組換えシグナル配列は、未成熟B細胞およびT細胞におけるV(D)J組換えの際にRAG1/RAG2酵素複合体によって認識される保存された非コードDNA配列である。[ 1 ]組換えシグナル配列は、T細胞受容体および免疫グロブリン分子の重鎖および軽鎖可変領域 の形成中に組換えを受けるV、D、およびJ遺伝子セグメントに酵素複合体を誘導する。[ 1 ]
RSSは、 DNAの重鎖領域のV、D、J配列と軽鎖DNA領域のVおよびJ配列に隣接する、高度に保存されたヘプタマー配列(7塩基対)、スペーサー配列、および保存されたノナマー配列(9塩基対)から構成されています。[ 1 ] [ 2 ]スペーサー配列はヘプタマー配列とノナマー配列の間に位置し、塩基対の多様性を示しますが、常に12塩基対または23塩基対の長さです。[ 3 ]ヘプタマー配列は通常、ノナマーは通常です。太字のヌクレオチドは、より高度に保存されています。[ 3 ] RAG1/RAG2酵素複合体は、V、D、Jセグメントを結合する際に12-23ルールに従い、12 bpスペーサーRSSを23 bpスペーサーRSSとペアにします。[ 1 ] [ 2 ]これにより、同じ領域をコードする2つの異なる遺伝子が組み換えを起こすことが防止されます(例:VV組み換え)。[ 1 ] RSSは、成熟中のBリンパ球およびTリンパ球の生殖細胞系DNAのV、D、およびJセグメントの間に位置しており、V(D)J組換えが完了した後、最終的なIg mRNA産物から永久的にスプライシング除去される。[ 1 ]CACAGTGACAAAAACC

RAG1/RAG2酵素複合体は、VおよびJコーディング領域に隣接するヘプタマー配列を認識し、その5'末端を切断して、VおよびJコーディング領域間の介在DNAを解放します。[ 1 ] DNAの重鎖コーディング領域では、RAG1/RAG2酵素複合体はDおよびJセグメントに隣接するRSSを認識し、それらを結合させて、介在DNAを含むループを形成します。[ 1 ] [ 4 ]次に、RAG1/RAG2複合体は、DおよびJセグメントの両方のコーディング領域に隣接するRSSヘプタマーの5'末端にニックを導入し、介在DNAのループを永久に除去して、VDJリコンビナーゼ酵素によって修復される二本鎖切断を作成します。[ 1 ] [ 4 ]このプロセスは、VとDJの結合のために繰り返されます。[ 1 ]軽鎖再編成では、VセグメントとJセグメントのみが結合されます。[ 1 ]
潜在的RSSは、真正RSSに似た遺伝子配列であり、RAG1/RAG2酵素複合体によって時折真正RSSと誤認される。[ 3 ] RSSとcRSSの組み換えは染色体転座を引き起こし、癌につながる可能性がある。[ 3 ]
常染色体劣性SCIDSで生まれた乳児の中には、ミスセンス変異のためにRAG1/RAG2酵素複合体をコードする遺伝子の機能的なコピーを欠いているものもいる。[ 5 ] [ 6 ]これらの乳児は、RSSを認識できず、したがってV(D)J組換えを効果的に開始できない機能不全のRAG1/RAG2酵素複合体を産生する。[ 5 ] [ 6 ]この疾患は、機能的なB細胞とT細胞の欠如を特徴とする。[ 1 ] [ 5 ]