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RNase R、またはリボヌクレアーゼ R は、3'-->5'エキソリボヌクレアーゼであり、 RNase IIスーパーファミリーに属し、3' - 5' 方向に RNA を加水分解する酵素のグループです。 RNase R は、特に細菌中のノンストップmRNA の選択的分解に関与していることが示されています。 [1] [2] RNase R には、他の多くの生物に相同体があります。
別のより大きなタンパク質の一部にRNase R と非常によく似たドメインがある場合、これを RNase R ドメインと呼びます。
役割トランス-翻訳とリボソームの品質管理
RNase Rは翻訳の正確性、正しいrRNAの成熟、異常なrRNAの除去を保証し、トランス翻訳システムによって損傷したmRNAを分解するために使用されます。[3]
大腸菌では、 RNase Rは92kDのタンパク質であり、配列特異性を示さずに構造化されたRNA基質を分解する特徴的な能力を持っています。そのため、RNase RはリボソームRNA、トランスファーRNA、メッセンジャーRNA、小さな非コードRNAなどのさまざまな基質に作用します。RNase RはtmRNAとSmpBを含むリボ核タンパク質複合体と関連しており、コールドショック下でのtmRNAの発達に関与しています。[3]
RNase R はリボソームとも関連しており、 rRNAまたはリボソーム RNA の品質管理プロセスに関与しています。RNase R は rRNA に対してin vitro親和性を持っています。いくつかの rRNA 品質管理経路において、RNase R は不良 rRNA 分子の除去を促進することで主要な因子として機能します。このタンパク質は、rRNA 前駆体の処理やリボソームの完全性の観察にも重要です。[3]
RNA消化
RNase Rには2つのコールドショックドメイン、RNase触媒ドメイン、S1ドメイン、および基本ドメインがあります。[4]
RNase RはRNase IIなどの他の細菌エキソリボヌクレアーゼよりもRNAを分解する活性が高く、より効果的であるため、細胞内のRNase Rの過剰は有害です。[5] 7ヌクレオチド未満の3'オーバーハングを持つ二本鎖RNAを構成する基質RNAに加えて、RNase Rはすべての線状RNAを分解できます。[6]真核生物の線状RNAを系統的に消化する場合、RNase Rは3'から5'への優れたエキソリボヌクレアーゼですが、RNase R耐性のケースはまれです。mRNAは、キャップ構造によって5'末端に提供される保護とは異なり、3'末端で化学的に保護されていないため、RNase Rは保護されていない3'末端から線状mRNAをうまく分解します。[4]
参考文献
- ^ Cheng ZF、Deutscher MP (2005年1月)。「mRNAの分解におけるRNase Rの重要な役割」。 分子細胞。17 ( 2):313–8。doi : 10.1016/ j.molcel.2004.11.048。PMID 15664199。
- ^ Venkataraman K、Guja KE、Garcia-Diaz M、 Karzai AW (2014)。「ノンストップmRNA崩壊：トランス翻訳を介したリボソームレスキューの特別な特性」。Frontiers in Microbiology。5 ： 93。doi ： 10.3389 / fmicb.2014.00093。PMC 3949413。PMID 24653719。
- ^ abc ドミンゲス S、モレイラ RN、アンドラーデ JM、ドス サントス RF、バリア C、ビエガス SC、アライアーノ CM (2015 年 7 月)。 「翻訳およびリボソームの品質管理におけるRNase Rの役割」。ビオキミー。114：113–8。土井：10.1016/j.biochi.2014.12.012。PMID 25542646。
- ^ ab Suzuki H, Tsukahara T (2014年5月). 「RNase R耐性RNAからのpre-mRNAスプライシングの視点」International Journal of Molecular Sciences . 15 (6): 9331–42. doi : 10.3390/ijms15069331 . PMC 4100097 . PMID 24865493.
- ^ Cheng ZF、Deutscher MP (2002年6 月)。「大腸菌エキソリボヌクレアーゼ RNase R の精製と特性評価。RNase II との比較」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 24): 21624–9。doi : 10.1074/jbc.M202942200。PMID 11948193。
- ^ Vincent HA、 Deutscher MP (2006 年 10 月)。「エキソリボヌクレアーゼ RNase R による基質認識と触媒作用」。The Journal of Biological Chemistry。281 ( 40): 29769–75。doi : 10.1074/ jbc.M606744200。PMID 16893880。