タンパク質サブファミリー

タンパク質サブファミリーは、タンパク質の密接な進化的関係に基づいた分類のレベルです。タンパク質スーパーファミリーやタンパク質ファミリーよりも下位に位置します。^[1]

タンパク質は通常、より広いファミリーのメンバーよりも、他のサブファミリーのメンバーとより高い配列および機能の類似性を共有しています。^{[1] [2]}たとえば、タンパク質構造分類データベース分類システムでは、サブファミリーのメンバーは同じ相互作用インターフェースおよび相互作用パートナーを共有しています。^[3]これらは、メンバーが類似した構造を持ちながらも、より遠い関係にあるためインターフェースが異なる場合があります。 ファミリーの場合よりも、より厳しい基準です。 サブファミリーは、配列の類似性、^{[4]機能にリンクされた} モチーフ、^[5]または系統発生クレードなど、さまざまな方法によって割り当てられます。^{[6] [7]} サブファミリーとファミリーの間には、正確で一貫した区別はありません。 同じタンパク質のグループが、文脈に応じて、ファミリーまたはサブファミリーとして説明されることがあります。

• 英国ケンブリッジのSCOP DB
• CATHタンパク質構造DB