。ビブコード:2020Natur.583..286X。土井：10.1038/s41586-020-2313-x。PMID 32380510。S2CID 256822274 。
- ^ ab Delaune D、Hul V、Karlsson EA、Hassanin A、Ou TP、Baidaliuk A、他。 （2021年11月）。 「カンボジアのコウモリから感染した新型SARS-CoV-2関連コロナウイルス」。ネイチャーコミュニケーションズ。12 (1): 6563. Bibcode :2021NatCo..12.6563D。土井：10.1038/s41467-021-26809-4。PMC 8578604。PMID 34753934。
- ^ Zhou H, Chen X, Hu T, Li J, Song H, Liu Y, et al. (2020年6月). 「SARS-CoV-2に密接に関連する新規コウモリコロナウイルスには、スパイクタンパク質のS1/S2切断部位に天然挿入物が含まれている」Current Biology . 30 (11): 2196–2203.e3. doi :10.1016/j.cub.2020.05.023. PMC 7211627 . PMID 32416074.
- ^ Zhou P, Yang XL, Wang XG, Hu B, Zhang L, Zhang W, et al. (2020年3月). 「コウモリ起源と思われる新しいコロナウイルスによる肺炎の発生」. Nature . 579 (7798): 270– 273. Bibcode :2020Natur.579..270Z. doi :10.1038/s41586-020-2012-7. PMC 7095418. PMID 32015507 .
- ^ Temmam S、Vongphayloth K、Baquero E、Munier S、Bonomi M、Regnault B、他。 (2022 年 4 月)。 「コウモリコロナウイルスはSARS-CoV-2に関連しており、ヒトの細胞に感染する」。自然。604 (7905): 330–336。ビブコード:2022Natur.604..330T。土井：10.1038/s41586-022-04532-4。PMID 35172323。S2CID 246902858 。