ピクロフィラス・トリダス

ピクロフィラス・トリダス
科学的分類
ドメイン：	古細菌
王国：	ユーリアキオータ
門:	ユーリアキオータ
クラス：	サーモプラズマ
注文：	サーモプラズマ類
家族：	ピクロフィラ科
属:	ピクロフィラス
種：	P. トリドゥス
二名法名
	ピクロフィラス・トリダス; シュレパーら1996

Picrophilus torridusは1996 年に記述された古細菌の一種です。^[1] Picrophilus torridusは、日本の北海道の温泉近くの土壌で発見されました。土壌のpH は0.5 未満でした。^[2]P. torridus は、自由生活で非寄生性の生物の中で見つかったゲノムの中で最も小さいものの 1 つであり、高いコーディング密度を持っています。つまり、その遺伝子の大部分はコーディング領域であり、タンパク質を構築するための指示を提供します。現在の研究では、P. torridusが好む 2 つの過酷な条件 (高温と低 pH)が、過酷な環境による損傷を受けにくい小さくコンパクトなゲノムを持つように選択圧をかけていることが示唆されています。^[3]^[4]

参考文献

^ Schleper、Pühler、Klenk、Zillig (1996 年 7 月)。「Picrophilus oshimae および Picrophilus tomdus 科の新属新種、新属新種、新種、超好酸性、好熱性、従属栄養性、好気性古細菌の 2 種」。International Journal of Systematic Bacteriology。46 (3)。国際微生物学会連合 : 814–816。doi : 10.1099/ 00207713-46-3-814。ISSN 1466-5034。OCLC 807119723 。
^ Siddiqui、Thomas編 (2008)。「好熱酸性菌と低 pHおよび高温へのタンパク質適応」極限環境細菌におけるタンパク質適応。Nova Publishers。ISBN 9781604560190. 2013年10月31日閲覧。
^ Angelov, A.; Liebl, W. (2006-10-20). 「Picrophilus torridus およびその他の好熱好酸性古細菌のゲノム解析に基づく極度の好熱好酸性に関する考察」Journal of Biotechnology . 原核生物ゲノム研究の側面. 126 (1): 3–10. doi :10.1016/j.jbiotec.2006.02.017. ISSN 0168-1656. PMID 16621083.
^ Schepers, B.; Thiemann, V .; Antranikian, G. (2006 年 6 月)。「大腸菌で異種発現した好熱好酸性古細菌 Picrophilus torridus 由来の新規グルコアミラーゼの特性評価」。エンジニアリングインライフサイエンス。6 (3): 311–317。doi : 10.1002 /elsc.200620131。ISSN 1618-0240。S2CID 85128507 。

さらに読む

Arora, Jasmine; Goswami, Kasturi; Saha, Swati (2014年1 月)。「古細菌 Picrophilus torridus の複製イニシエーター Orc1/Cdc6 の特性」。Journal of Bacteriology。196 (2): 276–286。doi : 10.1128 / JB.01020-13。PMC 3911243。PMID 24187082。
Frick, Eduard; Spatzal, Thomas; Gerhardt, Stefan; Andreas, Krämer; Oliver, Einsle; Wolfgang, Hüttel (2014 年 4 月 13 日)。「好熱好酸性古細菌 Picrophilus torridus 由来の 4-ヒドロキシフェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼの構造的および機能的特徴付け」。Extremophiles。18 ( 4 ) : 641–651。doi : 10.1007 /s00792-014-0645-x。ISSN 1433-4909。PMID 24794033。S2CID 13898874 。
Rajput, Rinky; Verma, Ved Vrat; Chaudhary, Vishal; Gupta, Rani (2013 年 1 月)。「好熱好酸性古細菌 Picrophilus torridus 由来の加水分解性ガンマグルタミルトランスペプチダーゼ: 結合ポケット変異誘発およびトランスペプチダーゼ」。Extremophiles。17 ( 1 ) : 29–41。doi : 10.1007/s00792-012-0490-8。PMID 23104165。S2CID 17563963 。
レーハー、マティアス。トビアス総統。ボット、マイケル。ピーター・シェーンハイト（2009年12月5日）。「好熱酸性真菌古細菌 Picrophilus torridus の非リン酸化エントナー・ドゥドロフ経路には、新規の 2-ケト-3-デオキシグルコン酸特異的アルドラーゼが関与する」細菌学ジャーナル。192 (23): 964–974。土井：10.1128/JB.01281-09。PMC 2812977。PMID 20023024。
Thurmer, Andrea; Voigt, Birgit; Angelov, Angel; Albrecht, Dirk; Hecker, Michael; Liebl, Wolfgang (2011 年 12 月)。「成長限界に近い pH 値と温度値での極度好熱酸性古細菌 Picrophilus torridus のプロテオーム解析」。Proteomics。11 ( 23 ) : 4559–4568。doi : 10.1002 /pmic.201000829。PMID 22114103。S2CID 25035919。

外部リンク

BacDive の Picrophilus torridus の標準株 - 細菌多様性メタデータ

[International_Journal_of_Systematic_Bacteriology_-_July_1996_-_Picrophilus_oshimae_and_Picrophilus_tomdus_fam._nov.,_gen._nov.,_sp._nov.,_Two_Species_of_Hyperacidophilic,_Thermophilic,_Heterotrophic,_Aerobic_Archae-1] Schleper、Pühler、Klenk、Zillig (1996 年 7 月)。「Picrophilus oshimae および Picrophilus tomdus 科の新属新種、新属新種、新種、超好酸性、好熱性、従属栄養性、好気性古細菌の 2 種」。International Journal of Systematic Bacteriology。46 (3)。国際微生物学会連合 : 814–816。doi : 10.1099/ 00207713-46-3-814。ISSN 1466-5034。OCLC 807119723 。

[Protein_Adaptation_in_Extremophiles_-_chapter_V_-_Thermoacidophiles_and_their_Protein_Adaptation_to_Low_pH_and_High_Temperatures_-_Antranikian_in_Siddiqui_and_Thomas_(eds)-2] ^ Siddiqui、Thomas編 (2008)。「好熱酸性菌と低 pHおよび高温へのタンパク質適応」極限環境細菌におけるタンパク質適応。Nova Publishers。ISBN 9781604560190. 2013年10月31日閲覧。

[3] Angelov, A.; Liebl, W. (2006-10-20). 「Picrophilus torridus およびその他の好熱好酸性古細菌のゲノム解析に基づく極度の好熱好酸性に関する考察」Journal of Biotechnology . 原核生物ゲノム研究の側面. 126 (1): 3–10. doi :10.1016/j.jbiotec.2006.02.017. ISSN 0168-1656. PMID 16621083.

[4] ^ Schepers, B.; Thiemann, V .; Antranikian, G. (2006 年 6 月)。「大腸菌で異種発現した好熱好酸性古細菌 Picrophilus torridus 由来の新規グルコアミラーゼの特性評価」。エンジニアリングインライフサイエンス。6 (3): 311–317。doi : 10.1002 /elsc.200620131。ISSN 1618-0240。S2CID 85128507 。