プロトン依存性オリゴペプチドトランスポーター(POT)ファミリー( PTR(ペプチド輸送)ファミリーとも呼ばれる)のタンパク質は、動物、植物、酵母、古細菌、グラム陰性菌とグラム陽性菌の両方に存在し、主要促進因子スーパーファミリーの一部である。細胞へのペプチドの輸送は、細菌やヒトなど多様な生物に見られる特定のエネルギー依存性トランスポーターによって行われる、よく知られた生物学的現象である。プロトン依存性オリゴペプチドトランスポーター(PTR)ファミリーのタンパク質は、ABC型ペプチドトランスポーターとは異なり、最近発見された多数のペプチド輸送タンパク質の配列解析によって明らかになった。[ 1 ]これらのタンパク質は、主に小さなペプチドの取り込みとそれに伴うプロトンの取り込みに関与していると考えられる。[ 2 ]
POTファミリーのほとんどのメンバーはペプチド輸送を触媒しますが、1つは硝酸塩透過酵素であり、もう1つはペプチドだけでなくヒスチジンも輸送できます。ペプチド輸送体の中には抗生物質を輸送できるものもあります。これらはプロトン共輸送によって機能しますが、基質:H +の化学量論は可変です。高親和性ラットPepT2キャリアは、中性および陰イオン性ジペプチドでそれぞれ2および3のH +の取り込みを触媒しますが、低親和性PepT1キャリアは中性ペプチド1つあたり1つのH +の取り込みを触媒します。[ 3 ] [ 4 ]
POTファミリーのタンパク質によって触媒される一般的な輸送反応は以下のとおりです。
基質(出力)+ H(出力)→基質(入力)H +(入力)
これらのタンパク質は、約450~600個のアミノ酸残基から構成され、一般的に真核生物のタンパク質は細菌のタンパク質よりも長い。また、推定または既知の膜貫通αヘリックス構造を12個有する。
膜貫通ヘリックス間の塩橋相互作用のペアが連携して、PTRファミリー内での交互アクセス輸送を統制する。[ 5 ]細菌と真核生物の相同体間で保存されている残基の重要な役割は、ペプチド認識と輸送の保存されたメカニズムを示唆しており、場合によっては個々の種で微妙に修正されている。
FP12591 ; PEPT1 ; PTR4 ; SLC15A1 ; SLC15A2 ; SLC15A3 ; SLC15A4 ; hPEPT1-RF ;
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